[发明专利]一种新的多肽——skm－Bop蛋白39和编码这种多肽的多核苷酸

说明书

本发明属于生物技术领域，具体地说，本发明描述了一种新的多肽——skm-Bop蛋白39，以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

在CD8b基因的转录起始位点之前的195个核甘酸里有2个具有启动子作用的基因(Hwang，I.et al.，1995，Immunogeneteics，42：353)。一个与CD8b基因的转录方向相同，另一个相反并且非常靠近CD8b基因。这个相反的基因就是Bop基因。

Bop基因的前体mRNA有两种剪接形式。一种mRNA编码有456个氨基酸的蛋白质(t-BOP)，另一种mRNA编码带有一个短的开放阅读框57个氨基酸的蛋白质(t-ncb)。这两种蛋白质的cDNA的5端是一致的。在人类心肌以及小鼠心脏和骨骼肌中发现大约3kb的与Bop基因同源的新基因转录本，这个新基因就叫skm-Bop基因。skm-Bop基因mRNA又有两种剪接形式，一种叫skm-Bop1，另一种叫skm-Bop2。skm-Bop1蛋白包含490个氨基酸，其N端的445个氨基酸与t-BOP几乎是一致的，在此区域内只有t-Bop的61、126、和310位置以及其他几个氨基酸是不同的。skm-Bop2蛋白包含477个氨基酸，缺少skm-Bop1中的221-233位置的氨基酸。

skm-Bop蛋白有锌指结构域。锌指结构域在蛋白质与核甘酸结合、蛋白质与蛋白质结合、蛋白质与酶结合中起着至关重要的作用(Coleman，J.etal.，1992，Annu.Rev.Biochem.61：897)。

skm-Bop的cDNA5端非编码区大约1451个核甘酸长，后面紧跟一个编码45个氨基酸的序列。这45个氨基酸由一个外显子编码。这个外显子同时也编码t-BOP的N端序列。skm-Bop蛋白主要在人的心肌和骨骼肌以及肾脏中表达。所以，如果该蛋白表达异常，则会导致这些器官的相关病变。

本发明人的多肽与skm-Bop蛋白在蛋白质水平上有29％的一致性和54％的同源性，并具有相似的结构，故命名为skm-Bop52，同时推测其有相似的生物学功能。

由于如上所述skm-Bop蛋白39蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用，而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白，因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的skm-Bop蛋白39蛋白，特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新skm-Bop蛋白39蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾病诊断和/或治疗药的基础，因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——skm-Bop蛋白39以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码skm-Bop蛋白39的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码skm-Bop蛋白39的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产skm-Bop蛋白39的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——skm-Bop蛋白39的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——skm-Bop蛋白39的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。

本发明的另一个目的是提供诊断治疗与skm-Bop蛋白39异常相关的疾病的方法。

本发明涉及一种分离的多肽，该多肽是人源的，它包含：具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地，该多肽是具有SEQ ID NO：2氨基酸序列的多肽。

本发明还涉及一种分离的多核苷酸，它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体：

(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸；

(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸；

(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70％相同性的多核苷酸。

更佳地，该多核苷酸的序列是选自下组的一种：(a)具有SEQ ID NO：1中192-1241位的序列；和(b)具有SEQ ID NO：1中1-1621位的序列。

本发明另外涉及一种含有本发明多核苷酸的载体，特别是表达载体；一种用该载体遗传工程化的宿主细胞，包括转化、转导或转染的宿主细胞；一种包括培养所述宿主细胞和回收表达产物的制备本发明多肽的方法。

本发明还涉及一种能与本发明多肽特异性结合的抗体。