[发明专利]检测HPV的方法及探针,引物和试剂盒无效
申请号: | 200680008504.1 | 申请日: | 2006-01-17 |
公开(公告)号: | CN101160414A | 公开(公告)日: | 2008-04-09 |
发明(设计)人: | B·D·A·科劳;G·E·M·克勒特;W·G·昆特;D·C·J·G·范阿勒维克;H·A·M·范登蒙克霍夫;L·J·范多恩 | 申请(专利权)人: | 代夫特诊断实验室公司;葛兰素史密丝克莱恩生物有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人: | 李波;梁谋 |
地址: | 荷兰*** | 国省代码: | 荷兰;NL |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 hpv 方法 探针 引物 试剂盒 | ||
1.对可能存在于生物样品中的任意HPV核酸进行检测和/或分型的方法,所述方法包含下述步骤:
(i)扩增样品中的多核酸片段,其包含任意HPV核酸的B区域或由它组成,所述B区域表示在图1中,和
(ii)使来自步骤(i)的任意扩增的片段接触至少一种能与HPV的B区域特异性地杂交的探针,所述B区域表示在图1中。
2.根据权利要求1的方法,其中样品中的扩增的多核酸片段包含任意HPV核酸的D区域或由它组成,所述D区域表示在图1中。
3.根据权利要求2的方法,其中使来自步骤(i)的任意扩增的片段接触至少一种能与HPV的D区域特异性地杂交的探针,所述D区域表示在图1中。
4.根据任一项前述权利要求的对可能存在于生物样品中的HPV进行检测和/或分型的方法,所述方法包含:
(i)使用下述引物,扩增HPV的多核酸片段:
-5’引物,其特异性地杂交于HPV 16的基因组的‘A’区域,所述‘A’区域表示在图1中,和
-3’引物,其特异性地杂交于至少一种HPV类型的基因组的‘C’区域,所述‘C’区域表示在图1中;
(ii)使来自步骤(i)的扩增的片段与至少一种探针杂交,所述探针能与HPV的‘B’区域或‘D’区域特异性地杂交,所述区域表示在图1中。
5.根据任一项前述权利要求的方法,其中所述探针能特异性地杂交仅一种HPV类型的基因组的D或B区域。
6.根据权利要求1的方法,其中所述探针选自在表4,5-14,17,18,19中或在任意实施例中列出的序列组成的列表。
7.根据任一项前述权利要求的方法,其中所述扩增步骤使用选自下组的引物:HPV-MPF1F1,HPV-MPF1F2,HPV-MPF1F3,HPV-MPF1F4,HPV-MPF1F5,HPV-MPF1F6,HPV-MPF1F7,HPV-MPF1F8,HPV-MPF1F9,HPV-MPF1F10,HPV-MPF2R1,HPV-MPF2R2,HPV-MPF2R3,HPV-MPF2R4,HPV-MPF2R5,HPV-MPF2R6,HPV-MPF2R7,HPV-MPF2R8。
8.根据任一项前述权利要求的方法,其中在分型步骤之前,证实样品中存在HPV核酸。
9.根据任一项前述权利要求的方法,其中探针和靶之间的杂交在有固体支持物存在下进行。
10.根据权利要求9的方法,其中所述杂交步骤使用反向杂交形式。
11.根据权利要求9的方法,其中所述探针直接或间接附着在珠子上,任选荧光珠。
12.根据权利要求11的方法,其中使用流式细胞术分析杂交的检测。
13.包含至少2种引物的试剂盒,所述引物适用于扩增来自HPV基因组的B或D区域的核酸。
14.根据权利要求13的试剂盒,其中所述引物选自:HPV-MPF1F1,HPV-MPF1F2,HPV-MPF1F3,HPV-MPF1F4,HPV-MPF1F5,HPV-MPF1F6,HPV-MPF1F7,HPV-MPF1F8,HPV-MPF1F9,HPV-MPF1F10,HPV-MPF2R1,HPV-MPF2R2,HPV-MPF2R3,HPV-MPF2R4,HPV-MPF2R5,HPV-MPF2R6,HPV-MPF2R7和HPV-MPF2R8。
15.包含至少2种探针的试剂盒,所述探针能特异性地杂交于HPV基因组的D区域或B区域。
16.根据权利要求15的试剂盒,其中所述探针是选自表4,5-14,17,18,19中的任一个或任意实施例的任意2种探针。
17.试剂盒,其包含表1或2的任意引物、或表3的任意探针、和用于实现上述HPV鉴别和分型分析的方法的说明书。
18.试剂盒,其包含附着在固体支持物上的能特异性地杂交于HPV基因组的D区域或B区域的探针。
19.根据权利要求13-17之一的试剂盒,其另外包含表3的任意探针。
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