[发明专利]新型转录因子BP1

说明书

本申请要求于1999年8月13日申请的第60/148,940号美国临时申请的优先权。该临时申请通过引用结合到本文中。

                 关于联邦资助研究的声明

本文所述的研究得到NIH资助号R01DK53533的支持。美国政府在本发明中享有一定的权利。

                    技术领域

本发明涉及编码转录因子BP1的DNA、含有所述DNA的载体和含有所述DNA的宿主细胞。本发明也涉及编码BP1的DNA的反义DNA或RNA、用于通过给予有效量BP1治疗镰状细胞贫血的方法、以及用于筛选急性髓细胞白血病、急性淋巴细胞白血病和乳腺癌的方法。

(在所述临时申请中，转录因子BP1有时称为“BP1/Dlx9”或“BP1/D1x9”。在本文中，为了更加明确，将该转录因子简称为“BP1”。)

β-珠蛋白簇中的珠蛋白基因的表达局限于红细胞生成细胞，在胚胎发育(ε)、胎儿发育(Gγ和Aγ)和成体发育(δ和β)期间表达5种不同的基因。珠蛋白基因的转录激活不仅由于转录激活蛋白与待激活基因的启动子结合而发生，也由于位于β-珠蛋白簇上游6-18kb的调节元件-基因座控制区(LCR)而发生(参见例如Berg，P.E.和A.N.Schechter.1992.血红蛋白疾病的分子遗传学。载于T.Friedmann(编著)，Molecular Genetic Medicine.Academic Press，San Diego.；Forrester，W.C.，C.Thompson，J.T.Elder和Groudine，M.1986.人类β-珠蛋白基因簇中发育稳定的染色质结构。Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83：1359-1363；和Tuan，D.，W.Soloman，Q.Li和I.M.London.1985.人类类红细胞中的“β-样珠蛋白”基因结构域.Proc。Natl.Acad.Sci.USA 82：6384-6388。)。个体发育期间β-珠蛋白簇基因的顺序激活必定遇到特定发育阶段期间无活性的珠蛋白基因的阻抑。阻抑由于阻抑蛋白与启动子/上游DNA的结合所致，在成体β-珠蛋白基因的情况下，也可能由于缺乏LCR的激活作用所致(参见例如Crossley，M.和S.H.Orkin.1993.β-珠蛋白基因座的调节。Curr.Opinion Gen.Dev.3：232-237。)。虽然对于与β-珠蛋白基因附近的DNA序列结合的转录激活蛋白的了解相当多，但对于阻抑其转录的蛋白质知之甚少。

如以下所讨论的，已经表明BP1与β-珠蛋白基因上游的两个沉默子DNA序列结合，因此有强有力的证据表明，BP1蛋白是一种β-珠蛋白基因的阻抑蛋白。本发明提供编码BP1的DNA序列、使用得自所述DNA序列知识的信息筛选疾病例如乳腺癌、急性髓细胞白血病和急性淋巴细胞白血病的方法。已经发现所述DNA序列与其它两种人类基因DLX4和DLX7密切相关，描述于Quinn，L.M.，B.V.Johnson，J.Nicholl，G.R.Sutherland和B.Kalionis.1997.从人类胎盘中分离和鉴定包括Distal-less家族新成员DLX4在内的同源框基因。Gene 187：55-61和Nakamura S，Stock，DW，Wydner，KL，Bollekens JA，Takeshita K，Nagai BM，Chiba，Kitamura T，Freeland TM，Zhao Z，Minowada J，Lawrence JB，Weiss KB和Ruddle FH.一种新的哺乳动物Distal-less基因Dlx-7的基因组分析。Genomics 1996；38：314-324。

许多类型癌症的存活率与早期检测和治疗相关。此外，监测进行之中的癌症治疗有助于确定有效性。因此，一直需要可靠的癌细胞筛选方法。一个筛选方法是检测和监测与正常细胞相比特定类型癌细胞中过量表达或表达不足的基因的表达。检测技术和具体标记已经公开于例如以下美国专利中：Smith等的美国专利第5,776,683号、Pardee等的美国专利第5,965,409号、Cole等的美国专利第6,037,129号、Holt等的美国专利第5,677,125号、Watson等的美国专利第6,004,756号、Mulshine等的美国专利第5,994,062号、Zon等的美国专利第5,700,927号和Rio等的美国专利第5,981,218号，上述专利通过引用结合到本文中。