[发明专利]一种新的多肽——人反转录相关因子11.88和编码这种多肽的多核苷酸无效
申请号: | 00127533.X | 申请日: | 2000-11-24 |
公开(公告)号: | CN1355203A | 公开(公告)日: | 2002-06-26 |
发明(设计)人: | 毛裕民;谢毅 | 申请(专利权)人: | 复旦大学;上海博道基因技术有限公司 |
主分类号: | C07K14/435 | 分类号: | C07K14/435;C07K14/00;C07K16/18;C07K16/00;C07H21/00;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C12P21/00;C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/16;A61K38/17;A61K31/7088;A61K39/395;A61P35/00;A61P7/00;A61P37/00;A61P31/00;A61P31/18 |
代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 | 代理人: | 陆飞,姚静芳 |
地址: | 20043*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多肽 转录 相关 因子 11.88 编码 这种 多核苷酸 | ||
本发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽——人反转录相关因子11.88,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。
灵长类动物和啮齿动物几基因组中包含一个家族,有高度重复的、长的并且交替出现的L1家族,这个家族的序列特征是在3’-末端有一段富含A的序列,5’-末端是平末端结构,有一个较长的开放阅读框(ORFs)存在。L1家族成员存在于不同类型的细胞中,其中包括多功能胚胎细胞,这就证明了L1家族起源于同一种序列编码蛋白,通过一个RNA介导的过程散布到基因组中。L1家族参与反转录过程,反转录起始于3’-末端,终止于互补DNA插入物引起的重叠位点,它能够通过转录转换成cDNA,然后经过类似于假基因加工的过程插入到染色体中。
在人类的基因组中,L1因子存在于染色体1q的LRE2上。在结构上,L1因子没有很长的末端重复序列,其3’-末端的多聚A尾巴比较特殊,而且它并不是在每个L1因子上都固定不变。L1因子的增殖过程包括转录、反转录和再整合到基因组上的一个新的位点。L1因子的5’末端大多是平端结构,区别于一般的粘性末端结构,但是并不影响其转录整合过程。5’末端的非翻译区域(UTR)含有一个内在的促进子,对于整个逆转录过程的速度进行调节和控制。LRE2位点含有两个完整的开放阅读框(ORF1框和ORF2框),其中的ORF1框编码一个大约40Kd的胚胎癌细胞蛋白,ORF2框与逆转录酶和其它逆转录酶病毒蛋白有序列上的相似性,能够介导逆转录过程的进行。采用实验手段去除L1因子最前面的32Bp,得到的产物只能显示出正常转录效率的20%。
L1家族序列含有一个开放阅读框,与某些病毒的依赖RNA的DNA聚合酶有相似之处,更进一步证明了L1家族或者它的祖先与反转录酶有关,它编码的蛋白实际上是一种类反转录酶。
通过基因芯片的分析发现,在正常脑、肝癌、肌肉、胎脑、胎肾,胎肺、胎肝、甲状腺、胸腺、成人肝、肺、胶质瘤中,本发明的多肽的表达谱与人反转录相关因子的表达谱非常近似,因此二者功能也可能类似。本发明被命名为人反转录相关因子11.88。
由于如上所述人反转录相关因子11.88蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用,而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白,因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的人反转录相关因子11.88蛋白,特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新人反转录相关因子11.88蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾1病诊断和/或治疗药的基础,因此分离其编码DNA是非常重要的。
本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——人反转录相关因子11.88以及其片段、类似物和衍生物。
本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。
本发明的另一个目的是提供含有编码人反转录相关因子11.88的多核苷酸的重组载体。
本发明的另一个目的是提供含有编码人反转录相关因子11.88的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。
本发明的另一个目的是提供生产人反转录相关因子11.88的方法。
本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——人反转录相关因子11.88的抗体。
本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——人反转录相关因子11.88的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。
本发明的另一个目的是提供诊断治疗与人反转录相关因子11.88异常相关的疾病的方法。
本发明涉及一种分离的多肽,该多肽是人源的,它包含:具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO:2氨基酸序列的多肽。
本发明还涉及一种分离的多核苷酸,它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体:
(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸;
(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸;
(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70%相同性的多核苷酸。
更佳地,该多核苷酸的序列是选自下组的一种:(a)具有SEQ ID NO:1中462-788位的序列;和(b)具有SEQ ID NO:1中1-2001位的序列。
本发明另外涉及一种含有本发明多核苷酸的载体,特别是表达载体;一种用该载体遗传工程化的宿主细胞,包括转化、转导或转染的宿主细胞;一种包括培养所述宿主细胞和回收表达产物的制备本发明多肽的方法。
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