[发明专利]生物体信息处理装置和方法、程序以及记录介质

说明书

技术领域

本发明涉及一种生物体信息处理装置和方法、程序以及记录介质，特别是涉及一种不使结构变复杂而能够以低成本正确地测量生物体物质的生物体结合的状态的生物体信息处理装置和方法、程序以及记录介质。

背景技术

近年来，DNA(deoxyribonucleic acid：脱氧核糖核酸)芯片或DNA微阵列(以下，在本说明书中不需要区分两者的情况下统一地简称为DNA芯片)的实际应用正在发展。DNA芯片将多种/很多DNA低聚链作为检测用核酸而集成并固定在基板表面上。使用DNA芯片来检测固定在基板表面的点上的探针(プロ一ブ)与从细胞等中提取的样本中的目标之间的杂交(hybridization)，由此能够全面地解析所提取的细胞内的基因表达。

随着使用了DNA芯片的基因表达解析中的杂交检测技术的提高，不仅可以检测有无基因表达，而且还逐渐能够定量地测量基因表达量。例如，实际应用了一部分如下技术：当杂交检测时定量地测量荧光强度，从而获取表示基因表达量的定量的数值。

另外，在DNA芯片上存在异物时，难以正确地测量为了检测探针与目标的杂交而所需的荧光强度。因此，提出了从荧光强度的图像中除去异物的图像的方案(例如专利文献1)。

专利文献1：日本特开2002-257730号公报

发明内容

发明要解决的问题

在专利文献1的方法中准备：激励荧光物质从而产生荧光的第一波长的光、以及不激励荧光物质从而不产生荧光的第二波长的光。然后，通过向DNA芯片上照射第一波长的光而得到第一图像(包含杂交的部位和异物的图像)，并且通过照射第二波长的光而得到第二图像(仅包含异物的图像)，从第一图像中除去第二图像。

然而，基于这种原理的装置需要准备两种波长的光源，存在结构变得复杂、成本变高的问题。

本发明是鉴于这种状况而完成的，能够不使结构变复杂而以低成本进行正确的测量。

用于解决问题的方案

本发明的侧面是一种生物体信息处理装置，其测量固定在设置于基板上的反应区域中的第一生物体物质与对第一生物体物质进行生物体反应的第二生物体物质之间的生物体反应的状态，该生物体信息处理装置具备：输入单元，其输入反应区域的图像信息；以及计算单元，其根据所输入的图像信息，计算表示反应区域中的第一生物体物质与第二生物体物质之间的生物体反应的状态的反应度信息、以及表示反应度信息的可靠性的可靠度信息。

在本发明的侧面中，根据所输入的图像信息，来计算表示反应区域中的第一生物体物质与第二生物体物质之间的生物体反应的状态的反应度信息、以及表示反应度信息的可靠性的可靠度信息。

还可以具备设定单元，该设定单元设定表示是否能够利用反应度信息的标志。

上述设定单元能够根据可靠度信息、在将反应区域分割成包含不需要的物质的区域和不包含不需要的物质的区域的情况下的分割区域的数量、或来自操作者的指定，来设定标志。

还可以具备分割单元，该分割单元将反应区域分割成由包含不需要的物质的区域和不包含不需要的物质的区域构成的多个分割区域，计算单元对每个分割区域分别计算反应度信息和可靠度信息。

上述计算单元可以对在同一条件下的测量中所使用的对应的多个上述反应区域的各个分割区域进行组合，对每个上述组合分别计算作为组合的反应度信息的组合反应度信息和作为组合的可靠度信息的组合可靠度信息，将组合可靠度信息最大的组合的组合反应度信息作为反应区域的反应度信息。

第一生物体物质和第二生物体物质是相互具有互补的碱基序列的基因或从其派生的物质，反应度信息是第一生物体物质与第二生物体物质的杂交的信息。

杂交的信息可以是基于函数根据第一生物体物质与第二生物体物质进行杂交而得到的荧光强度唯一地决定的信息。

可以利用第一生物体物质和第二生物体物质在第一测量时进行杂交而得到的第一荧光强度以及在第二测量时进行杂交而得到的第二荧光强度被设定的范围的分散的倒数，来规定可靠度信息。

发明的效果

根据本发明，可以测量生物体反应的状态。特别是能够不使结构变复杂而以低成本进行正确的测量。

附图说明

图1是表示作为本发明的实施方式的生物体信息处理装置的结构例的框图。

图2是表示DNA芯片的结构例的立体图。

图3是表示实验过程处理装置的结构例的框图。

图4是说明实验过程的处理的流程图。