[发明专利]与鼻咽癌相关的人类新基因LOC344967及其编码的蛋白产物

说明书

[技术领域]

本发明属于生物技术领域，具体地说，本发明描述了一个新的人类基因LOC344967的发现、制备和验证过程。

[背景技术]

鼻咽癌（Nasopharyngeal Carcinoma，NPC)因高发于广东地区，素有“广东瘤”(Canton Tumor)之称，广东地区不仅是中国的鼻咽癌高发区，在全世界范围内其发病和死亡率也是最高的。鼻咽癌这种显著的地区和种族分布特征引起了国内外学者浓厚的兴趣，究竟是什么原因使得该地区鼻咽癌发病率如此之高。国内外的研究者试图用新发展起来的技术和新的理论来解释这一现象。

2002年，本课题小组将NPC易感基因定位在4p15.1-q12区域上，后来进一步的精细定位，将区域缩小到D4S2950到D4S3347，遗传图距为8.29cM，对应于4p15.1-4p11之间，结果发表于NatureGenetics上。

最近申请人在积累的遗传学依据基础上，采用生物信息学和分子生物学手段，基于前期NPC易感基因的定位结果，申请人采用位置候选克隆策略，选择4p15.1-q12区域内的基因，采用PCR-测序的方法，筛查检测基因到LOC344967的启动子区域中存在与家族性鼻咽癌患者连锁的序列变异。该变异导致AP-1转录因子结合位点的产生，LOC344967的表达升高，与鼻咽癌易感单体型连锁遗传。

LOC344967位于人类染色体4p14(NCBI Human Genome Projectdatabase，Build 35)，曾被认为是假基因，后为日本NEDO human cDNAsequencing project报道为预测基因，并命名为AK125299。在NCBI数据库其序列几经更新变化，LOC344967在NCBI build 35.1中确定其mRNA全长为1613bp，共3个外显子，预测为可转录编码252个氨基酸，该蛋白包含2个酰基辅酶A水解酶(Acyl-CoA hydrolase)4HBTD的保守结构域，可能与脂类代谢有关。

根据LOC344967与acyl-CoA thioesterase 7 isoform hBACHa(NM_007274，NP_009205)的氨基酸序列比对结果，说明LOC344967与乙酰辅酶A水解酶基因(human Brain acyl-CoAhydrolase，hBACH，EC 3.1.2.2，基因定位于1p36.31-p36.11)具有88.4％的同源性。乙酰辅酶A水解酶高度保守，有着广泛的硫酯酶活性。可以定位在细胞器的膜上，也可以在线粒体和胞液中以可溶性的形式存在，在一定条件下还可以转移至核内。乙酰辅酶A水解酶的催化活性是动物脂肪酸合成酶的固有组成成分，催化着脂肪酸链的延伸，其它的硫酯酶可能非共价地与脂肪酸合成酶相互作用，以在一定的组织中修饰脂肪酸产物的长度。虽然这些脂肪酸合成酶相关的硫酯酶在细胞代谢中的作用不是很明确，但它们最显著的作用就是在过氧化物酶体及线粒体器官内的作用(参与脂肪酸Beta氧化)。

许多乙酰辅酶A水解酶的功能尚未明确，细胞中硫酯酶对酰基辅酶A聚集的调节作用提供了脂肪代谢调控的一个机制。硫酯酶还调控着一些酰化状态，如：信号转导蛋白及其细胞内定位。酰基辅酶A和酰基辅酶A硫酯酶还参与细胞内物质转运，与细胞胞吞有关。现在的研究表明，HIV1 Nef蛋白与酰基辅酶A相互作用形成人硫酯酶，人硫酯酶是Nef诱导的CD4下游调控所必须的；再如和正常上皮细胞相比，脂肪酸合成酶(FAS)在前列腺癌细胞中表达升高，FAS的一种抑制剂Orlistat可以诱导前列腺癌细胞的调亡。相关报道表明，乙酰辅酶A水解酶在生物体内有重要的作用，其表达异常通常导致一些细胞及组织异常收缩及增殖，炎症，免疫系统疾病及各种肿瘤的发生。

对于LOC344967，虽然它的生物学功能还没有完全明确，用RT-PCR的方法在许多正常人类组织、NPC活检标本和NPC细胞系中都检测到它的mRNA。它广泛的组织分布说明该基因重要的生物学功能。可以认为，变异可以导致酶活性的提高，从而导致脂肪酸的代谢异常，在上皮细胞的转化过程中起到辅助的作用。

[发明内容]

本发明提供了一种分离的具有新功能的人类核酸分子LOC344967，其包含编码一种参与细胞周期调控的蛋白质的多核苷酸，本发明的LOC344967与人类酰基辅酶A水解酶(ACOT7/hBACH)呈高度同源。