[发明专利]使用核苷酸序列相关信息的信息处理系统

说明书

技术领域

本发明涉及一种经通信网络提供信息的信息处理系统。

背景技术

目前，正迅速确定包括人类的不同生物体的基因组核苷酸序列，在不同的数据库中积累着关于基因组核苷酸序列的信息。例如，目前正在构建一个系统，它使不同的研究机构和研究者经过诸如因特网的信息网络，利用数据库中积累的关于基因组核苷酸序列的信息。

同时，已用包含在这种关于基因组核苷酸序列的信息中的核苷酸序列进行了积极地研究，目的是遗传信息等基因组药物的发现和分析，由单核苷酸多态性表示的个人之间的差异引起了关注。通常，个人之间核苷酸序列的差异指多态性(由各物种中以1％或1％以上的频率出现的预定核苷酸差异来定义)和变异(由各物种中1％以下的预定核苷酸差异来定义)。尤其是，已知多态性是SNP(单核苷酸多态性)，其中，个人之间有一核苷酸差异；插入/缺失多态性，其中，缺失或插入几十个(有时是几千个)核苷酸中的一个；VNTR(随机重复变量数)，其中，包括2到几十个核苷酸的序列重复数作为一个单位的变化；微随体多态性(microsatellite polymorphism)(有2到4个核苷酸的重复序列)。

这种多态性有时影响例如个人之间蛋白的氨基酸序列中的差异或个人之间关于预定基因表达效果的差异。这些影响导致了例如个人之间预定疾病的发病率差异和个人之间预定医药敏感度的差异。

然而，还未建成一种系统，它通过有效利用诸如多态性的核苷酸序列相关信息中的差异来提供用于多个个人之间的每个生物体的语义信息。

在上述条件下，本发明注重构成一种系统，用于通过有效利用个人之间的核苷酸序列相关信息中的差异来处理信息，以提供用于各个人的语义信息和/或与语义信息有关的信息。

发明内容

本发明包括下述特征以实现上述目的：

1.一种用于处理关于核苷酸序列的信息的方法，包括以下步骤：

(a)接收对象和/或服务的请求信息；

(b)依照来自存储器的请求信息获得位置信息，存储器具有表示存储的核苷酸序列中位置的位置信息；和

(c)从与位置信息有关的核苷酸序列相关信息中获得相应于在上述步骤(b)中获得的位置信息的核苷酸序列相关信息，并且获得由核苷酸序列相关信息所蕴涵的语义信息和/或与该语义信息有关的信息。

2.根据权利要求1的用于处理关于核苷酸序列信息的方法，其中，语义信息和/或与上述步骤(c)中获得的语义信息有关的信息被发射给信息处理器，该处理器提供上述步骤(a)中获得的请求信息和/或语义信息和/或与上述步骤(c)中获得的语义信息有关的信息的用户。

3.根据权利要求1的用于处理关于核苷酸序列信息的方法，其中，至少还包括步骤(d)，发射在上述步骤(b)中获得的位置信息，在步骤(c)中，从与位置信息有关的核苷酸序列相关信息中接收相应于上述步骤(d)中发射的位置信息的核苷酸序列相关信息，然后，获得蕴涵接收的核苷酸序列相关信息的语义信息和/或与该语义信息有关的信息。

4.根据权利要求3的用于处理关于核苷酸序列信息的方法，其中，在上述步骤(d)中，设置相应于步骤(b)中获得的位置信息的辅助位置信息，上述步骤(b)中获得的位置信息按辅助位置信息发射，上述步骤(c)中，按照辅助位置信息接收核苷酸序列相关信息，然后，通过辅助位置信息和/或与语义信息有关的信息，获得由与位置信息有关的核苷酸序列相关信息所蕴涵的语义信息。

5.根据权利要求3的用于处理关于核苷酸序列信息的方法，其中，从存储器中提取与相应于上述步骤(d)发射的位置信息的核苷酸序列相关信息有关的语义信息，以获得由上述步骤(c)中接收的核苷酸序列相关信息所蕴涵的语义信息，存储器中分别存储有：多条位置信息；多条与每条位置信息有关的核苷酸序列相关信息；和由多条核苷酸序列相关信息中每一条所蕴涵的语义信息。

6.根据权利要求1的用于处理关于核苷酸序列信息的方法，其中，上述步骤(c)中，获得相应于步骤(b)中获得的位置信息的多条核苷酸序列相关信息，获得由多条核苷酸序列相关信息中每一条所蕴涵的语义信息和/或与该语义信息有关的信息。

7.根据权利要求1的用于处理关于核苷酸序列信息的方法，其中，至少还包括步骤(d)，接收与位置信息有关的核苷酸序列相关信息，上述步骤(c)中，利用在上述步骤(b)中接收的核苷酸序列相关信息，获得相应于步骤(b)中获得的位置信息的核苷酸序列相关信息。