[发明专利]一种新的多肽——锌指蛋白11.88和编码这种多肽的多核苷酸无效

专利信息
申请号: 01105130.2 申请日: 2001-01-10
公开(公告)号: CN1364770A 公开(公告)日: 2002-08-21
发明(设计)人: 毛裕民;谢毅 申请(专利权)人: 上海博德基因开发有限公司
主分类号: C07K14/47 分类号: C07K14/47;C07K16/18;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C07H21/00;C12P21/02;G01N33/68;C12Q1/68;A61K38/17;A61K31/7088;A61P35/00;A61P7/00;A61P31/18;A61P31/00;A61P37/02
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摘要:
搜索关键词: 一种 多肽 蛋白 11.88 编码 这种 多核苷酸
【说明书】:

发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽——锌指蛋白11.88,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

真核基因的转录调控对于基因的正常表达及发挥生物学功能是十分重要的,通常由转录调控因子来完成这一过程。转录调控因子在生物体内参与决定基因在何种组织及何种发育阶段开始转录,编码这类蛋白的基因如发生突变,不但该基因自身不能正常表达,而且受其调节的许多基因也不能正常的进行转录与表达。转录因子对基因表达的调控主要通过转录因子与特定的DNA序列结合、转录因子间的相互作用及转录因子与常规转录机构的相互作用在完成。根据结构基序的不同,已知的DNA结合蛋白有很多种类:(1)含有螺旋-转角-螺旋基序的蛋白;(2)Cys-His锌指蛋白;(3)Cys-Cys锌指蛋白;(4)Leu拉链结构蛋白等等。

锌指蛋白是一种DNA结合蛋白,最早在非洲爪蟾RNA聚合酶III介导的5SrRNA基因转录因子TF III A蛋白的氨基酸序列中发现。此后发现锌指蛋白在不同生物的各种组织中均有表达,这些组织包括造血细胞、脑、神经系统、表皮组织、各种与分泌吸收相关的组织及与肿瘤和无限增殖细胞系相关的组织等。据估计在人类基因组上锌指蛋白基因超过了1%(Bellefroid et al.,1989;Pellegrinoand Berg,1991)。

GATA家族是一个转录调控因子家族,它可以被认为属于一种锌指蛋白,它是一种Cys-Cys锌指蛋白,其中,Zn2+与四个半胱氨酸残基形成配位键,这一结构域对于GATA转录因子蛋白结合DNA是必需的。GATA转录因子蛋白与DNA的结合依赖于DNA上的一段同样的序列:(A/T)GATA(A/G),GATA转录因子蛋白可以调控很多基因的表达。

这个家族的成员包括如下:GATA-1,GATA-2,GATA-3,GATA-4等等。

几乎所有生物GATA家族的成员都有一对高度类似的锌指结构,其序列特征是:Cys-x2-Cys-x17-Cys-x2-Cys。进一步的结构研究发现,GATA家族成员都含有的是这样一段高度保守的结构域:C-x-[DN]-C-x(4,5)-[ST]-x(2)-W-[HR]-[RK]-x(3)-[GN]-x(3,4)-C-N-[AS]-C,其中,四个C所代表的半胱氨酸残基是锌指结构的特征配基。这一结构的高度性证明其对于GATA转录因子蛋白发挥正常的生理学功能有着重要的意义。

GATA-1,它可以结合于红细胞中表达的球蛋白基因以及其他一些基因的GATA区域,它对于红细胞的发育和其中基因的转录调控有重要作用;GATA-2,调控内皮细胞中endothelin-1基因的表达;GATA-3,可以结合于T细胞受体的alpha和delta基因的增强子,其到调控功能;GATA-4,在内皮起源的组织和心脏组织中表达。(Trainor C.D.,Evans T.,Felsenfeld G.,Boguski M.S.Nature343:92-96(1990));(Lee M.E.,Temizer D.T.,Clifford J.A.,QuertermousT.J.Biol.Chem.266:16188-16192(1991));(Ho I.-C.,Vorhees P.,MarinN.,Oakley B.K.,Tsai S.-F.,Orkin S.H.,Liden J.M.EMBO J.10:1187-1192(1991));(Spieth J.,Shim Y.H.,Lea K.,Conrad R.,Blumenthal T.Mol.Cell.Biol.11:4651-4659(1991))

当然,对人GATA转录因子蛋白的结构和功能的研究还有待进一步开展,具体的内容请参阅相关文献。(Molecular And Cellular Biology,Sep 19914651-4659)

综上所述,人GATA转录因子蛋白对于很多基因的表达调控有着重要的意义,在人的生命活动过程中起着极其重要的作用。

通过基因芯片的分析发现,在正常脑、肝癌、肌肉、胎脑、胎肾,胎肺、胎肝、甲状腺、胸腺、成人肝、肺、胶质瘤中,本发明的多肽的表达谱与锌指蛋白的表达谱非常近似,因此二者功能也可能类似。本发明被命名为锌指蛋白11.88。

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