[发明专利]一种通过XRCC1基因和PARP1基因检测肺癌易感性的试剂盒

说明书

技术领域

本发明涉及一种疾病易感性检测用的试剂盒，尤其是一种检测肺癌易感性的试剂盒，通过同时检测X射线交错互补修复基因1(X-ray repair cross-complementing gene 1，XRCC1)的单核苷酸多态性(SNP)位点与多聚ADP核糖转移酶家族成员1(poly(ADP-ribose)polymerase family，member 1，PARP1，又简写为ADPRT)的单核苷酸多态性位点来预测个体对肺癌的易感性。

背景技术

原发性支气管肺癌，简称肺癌，为当前世界各地最常见的恶性肿瘤之一，是一种严重威胁人类健康和生命的疾病。肿瘤细胞源于支气管粘膜或腺体，常有区域性淋巴结和血行转移，早期常有刺激性咳嗽、痰中带血等呼吸道症状，病情进展速度与细胞的生物特性有关。

半个世纪以来，世界各国肺癌的发病率和病死率都有明显增高趋势。世界卫生组织(WHO)2000年报告：1997年全世界死于恶性肿瘤的共706.5万人，占死亡人数的12.6％，其中肺癌占恶性肿瘤死亡的19％，居恶性肿瘤死因的第一位。我国1990～1992年的抽样调查显示，在城市人口的肿瘤死亡中，肺癌由原来的第4位上升为第1位，农村上升最快的也是肺癌。云南锡矿的肺癌发病率在1954～1959年间为28.02/10万，1960～1969年间为197.87/10万，1970～1979年间上升到219.10/10万，这在全世界也是罕见的。英国著名肿瘤学家R.Peto预言：如果我国不及时控制吸烟和空气污染，到2025年我国每年肺癌将超过100万，成为世界第一肺癌大国。

病因和发病机制迄今尚未明确。一致认为肺癌的发病与下列因素有关：①吸烟(包括主动吸烟和被动吸烟)；②职业致癌因子，已被确认的致人类肺癌的职业因素包括石棉、无机砷化合物、二氯甲醚、铬及其化合物、镍、氡、芥子气、氯乙烯、煤烟、焦油和石油中的多环芳烃、烟草的加热产物等；③空气污染(包括室内小环境和室外大环境污染)；④电离辐射；⑤饮食与营养，美国纽约和芝加哥开展的前瞻性人群观察的结果说明，食物中天然维生素A类、β胡萝卜素的摄入量与十几年后癌症的发生呈负相关，其中最突出的是肺癌；⑥其它，美国癌症学会将结核列为肺癌的发病因素之一。结核病者患肺癌的危险性是正常人群的10倍。其主要组织学类型是腺癌。此外，病毒感染、真菌毒素(黄曲霉)、机体免疫功能低下、内分泌失调以及家族遗传等因素，对肺癌的发生可能也起一定的综合作用。

近年研究表明，肺癌的发生与某些癌基因的活化及抑癌基因的失活密切相关。已经证明的几个癌基因家族包括引起突变的ras族、放大基因的myc族、C-erB2、机制不明的bcl-2、Kit及由野生型变异的抗癌基因p53、p16和RB等。大量研究表明C-myc、L-myc、N-myc和RAF在小细胞肺癌中均有过度表达。非小细胞肺癌中则常可见ras族基因的过度表达。这些深入的研究将为基因预防和治疗肺癌提供理论基础。

SNP(single nucleotide polymorphism)，即单核苷酸多态性标记，是一类基于单碱基变异引起的DNA多态性，被遗传学界称为第三代遗传标记。主要是指由基因组核苷酸水平上的变异引起的DNA序列多态性，包括单碱基转换、颠换，以及单碱基的插入/缺失等。它是基因组中最为广泛存在的一类多态性标记，占大约90％。这些基因组序列变异可以导致个体间表型的差异以及不同个体对疾病，特别是复杂疾病的易感性和对环境因素、药物反应的差异。

XRCC1位于第19号染色体19q13.2-13.3位置，全长32.3kb，mRNA全长2087bp，共有17个外显子，编码634个氨基酸的蛋白。XRCC1编码的蛋白对因电离辐射和烷基化物引起的DNA单链断裂能起到有效的修复作用，通过与DNA连接酶III、聚合酶β、多聚ADP核糖转移酶交互作用，参与DNA的碱基切除修复(Base Excision Repair，BER)通路。众多研究显示，XRCC1基因上部分位点的多态性，与癌症发生有密切的关系。与XRCC1相关的癌症主要有：乳腺癌、头颈部鳞状细胞癌、食管癌、胃癌、结肠癌、胰腺癌、肺癌等。