[发明专利]基因活性分类器在患感染性/非感染性多器官功能衰竭患者基因表达谱的体外分类中的应用无效
申请号: | 200680009276.X | 申请日: | 2006-03-16 |
公开(公告)号: | CN101146914A | 公开(公告)日: | 2008-03-19 |
发明(设计)人: | 斯特凡·鲁斯武尔姆;康拉德·赖因哈特 | 申请(专利权)人: | 斯尔思实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 隆天国际知识产权代理有限公司 | 代理人: | 高龙鑫 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 德国;DE |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因 活性 分类 感染性 器官 功能 衰竭 患者 表达 体外 中的 应用 | ||
1.将患者分类为“未被感染且无多器官功能衰竭”、“非感染性多器官功能衰竭”或“感染性多器官功能衰竭”的基因活性标签,所述基因活性标签是多核苷酸,其选自如下组成的组:SEQ ID I.1、SEQ ID I.2、SEQID I.3、SEQ ID I.4、SEQ ID I.5、SEQ ID I.6、SEQ ID I.7、SEQ ID I.8和SEQ ID I.9或者它们的部分序列。
2.根据权利要求1所述的基因活性标签,其中所述部分序列的长度是5-2000个核苷酸,优选为20-2000个核苷酸,更优选为20-80个核苷酸。
3.根据权利要求1-2任一项所述的基因活性标签,其特征在于,
SEQ ID I.1的过表达和SEQ ID I.3的表达下调或者SEQ ID I.2的过表达和SEQ ID I.4的表达下调表明为“未被感染且无多器官功能衰竭”的类别;
SEQ ID I.3的过表达和SEQ ID I.6的表达下调或者SEQ ID I.4的过表达和SEQ ID I.5的表达下调表明为“非感染性多器官功能衰竭”的类别;
SEQ ID I.5的过表达和SEQ ID I.7的表达下调或者SEQ ID I.8的过表达和SEQ ID I.9的表达下调显示了“感染性多器官功能衰竭”的类别。
4.根据权利要求1-3任一项所述的基因活性标签,其特征在于,所述的多核苷酸序列或部分多核苷酸序列至少部分地被合成的类似物、适配子和/或肽核酸所替代。
5.分别对患有感染性多器官功能衰竭和非感染性多器官功能衰竭的患者进行分类的方法,其包括如下步骤:
从患者样品中分离mRNA;
使用可检测单元标记mRNA;
将标记的mRNA与权利要求1所述的基因活性标签相接触,由此在接触步骤后各基因活性标签彼此分开;
洗涤杂交的基因活性标签;
激活可检测单元从而释放信号;
读取每一个基因活性标签的杂交信号并且与健康患者的参照样品比较,其中:
SEQ ID I.1的过表达和SEQ ID I.3的表达下调或者SEQ ID I.2的过表达和
SEQ ID I.4的表达下调表明为“未被感染且无多器官功能衰竭”的类别;
SEQ ID I.3的过表达和SEQ ID I.6的表达下调或者SEQ ID I.4的过表达和
SEQ ID I.5的表达下调表明为“非感染性多器官功能衰竭”的类别;
SEQ ID I.5的过表达和SEQ ID I.7的表达下调或者SEQ ID I.8的过表达和
SEQ ID I.9的表达下调表明为“感染性多器官功能衰竭”的类别。
6.根据权利要求5的方法,其特征在于,患者样品包括体液,特别是血液、渗出液、尿、腹水、精液、唾液、穿刺液,细胞内容物或其混合物。
7.包含根据权利要求1-4任一项所述的基因活性标签的微阵列。
8.将患者分类为感染性多器官功能衰竭或非感染性多器官功能衰竭的仪器,其包括:
用于体外获得患者样品的样品制备模块;
用于将患者样品与来自基因活性分类器的基因活性探针杂交的模块;
读取杂交信号的模块;
对读取的杂交信号进行图形分析的模块;
能够与储存健康患者的基因活性分类器自动比较的模块;和
显示比较结果的模块。
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