[发明专利]检测DNA点突变的方法(SNP分析)和相关的装置有效

专利信息
申请号: 200480021969.1 申请日: 2004-05-28
公开(公告)号: CN101094923A 公开(公告)日: 2007-12-26
发明(设计)人: 沃尔特·冈布雷赫特;彼得·波里卡;曼弗雷德·斯坦泽尔 申请(专利权)人: 西门子公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12P19/34
代理公司: 北京市柳沈律师事务所 代理人: 巫肖南;封新琴
地址: 德国*** 国省代码: 德国;DE
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摘要:
搜索关键词: 检测 dna 突变 方法 snp 分析 相关 装置
【权利要求书】:

1.一种用于检测DNA点突变(SNP分析)的方法,其中利用待测目标DNA与在DNA芯片上位置特异性固定的捕手DNA的结合(杂交),其中进行限定的时间过程,具有以下步骤:

a)以已调整的流速将洗涤溶液导引到DNA芯片上,

b)按规定改变杂交位置上的温度,

c)温度依赖性地熔解捕手/目标DNA杂交体并通过流动的洗涤溶液将捕手/目标DNA杂交体从杂交位置上移开,

d)在预定时间间隔内将流速调整为零,

e)在当前温度下位置特异性地检测已结合的目标DNA,而对结合的目标DNA的位置特异性检测通过“未被洗掉的”洗涤溶液进行,

f)根据预定程序评估信号。

2.根据权利要求1的方法,其特征在于,多次重复步骤a)到e)。

3.根据权利要求1或2的方法,其特征在于,温度变化在于持续不断的升高。

4.根据权利要求3的方法,其特征在于,持续不断的温度升高作为时间的函数是线性的。

5.根据权利要求4的方法,其特征在于,持续不断的温度升高以带有保持时间的斜面作为时间的函数进行。

6.根据权利要求5的方法,其特征在于,在保持时间中在DNA芯片上的液流被停止。

7.根据上述任何一项权利要求的方法,其特征在于,对已结合的目标DNA的检测是以无标记(无标记物)的形式进行的。

8.根据权利要求9的方法,其特征在于,无标记检测以光学形式进行。

9.根据权利要求8的方法,其特征在于,光学检测利用DNA双链熔解期间UV吸收的内在变化。

10.根据权利要求7的方法,其特征在于,无标记检测以电学方式进行。

11.根据权利要求7的方法,其特征在于,无标记检测借助内在的鸟嘌呤氧化进行。

12.根据权利要求10的方法,其特征在于,利用电化学阻抗方法进行无标记检测。

13.根据权利要求7的方法,其特征在于,以重量测量的方式进行无标记检测。

14.根据权利要求1到5的任何一个的方法,其特征在于,在利用标记(标记物)的情况下进行已结合的目标DNA的检测。

15.根据权利要求14的方法,其特征在于,借助光学标记进行检测。

16.根据权利要求14的方法,其特征在于,借助磁性标记进行检测。

17.根据权利要求16的方法,其特征在于,借助酶标记进行检测。

18.根据权利要求17的方法,其特征在于,所述洗涤溶液含有酶底物。

19.根据权利要求18的方法,其特征在于,所述酶在所使用的温度范围是稳定的(有活性的)。

20.根据权利要求16到19的方法,其特征在于,所述酶标记催化的反应是光学可检测的。

21.根据权利要求16到19的方法,其特征在于,所述酶标记催化的反应是电化学可检测的。

22.根据权利要求21的方法,其特征在于,在电化学检测方法中涉及利用氧化还原循环进行加强的电流测量。

23.根据权利要求16到19的方法,其特征在于,检测和评估底物或产物浓度的改变。

24.根据上述任何一项权利要求的方法,其特征在于,传感器信号(检测信号)的评估和显示作为温度的函数进行。

25.根据权利要求24的方法,其特征在于,在确定的温度上进行熔解曲线的标准化。

26.根据上述任何一项权利要求的方法,其特征在于,所述评估是计算机控制的。

27.根据权利要求26的方法,其特征在于,所述评估是根据软件进行的。

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