[发明专利]一种多肽——锌指蛋白-56.87和编码这种多肽的多核苷酸无效

专利信息
申请号: 01105926.5 申请日: 2001-04-10
公开(公告)号: CN1380329A 公开(公告)日: 2002-11-20
发明(设计)人: 毛裕民;谢毅 申请(专利权)人: 上海博德基因开发有限公司
主分类号: C07K14/47 分类号: C07K14/47;C07K16/18;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C07H21/00;C12P21/02;G01N33/68;C12Q1/68;A61K38/17;A61K31/7088;A61P35/00;A61P7/00;A61P31/18;A61P31/00;A61P37/02
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摘要:
搜索关键词: 一种 多肽 蛋白 56.87 编码 这种 多核苷酸
【说明书】:

发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽——锌指蛋白-56.87,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

锌指蛋白是一类由锌介导的核苷酸结合蛋白,属于多基因家族中的一员,它们已被从酵母、果蝇、老鼠以及人类等多种生物体内得到分离。它们都具有28-30个氨基酸的重复结构,在特定的位置上有一段保守序列,其中某些锌指蛋白被证明是转录活性因子或者是转录调控因子。

许多真核基因的表达都要受到各种因素的限制,对于这些基因的调控可以深入到转录水平。这些转录调控因子作用的一种可能途径是通过结合到特定的DNA序列上。这些DNA与蛋白质的结合物也可能与其它通过蛋白质与蛋白质结合或DNA与蛋白质结合产生的因子相互作用以共同调节基因的表达。

根据其结构,已知的结合DNA的调控蛋白可分为二大类,第一类具有λ-噬菌体或其它原核DNA结合蛋白以及真核的具有相似功能区的蛋白中的α螺旋-转角-α螺旋的基因序列。另一类则具有一段不同的结合DNA的基因序列,即通常所说的锌指结构。这段基因序列在许多蛋白中作为多重拷贝,通常被认为是象肽结构一样围绕锌原子的折叠的手指,它们都含有一段氨基酸序列F/YXCXXCXXXFXXXXXLXXHXXXHTGEKP。除了其序列中有一段保守的残基以外,它们还具有一个α-螺旋区域[Kamal,C.,Heidi,R.和Peter,G.(1988)NucleicAcid Res 16(21):9995-10011]。

其它一些含有多个半胱氨酸的DNA结合蛋白也具有1-2个锌指结构,这些蛋白包括艾滋病基因转移蛋白、腺病毒E1A以及一些核受体。这些蛋白与含有多个锌指结构的蛋白的区别在于其缺少由DNA介导的特异DNA结合,此外,它们还缺少指环结构中的保守的苯丙氨酸和亮氨酸残基以及由C-H连接的TGEKP肽段。

所有的锌指蛋白在结构上都具有一段相似的核酸结合序列。与α螺旋-转角-α螺旋结构家族的蛋白相比较,锌指蛋白不仅能与DNA结合,而且还能与金属离子及RNA结合。此外,α螺旋-转角-α螺旋结构仅能识别很有限的一些DNA,而锌指蛋白根据其锌指结构的多少可以结合各种长度的DNA,而且,锌指结构可以比α螺旋-转角-α螺旋结构长得多。

Mkr3蛋白是一种源自鼠类的锌指蛋白,其转录产物在幼鼠胚胎及成年鼠的组织细胞中表现为多种信使RNA。这种蛋白将被广泛地用于基因的转录以及后转录的调控,类似于转录调控因子SP1及TFIIIA,也可能被用作组织细胞的特异性调控因子。

本发明的蛋白与mkr3蛋白在蛋白水平上有37%同一性及52%的相似性,且含有如上所述的锌指蛋白家族保守的序列片段。因而认为其是一种新的人锌指蛋白,命名为锌指蛋白-56.87。并与已知的锌指蛋白家族的其他成员具有相似的生物学活性,在生物体内参与调控多种蛋白的转录与表达。其突变或表达异常将导致相关蛋白的表达异常,进而引发各种相关的发育紊乱性疾病。

由于如上所述锌指蛋白-56.87蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用,而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白,因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的锌指蛋白-56.87蛋白,特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新锌指蛋白-56.87蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾病诊断和/或治疗药的基础,因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——锌指蛋白-56.87以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码锌指蛋白-56.87的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码锌指蛋白-56.87的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产锌指蛋白-56.87的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——锌指蛋白-56.87的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——锌指蛋白-56.87的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。

本发明的另一个目的是提供诊断治疗与锌指蛋白-56.87异常相关的疾病的方法。

本发明涉及一种分离的多肽,该多肽是人源的,它包含:具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO:2氨基酸序列的多肽。

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