[发明专利]新型芳香异戊烯基转移酶，编码其的核酸和其使用

权利要求书

1.芳香异戊烯基转移酶，其具有β/α圆筒状结构。

2.根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶，其中所述的芳香异戊烯基转移酶具有SEQ ID NO：2中阐述的氨基酸序列，或其保守的变异。

3.根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶，其中所述的芳香异戊烯基转移酶与SEQ ID NO：2中阐述的氨基酸序列具有至少80％的序列同一性。

4.核酸，其编码权利要求1所述的异戊烯基转移酶。

5.核酸，其编码根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶。

6.组合物，其包含晶体形式的、根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶。

7.根据权利要求6所述的组合物，进一步包括所述的芳香异戊烯基转移酶的一个或多个底物。

8.根据权利要求6所述的组合物，具有附录1中所提出的结构坐标。

9.一种预测推定的芳香异戊烯基转移酶的活性和/或底物专一性的方法，所述的方法包括：

将已知的芳香异戊烯基转移酶的三维描述和推定的芳香异戊烯基转移酶的三维表示相比较，这两种表示之间的差别就可以预测芳香异戊烯基转移酶的活性和/或底物的专一性。

10.一种筛选与根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶可以结合的化合物的方法，所述的方法包括：

测定潜在结合试剂与芳香异戊烯基转移酶底物竞争以结合芳香异戊烯基转移酶的能力，其中潜在结合的许多原子坐标。

11.一种鉴定根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶的潜在底物的方法，所述的方法包括：

根据所述的芳香异戊烯基转移酶的许多原子坐标，确定所述的芳香异戊烯基转移酶的活性位点；

鉴别与所述的活性位点适合的潜在的底物；和

将芳香异戊烯基转移酶和潜在的底物相接触，并测定其活性。

12.一种筛选化合物以确定它们是否是芳香异戊烯基转移酶底物的方法，所述的方法包括：

测试化合物被根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶转化的能力，

其中所述的化合物已经被选定，它与所述的芳香异戊烯基转移酶有作用点，而且

其中所述的芳香异戊烯基转移酶与其底物或产物之间类似的作用点已经被确定。

13.一种刺激芳香异戊烯基转移酶活性的方法，所述的方法包括将所述的芳香异戊烯基转移酶与权利要求12的方法所鉴定的有效数量的化合物相接触。

14.一种鉴定根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶的活性的潜在调节剂的方法，所述的方法包括：

接触与活性位点适合的潜在化合物，这些活性位点是根据所述芳香异戊烯基转移酶的许多原子坐标确定的；和

测定所述的化合物调节所述的芳香异戊烯基转移酶活性的能力。

15.一种筛选调节根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶的活性的化合物的方法，所述的方法包括：

测试化合物调节所述芳香异戊烯基转移酶活性的能力，

其中所述的化合物已经被选定，它与所述的芳香异戊烯基转移酶有相互作用点，而且

其中所述的芳香异戊烯基转移酶与其底物或产物之间类似的相互作用点已经被确定。

16.一种将芳香底物异戊烯化的方法，所述的方法包括：

在异戊烯化的条件下将芳香底物与根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶相接触。

17.一种鉴定具有β/α圆筒状结构的蛋白质的方法，所述的方法包括：

将根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶的三维表示和推定的具有β/α圆筒状结构的蛋白质的三维表示相比较，其中这两种描述之间的相似性就可以预测具有β/α圆筒状结构的芳香异戊烯基转移酶蛋白质。

18.一种控制或改变由根据权利要求1所述的芳香异戊烯基转移酶所促进的异戊烯化程度的方法，所述的方法包括：

改变或更改所述的芳香异戊烯基转移酶的一个或多个活性位点残基，以致于改变活性位点的尺寸，从而足以控制或改变由芳香异戊烯基转移酶促进的异戊烯化程度。