[发明专利]检测染色体非整倍性的方法有效
申请号: | 200680007354.2 | 申请日: | 2006-03-17 |
公开(公告)号: | CN101137760A | 公开(公告)日: | 2008-03-05 |
发明(设计)人: | 卢煜明;赵慧君;徐宝贤;丁春明;查尔斯·坎特 | 申请(专利权)人: | 香港中文大学;波士顿大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 王达佐;韩克飞 |
地址: | 中国香*** | 国省代码: | 中国香港;81 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 染色体 非整倍性 方法 | ||
1.测定孕妇所怀胎儿染色体异常的方法,包括以下步骤:
(a)鉴别来源于该孕妇的含有RNA的生物样本中所关注的至少一个染色体上的至少一个遗传位点转录出的RNA的等位基因,其中所述含有RNA的生物样本含有胎儿RNA;
(b)确定所述RNA转录物的等位基因比例;以及
(c)将步骤(b)得到所述比例与代表从怀有染色体正常胎儿的孕妇获得的对应生物样本中的等位基因比例的标准对照进行比较,其中所述比例比标准对照增加或降低都表明胎儿染色体异常的风险增加。
2.如权利要求1所述的方法,其中所述染色体异常是21号染色体三体、18号染色体三体和13号染色体三体中的一种。
3.如权利要求2所述的方法,其中所述染色体异常是21号染色体三体。
4.如权利要求1所述的方法,其中所述染色体异常在X染色体或Y染色体上。
5.如权利要求1所述的方法,其中步骤(a)中的生物样本选自母体血液,血浆或血清,羊水,绒膜毛样品,来自移植前胚胎的活体材料、从母体血液分离的胎儿有核细胞或胎儿细胞残片、母体尿液、母体唾液、妇女生殖道洗涤物以及胎体腔穿刺获取的样品中的一种。
6.如权利要求1所述的方法,其中步骤(a)中的生物样本是母体血液。
7.如权利要求1所述的方法,其中步骤(a)中的生物样本含有存在于母体血液中的细胞成分或细胞残片。
8.如权利要求1所述的方法,其中步骤(a)中的所述胎儿RNA来源于胎盘。
9.如权利要求1所述的方法,其中步骤(a)是利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)完成的。
10.如权利要求1所述的方法,其步骤(a)和/或步骤(b)是通过选自以下方法中的一种完成的:引物延伸反应、质谱分析、用至少一种探针杂交、用至少一种荧光标记探针杂交、直接测序、克隆和测序以及电泳。
11.如权利要求1所述的方法,其步骤(a)、(b)和(c)中的所述等位基因是通过序列差异进行区分的。
12.如权利要求11所述的方法,其中所述序列差异是单核苷酸多态(SNP)。
13.如权利要求11所述的方法,其中所述序列差异是插入/缺失多态。
14.如权利要求11所述的方法,其中所述序列差异是简单串联重复多态。
15.如权利要求1所述的方法,其中所述RNA转录自21号、18号、13号、X和Y染色体中的一个。
16.如权利要求15所述的方法,其中所述RNA转录自21号染色体。
17.如权利要求1所述的方法,其中所述RNA是mRNA。
18.如权利要求1所述的方法,其中所述RNA转录自胶原VIα1(COL6A7),超氧化歧化酶1(SOD1),胶原VIα2(COL6A2),线粒体ATP合成酶O亚基(ATP5O),BTG家族成员3(BTG3),含有血小板反应蛋白1型基序的解聚素样和金属蛋白酶I(ADAMTS1),β位APP剪切酶2(BA CE2),intersectin 1(ITSN1),淀粉样蛋白β(A4)前体蛋白(APP),ATP合成酶,H+转运,线粒体F0复合体,亚基F6(ATP5J),唐氏综合症判别区域基因5(DSCR5),胎盘特异4(PLAC4),推测蛋白BC005107(LOC90625),核糖体蛋白L17(RPL17),丝氨酸蛋白酶抑制剂分枝B(卵清蛋白)成员2(SERPINB2)和胶原IVα2(COL4A2)中的至少一个遗传座位。
19.如权利要求18所述的方法,其中所述RNA含有至少一个所述遗传座位的单核苷酸多态。
20.如权利要求19所述的方法,其中所述RNA转录自胶原VIα1(COL6A1)和胶原VIα2(COL6A2)中的至少一个遗传座位。
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