[发明专利]拷贝选择性重组及其应用

权利要求书

1.一种鉴定病毒群体中的亲本病毒株的方法，其中所述群体包括亲本病毒株和突变的子代病毒株，所述方法包括以下步骤：

a)从来自该群体的足量病毒分离株中获得一种或多种病毒基因的核酸或多肽序列，所述足量足以允许鉴定出该群体中最常见的病毒株，该群体中有序列差异的病毒株，或者两者；

b)鉴定出该群体中最常见的病毒株，或该群体中有序列差异的病毒株，或者两者；

其中将最常见的病毒序列，或有序列差异的病毒序列鉴定为亲本病毒株。

2.权利要求1所述的方法，其中最常见的病毒序列，或有序列差异的病毒序列是通过多个核酸或多肽序列的比对来确定的。

3.权利要求1所述的方法，其中所述突变的子代病毒株是按照拷贝选择机制而重组形成的。

4.权利要求1所述的方法，其中所述亲本病毒株是群体中最常见的两种序列。

5.权利要求1所述的方法，其中所述亲本株是序列差异最大的两个株。

6.权利要求1所述的方法，其中所述病毒是RNA病毒。

7.权利要求6所述的方法，其中所述RNA病毒是单链RNA病毒。

8.权利要求7所述的方法，其中所述单链RNA病毒是正义RNA病毒。

9.权利要求7所述的方法，其中所述单链RNA病毒是负义RNA病毒。

10.权利要求6所述的方法，其中所述RNA病毒是双链RNA病毒。

11.权利要求10所述的方法，其中所述双链RNA病毒是正链RNA病毒。

12.权利要求10所述的方法，其中所述双链RNA病毒是负链RNA病毒。

13.权利要求1所述的方法，其中所述病毒是DNA病毒。

14.权利要求13所述的方法，其中所述DNA病毒是单链DNA病毒。

15.权利要求13所述的方法，其中所述DNA病毒是双链DNA病毒。

16.权利要求9所述的方法，其中所述病毒是流感病毒。

17.权利要求9所述的方法，其中所述病毒是冠状病毒。

18.权利要求1所述的方法，其中所述蛋白或核酸序列来自流感病毒。

19.权利要求18所述的方法，其中所述流感核酸或多肽序列选自HA，NA，NP，PA，PB1，PB2，MP，和NS，或其组合。

20.权利要求1所述的方法，其中所述核酸或多肽序列是通过对分离的病毒株进行测序而获得的。

21.权利要求1所述的方法，其中所述核酸或多肽序列是从公众可获得的数据库获得的。

22.权利要求1所述的方法，其中所述足量是5个或更多个病毒序列。

23.权利要求1所述的方法，其中所述足量是15个或更多个病毒序列。

24.权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种病毒基因是至少两种基因。

25.权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种病毒基因是至少三种病毒基因。

26.权利要求1所述的方法，其中所述一种或多种病毒基因是至少四种病毒基因。

27.一种制备病毒疫苗的方法，包括：

用按照权利要求1所述鉴定的亲本病毒株感染宿主动物；和

从该宿主动物中分离突变的子代病毒株。

28.一种制备病毒疫苗的方法，包括：

用按照权利要求1所述鉴定的亲本病毒株感染细胞系；和

从该宿主动物中分离突变的子代病毒株。

29.一种制备病毒疫苗的方法，包括：

用按照权利要求1所述鉴定的亲本病毒株感染卵；和

从该宿主动物中分离突变的子代病毒株。

30.一种制备病毒疫苗的方法，包括：

用按照权利要求1所述鉴定的亲本病毒株感染昆虫细胞；和

从该宿主动物中分离突变的子代病毒株。