[发明专利]一种新的多肽——气泡蛋白13和编码这种多肽的多核苷酸无效

专利信息
申请号: 00116676.X 申请日: 2000-06-21
公开(公告)号: CN1329022A 公开(公告)日: 2002-01-02
发明(设计)人: 毛裕民;谢毅 申请(专利权)人: 上海博德基因开发有限公司
主分类号: C07K14/00 分类号: C07K14/00;C07K14/435;C07K16/00;C07K16/18;C07H21/00;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C12P21/00;C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/16;A61K38/17;A61K31/7088;A61K39/395;A61P35/00;A61P7/00;A61P37/00;A61P31/00;A61P31/18
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摘要:
搜索关键词: 一种 多肽 气泡 蛋白 13 编码 这种 多核苷酸
【说明书】:

发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽——气泡蛋白13,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

在几种蓝细菌和古细菌微生物中发现有一种小的,充满气体的空泡蛋白质结构。这种蛋白质结构使细菌定位于合适的生长深度。气泡是圆柱形的空管,在末端被一个空的,圆锥形的帽所包围。圆锥帽和中心空管结构都是由4-6纳米宽的核糖组成,这些核糖贯穿于结构长轴的右角。空泡可能由两个不同的蛋白质组成:GVPa和GVPc。

GVPc是一个小的气泡次级组成成分,可能位于外部表面。在结构上,蓝细菌GVPc由四个或五个串联的重复子组成,这些重复子在N末端和C末端分别有18和1O个氨基酸残基的侧翼序列。

在此,我们确定了一个重复结构域的特征模式,该模式从第11氨基酸残基开始至第33个氨基酸残基结束。该特征模式是:F-L-x(2)-T-x(3)-R-x(3)-A-x(2)-Q-x(3)-L-x(2)-F。

气泡蛋白结构不但能为细菌提供浮力,还能为细胞提供充足的光线和氧气。该蛋白质结构对细菌的生长发育起重要作用。

通过基因芯片的分析发现,在膀胱粘膜、PMA+的Ecv304细胞株、LPS+的Ecv304细胞株胸腺、正常成纤维细胞1024NC、Fibroblast,生长因子刺激,1024NT、疤痕成fc生长因子刺激,1013HT、疤痕成fc未用生长因子刺激,1013HC、膀胱癌建株细胞EJ、膀胱癌旁、膀胱癌、肝癌、肝癌细胞株、胎皮、脾脏、前列腺癌、空肠腺癌、贲门癌中,本发明的多肽的表达谱与气泡蛋白的表达谱非常近似,因此二者功能也可能类似。本发明被命名为气泡蛋白13。

由于如上所述气泡蛋白13蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用,而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白,因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的气泡蛋白13蛋白,特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新气泡蛋白13蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾1病诊断和/或治疗药的基础,因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——气泡蛋白13以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码气泡蛋白13的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码气泡蛋白13的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产气泡蛋白13的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——气泡蛋白13的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——气泡蛋白13的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。

本发明的另一个目的是提供诊断治疗与气泡蛋白13异常相关的疾病的方法。

本发明涉及一种分离的多肽,该多肽是人源的,它包含:具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO:2氨基酸序列的多肽。

本发明还涉及一种分离的多核苷酸,它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体:

(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸;

(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸;

(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70%相同性的多核苷酸。

更佳地,该多核苷酸的序列是选自下组的一种:(a)具有SEQ ID NO:1中120-584位的序列;和(b)具有SEQ ID NO:1中1-1730位的序列。

本发明另外涉及一种含有本发明多核苷酸的载体,特别是表达载体;一种用该载体遗传工程化的宿主细胞,包括转化、转导或转染的宿主细胞;一种包括培养所述宿主细胞和回收表达产物的制备本发明多肽的方法。

本发明还涉及一种能与本发明多肽特异性结合的抗体。

本发明还涉及一种筛选的模拟、激活、拮抗或抑制气泡蛋白13蛋白活性的化合物的方法,其包括利用本发明的多肽。本发明还涉及用该方法获得的化合物。

本发明还涉及一种体外检测与气泡蛋白13蛋白异常表达相关的疾病或疾病易感性的方法,包括检测生物样品中所述多肽或其编码多核苷酸序列中的突变,或者检测生物样品中本发明多肽的量或生物活性。

本发明也涉及一种药物组合物,它含有本发明多肽或其模拟物、激活剂、拮抗剂或抑制剂以及药学上可接受的载体。

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