[发明专利]一种新的多肽——气泡蛋白gvpA－gvpD－41和编码这种多肽的多核苷酸

说明书

本发明属于生物技术领域，具体地说，本发明描述了一种新的多肽——气泡蛋白gvpA-gvpD-41，以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

在几种蓝细菌和古细菌微生物中发现有一种小的，充满气体的气泡蛋白质结构。这种蛋白质结构使细菌定位于合适的生长深度。气泡是圆柱形的空管，在末端被一个空的，圆锥形的帽所包围。圆锥帽和中心空管结构都是由4-6纳米宽的核糖组成，这些核糖贯穿于结构长轴的右角。气泡可能由两个不同的蛋白质组成：gvpA和gvpD。

GvpA，是一个大约70个氨基酸的小蛋白，是气泡的主要组成成分，并且是气泡结构的本质核心。gvpA序列是非常保守的。

GvpJ和gvpM两种蛋白质是由成束基因编码的，同时有时气泡合成所必须的，它们在进化上与gvpA是相关的。尽管这两种蛋白质对决定气泡的形状是非常重要的，但它们的具体功能还不是很清楚。

GvpA/J的N末端结构域也与gvpA相关。

GvpD和gvpE两个气泡蛋白都有两个开放阅读框，该开放阅读框的转录方向与gvpA的恰好相反。GvpD和gvpE基因可能以操纵子的形式存在。GvpA-gvpD基因间的区域包括一个倒置的重复序列，5’-CGTACTT-3’，该序列位于gvpD转录起始位点的中心上游区域，具有调节作用。GvpD与DNA的结合位点位于N末端，结合序列是L-I-N-G-A-P-G-T-G-K-T，该序列与腺甘酸激酶相应序列(L-I-G-P-P-G-A-G-K-G)以及胸腺嘧啶激酶的相应序列(L-I-E-G-L-D-R-T-G-K-D)相似[Pinkham，J.L.and Plantt，T.1983.Nucleic Acids Res.，11，3531-3545]。GvpD蛋白的功能可能是集合气泡蛋白以及结构和调节作用。有趣的是，Gyp蛋白基因能在质粒和染色体以及不同系的细菌之间跳跃，这一特征引起了生物学家的广泛注意[Jeff   Rey G.Jones，Neil R.Hackett.John T.Halladay et al.，Nucleic AcidsRes.17(19)，7785-7793]。

气泡蛋白结构不但能为细菌提供浮力，还能为细胞提供充足的光线和氧气。该蛋白质结构对细菌的生长发育起重要作用。

本发明人的多肽在蛋白质水平上与气泡蛋白gvpA-gvpD有34％的相同性和56％的相似性，具有相似的结构特征，同属于气泡蛋白gvpA-gvpD蛋白家族，故命名为气泡蛋白gvpA-gvpD-41，同时推测其具有相似的生物学功能。

由于如上所述气泡蛋白gvpA-gvpD-41蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用，而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白，因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的气泡蛋白gvpA-gvpD-41蛋白，特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新气泡蛋白gvpA-gvpD-41蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾病诊断和/或治疗药的基础，因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——气泡蛋白gvpA-gvpD-41以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码气泡蛋白gvpA-gvpD-41的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码气泡蛋白gvpA-gvpD-41的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产气泡蛋白gvpA-gvpD-41的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——气泡蛋白gvpA-gvpD-41的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——气泡蛋白gvpA-gvpD-41的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。

本发明的另一个目的是提供诊断治疗与气泡蛋白gvpA-gvpD-41异常相关的疾病的方法。

本发明涉及一种分离的多肽，该多肽是人源的，它包含：具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地，该多肽是具有SEQ ID NO：2氨基酸序列的多肽。

本发明还涉及一种分离的多核苷酸，它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体：

(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸；

(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸；

(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70％相同性的多核苷酸。