[发明专利]一种新的多肽——剪接因子Prp4蛋白9.46和编码这种多肽的多核苷酸

说明书

本发明属于生物技术领域，具体地说，本发明描述了一种新的多肽——剪接因子Prp4蛋白9.46，以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

接发生于大的RNA多组分复合体上，RNA多组分复合体包含四个小分子的核糖核蛋白颗粒(snRNPs)和另外的蛋白因子组成。参与剪接反应的snRNA有U1、U2、U4/U6、U5等几种，剪接反应的过程是在U4/U6snRNP和U5snRNP存在下，U1snRNP与5’剪接点结合，使其磷酸基转移到U2snRNP结合的分枝点上突起的A的2’-OH上，形成带2’，5’-磷酸二酯键的转酯化合物(称套索RNA结构)，这是剪接的第一步。然后进行第二步转酯反应，使下游外显子5’-磷酸基转移到上游外显子3’-OH上，结果得到剪接产物——成熟mRNA和来自内含子的套索RNA。

酵母剪接因子Prp4蛋白是U4/U6snRNP和U4/U6-U5snRNPs的特殊组分，它在剪接反应的第一步之前短暂地与剪接体相连。用免疫沉淀反应显示这一过程发现，剪接因子Prp4通过特定结构域与另一种U4/U6snRNP酵母剪接因子Prp3相互作用，剪接因子Prp4的C末端的突变表明这一区域是与Prp3相互作用的基本结构域，这种突变对于细胞是致命的。同时发现，剪接因子Prp4的C末端相当于G蛋白的β亚基。不同的方法显示，Prp4蛋白是通过其连接在推进器β链上的长的可变噜噗形成巨大的平坦的表面，这一平面也是产生RNA蛋白复合体的脚手架。(J Mol Biol 1998 Dec 4；284(3)：673-87)

剪接因子Prp4也广泛存在于真核细胞中，其突变或表达异常将导致细胞转录过程的异常，进而影响遗传信息的传递，影响蛋白的正确翻译，并产生一些相关的物质代谢紊乱、蛋白功能异常及相关组织的肿瘤等病理过程。

通过基因芯片的分析发现，在膀胱粘膜、PMA+的Ecv304细胞株、LPS+的Ecv304细胞株胸腺、正常成纤维细胞1024NC、Fibroblast，生长因子刺激，1024NT、疤痕成fc生长因子刺激，1013HT、疤痕成fc未用生长因子刺激，1013HC、膀胱癌建株细胞EJ、膀胱癌旁、膀胱癌、肝癌、肝癌细胞株、胎皮、脾脏、前列腺癌、空肠腺癌、贲门癌中，本发明的多肽的表达谱与剪接因子Prp4蛋白的表达谱非常近似，因此二者功能也可能类似。本发明被命名为剪接因子Prp4蛋白9.46。

由于如上所述剪接因子Prp4蛋白9.46蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用，而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白，因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的剪接因子Prp4蛋白9.46蛋白，特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新剪接因子Prp4蛋白9.46蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾1病诊断和/或治疗药的基础，因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——剪接因子Prp4蛋白9.46以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码剪接因子Prp4蛋白9.46的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码剪接因子Prp4蛋白9.46的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产剪接因子Prp4蛋白9.46的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——剪接因子Prp4蛋白9.46的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——剪接因子Prp4蛋白9.46的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。

本发明的另一个目的是提供诊断治疗与剪接因子Prp4蛋白9.46异常相关的疾病的方法。

本发明涉及一种分离的多肽，该多肽是人源的，它包含：具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地，该多肽是具有SEQ ID NO：2氨基酸序列的多肽。

本发明还涉及一种分离的多核苷酸，它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体：

(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸；

(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸；

(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70％相同性的多核苷酸。