[发明专利]钠离子通道SCN1A基因突变及基因突变检测方法和用途无效
申请号: | 200510101817.9 | 申请日: | 2005-12-05 |
公开(公告)号: | CN101148665A | 公开(公告)日: | 2008-03-26 |
发明(设计)人: | 廖卫平;石奕武;秦兵;李田;邓宇虹;刘晓蓉;邓维意;易咏红;龙跃生;苏涛 | 申请(专利权)人: | 广州医学院第二附属医院 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/68 |
代理公司: | 广州广信知识产权代理有限公司 | 代理人: | 张文雄 |
地址: | 510260广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 钠离子 通道 scn1a 基因突变 检测 方法 用途 | ||
1.钠离子通道SCN1A基因突变,其特征是:SCN1A的15号外显子第248个碱基由G突变为A,即发生G248A点突变;和SCN1A的26号外显子第443个碱基由T突变为A,即发生T443A点突变。
2.钠离子通道基因突变的检测方法,其特征是:包括如下步骤:
①抽提DNA样本;
②根据SCN1A或SCN2A基因外显子序列设计引物;
③PCR扩增SCN1A或SCN2A基因外显子;
④在一个或多个变性温度下,利用变性高效液相色谱分析上述产物;
⑤对上述分析的阳性样本进行基因测序。
3.根据权利要求2所述的钠离子通道基因突变的检测方法,其特征是:设计的SCN1A基因外显子1~25的上游引物分别为序列3~51中的奇数序列,其外显子1~25的下游引物分别为序列4~52中的偶数序列,其外显子26的51~362bp上游引物为序列53,下游引物序列为序列54;其外显子26的360~674bp上游引物为序列55,下游引物序列为序列56;其外显子26的672~987bp上游引物为序列57,下游引物序列为序列58;其外显子26的1010~1298bp上游引物为序列59,下游引物序列为序列60。
4.根据权利要求2所述的钠离子通道基因突变的检测方法,其特征是:设计的SCN2A基因外显子2和3的上游引物分别为序列61和63,其下游引物分别为序列62和64;外显子4和5的上游引物均为序列65,下游引物序列均为66;外显子6~17的上游引物分别为序列67~89中的奇数序列,外显子6~17的下游引物分别为序列68~90中的偶数序列;外显子18的1~262bp上游引物为序列91,下游引物为序列92;外显子18的159~480bp上游引物为序列93,下游引物为序列94;外显子19~27的上游引物为序列95~111中的奇数序列,外显子19~27的下游引物为序列96~112中的偶数序列;外显子28的101~600bp上游引物为序列113,下游引物为114;外显子28的601~1057bp上游引物为序列115,下游引物为116;外显子28的936~1401bp上游引物为序列117,下游引物为118。
5.根据权利要求2所述的钠离子通道基因突变的检测方法,其特征是:在变性高效液相色谱分析中,根据双螺旋百分比-温度曲线和温度-碱基对曲线,确定融解域的个数,来选择相应数量的变性温度,使片段所有融解域的碱基对发生部分变性。
6.根据权利要求5所述的钠离子通道基因突变的检测方法,其特征是:变性温度的确定分如下情况:
a.在双螺旋百分比-温度曲线中,双螺旋百分比从100%~0%的温度变化小于5℃,融解域只有一个,则选用单温度进行部分变性分析;
b、双螺旋百分比-温度曲线中双螺旋百分比从100%~0%的温度变化大于或等于5℃,或温度-碱基对曲线呈阶梯状,融解域有多个,则选择多个变性温度,根据所选温度下的双螺旋百分比-碱基对曲线,使每一个融解域分别发生部分变性。
7.根据权利要求1所述的钠离子通道基因突变应用于临床抗癫痫药物的筛选。
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