[发明专利]一种新的多肽——人S4核糖体蛋白13.97和编码这种多肽的多核苷酸无效
申请号: | 00117077.5 | 申请日: | 2000-07-07 |
公开(公告)号: | CN1333268A | 公开(公告)日: | 2002-01-30 |
发明(设计)人: | 毛裕民;谢毅 | 申请(专利权)人: | 上海博德基因开发有限公司 |
主分类号: | C07K14/435 | 分类号: | C07K14/435;C07K14/00;C07K16/18;C07K16/00;C07H21/00;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C12P21/00;C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/17;A61K38/16;A61K31/7088;A61K39/395;A61P35/00;A61P7/00;A61P37/00;A61P31/00;A61P31/18 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多肽 s4 核糖体 蛋白 13.97 编码 这种 多核苷酸 | ||
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽——人S4核糖体蛋白13.97,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。
核糖体是合成蛋白质的细胞器,其唯一功能是按照mRNA的指令由氨基酸合成多肽链,它被称为核糖核蛋白体,简称为核蛋白体或核糖体。核糖体几乎存在于一切细胞内,无论原核还是真核细胞,均有大量的核糖体存在。核糖体是一种颗粒状结构,没有膜包裹,其直径为25nm,主要成分为蛋白质和RNA,核糖体RNA称为rRNA,蛋白质含量约占40%,RNA约占60%。蛋白质分子主要分布在核糖体的表面,而rRNA则位于内部,两者靠非共价键结合在一起。(细胞生物学翟中和高等教育出版社pp122-129)核糖体的功能研究将焦点放到了核糖体RNA上,有很多rRNA功能域决定着核糖体的不同功能。(Annu Rev Biochem 1991;60 191-227)
S4是最重要的核糖体蛋白之一,它是原核生物小亚单位30S的一种结合蛋白,同样它在真核生物中也有人S4核糖体蛋白,行使相同的生物学功能。在细菌和叶绿体中均有S4的表达,在酵母、高等植物、动物体内也发现有S4及其人S4核糖体蛋白。
对核糖体蛋白S4晶体研究(由于S4的N末端有41个不易结晶的氨基酸,因此切除此41个氨基酸残基的剩余部分的结晶,称为S4delta-41)的结果表明,S4delta-41有两个功能域,功能域1都是alfa螺旋结构,功能域2含有5个平行的beta折叠结构和3个alfa螺旋结构。功能域2是插入在功能域1之中的,功能域2还与真核生物转录因子的ETS功能域同源。从结构上看,S4的二级结构的序列为α1-α2-α3-α4-α5-β1-β2-β3-α6-β4-β5-α7,其中功能域1全是α螺旋(α1-α2-α3-α7),功能域2是α4-α5-β1-β2-β3-α6-β4-β5,并插入在功能域1之中。此外,具体的结构也已经得到阐明,有文献可供参考。(The EMBOJournal Vol 17 No16 pp4545-4558,1998)
S4是核糖体的重要组分,原核生物的S4可结合于16S rRNA,从而影响翻译的准确性、16S rRNA的高级结构等等。(Nowotny and Nierhaus,1988;Allenand Noller,1989)根据研究,在缺少其他蛋白的情况下,S4也能与16SrRNA相互作用。
S4也是一种RNA结合蛋白,与其他核糖体蛋白一样,原核生物的S4核糖体蛋白可以结合于编码自身的mRNA(α操纵子mRNA)结合从而调控自身的表达,由于α操纵子mRNA除编码S4外,还编码S11,S13和L17,所以S4可以通过结合于多聚顺反子mRNA从而调控自身和其他一些核糖体蛋白的表达。(Dean andNomura,1980;Thomas et al.,1987)(The EMBO Journal Vol 17 No16pp4559-4571,1998)
S4与rRNA和mRNA的结合位点的氨基酸序列没有特别的同源性,但这两种RNA的结构相似性也未得到证明,此方面还有待进一步研究。
目前的实验的结果还表明,S4在30S的装配过程、保持翻译的真实性中起作用。
综上所述,S4核糖体蛋白的功能如下:(1)在原核生物中S4可以结合于16SrRNA,从而影响翻译的准确性、16S rRNA的高级结构等等,推测S4在真核生物细胞内也有同样功能;(2)S4也可结合于编码自身的mRNA,从而调控自身和其他一些核糖体蛋白的表达;(3)S4还可以促进核糖体的小亚基的装配,在小亚基的装配过程、保持翻译的真实性中起作用;(4)S4还与真核生物转录因子的ETS功能域同源,因此被推测可以调控真核生物的转录过程。
通过基因芯片的分析发现,在膀胱粘膜、PMA+的Ecv304细胞株、LPS+的Ecv304细胞株胸腺、正常成纤维细胞1024NC、Fibroblast,生长因子刺激,1024NT、疤痕成fc生长因子刺激,1013HT、疤痕成fc未用生长因子刺激,1013HC、膀胱癌建株细胞EJ、膀胱癌旁、膀胱癌、肝癌、肝癌细胞株、胎皮、脾脏、前列腺癌、空肠腺癌、贲门癌中,本发明的多肽的表达谱与人S4核糖体蛋白的表达谱非常近似,因此二者功能也可能类似。本发明被命名为人S4核糖体蛋白13.97。
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