[发明专利]鉴定药物作用途径的方法

摘要

本发明提供了几种方法,用于通过如下步骤鉴定和表现药物对细胞作用的生物途径(ⅰ)测定对于细胞分级暴露于所研究药物细胞成分的应答;(ⅱ)测定对于该细胞一种或几种生物途径中扰动的细胞成分的应答,以及(ⅲ)定标一组所测定的途径应答,以便根据客观的测定最佳地拟合所测定的药物应答。在另一些实施方案中,本发明还对所鉴定的表现提供显著性检验,并证实所鉴定的途径是真实的药物作用途径。在不同的实施方案中,可通过测定基因表达,蛋白质丰度,蛋白质活性,或者这些测定量的组合来确定对细胞的作用。在另一些不同的实施方案中,通过使用可滴定的表达系统,使用转染系统,改变途径RNAs的丰度,改变途径蛋白质的丰度,或者改变途径蛋白质的活性,可以形成对细胞内生物途径的扰动。本发明还提供了根据鉴定药物作用生物途径的方法用于药物开发的方法,并且提供了一些方法,用于表现参与环境改变对细胞作用的生物途径。

主权项

1.一种鉴定参与一种细胞类型中药物作用的生物途径的方法，包括：(a)提供该药物在此细胞类型中的药物应答，该药物应答已通过包括在对该药物的多种暴露水平下测定此细胞类型中多种细胞成分的方法获得；(b)将一种模式药物应答表示为该细胞类型中一种或几种生物途径应答的组合，其中该细胞类型中的生物途径应答是一种方法的结果，此方法包括在对该生物途径的多种扰动水平测定所述细胞类型细胞中生物途径的细胞成分，并且其中该组合中所述一种或几种生物途径应答的每一种须经单独的定标转换；以及(c)确定该一种或几种生物途径应答的最佳定标转换，它可使所提供的药物应答与所述模式药物应答之间差异的目标函数值最小化，其中该一种或几种生物途径应答的组合，在最佳定标转换条件下可鉴定参与该细胞类型中此药物作用的生物途径。