[发明专利]检测生物样品中的人乳头瘤病毒的系统、方法和组合物

权利要求书

1.一种检测、鉴定和/或定量哺乳动物生物样品中的HPV DNA的方法，所述方法包括以下步骤：

提取哺乳动物生物样品的DNA；

在存在至少一种竞争者序列时通过PCR对至少部分提取的DNA进行第一次扩增，所述竞争者序列包含与已知HPV类型的DNA序列中的多核苷酸基本同源的多核苷酸，所述竞争者序列具有所述HPV DNA序列中不存在的核苷酸取代；

在存在至少一种所述已知HPV类型的延伸引物和至少两种不同双脱氧核苷酸时通过PCR进行第二次扩增；和

通过质谱测定任何扩增的所述已知HPV类型的延伸引物的水平。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述哺乳动物生物样品是体液或组织样品。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述测定步骤包括检测浓度低至约200阿摩尔的任何扩增的延伸引物。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第一次扩增包括存在多种竞争者序列类型，各竞争者序列包含与不同已知HPV类型的DNA序列中的多核苷酸基本同源的多核苷酸，所述竞争者序列类型具有所述相应HPV DNA序列中不存在的核苷酸取代，且其中所述第二次扩增包括存在多种各不同已知HPV类型的外部引物类型。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述多种已知HPV类型包括HPV类型16、18、23、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73和82中的两种或多种。

6.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述多种已知HPV类型包括HPV类型16、18、23、26、31、33、35、39、45、51、52、53、56、58、59、66、68、73和82中的至少一种。

7.如权利要求4所述的方法，所述方法还包括：

在存在至少一种竞争者序列时通过PCR对至少部分提取的DNA进行第一次扩增，所述竞争者序列包含与淋病奈瑟菌或沙眼衣原体的DNA序列中的多核苷酸基本同源的多核苷酸，所述竞争者序列具有所述淋病奈瑟菌或沙眼衣原体DNA序列中不存在的核苷酸取代；

在存在至少一种所述淋病奈瑟菌或沙眼衣原体的延伸引物和至少两种不同双脱氧核苷酸时通过PCR进行第二次扩增；和

通过质谱测定任何扩增的淋病奈瑟菌或沙眼衣原体的延伸引物的水平。

8.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第一次扩增包括存在至少一种竞争者序列，所述竞争者序列包含与基因erbB-2的DNA序列中的多核苷酸基本同源的多核苷酸，所述竞争者序列类型具有所述基因erbB-2中不存在的核苷酸取代。

9.如权利要求1所述的方法，包括在所述测定步骤之后诊断、监测或评价哺乳动物的宫颈癌、宫颈发育异常、宫颈上皮内瘤、肛门癌、肛门上皮内瘤、头/颈癌、血吸虫病相关的膀胱癌或乳头状瘤的额外步骤。

10.如权利要求1所述的方法，其特征在于，至少一种竞争者序列选自SEQ ID No.67、SEQ ID No.68、SEQ ID No.69、SEQ ID No.70、SEQ ID No.71、SEQ ID No.72、SEQ ID No.73、SEQ ID No.74、SEQ ID No.75、SEQ ID No.76、SEQ ID No.77、SEQID No.78、SEQ ID No.79、SEQ ID No.80、SEQ ID No.81、SEQ ID No.82、SEQ IDNo.83、SEQ ID No.84或SEQ ID No.85。

11.如权利要求10所述的方法，还包括，至少一种竞争者序列选自SEQ ID No.86、87或88。