[发明专利]基于色原分离的图像分析方法有效
申请号: | 200680016565.2 | 申请日: | 2006-05-12 |
公开(公告)号: | CN101176116A | 公开(公告)日: | 2008-05-07 |
发明(设计)人: | 拉裴尔·马塞尔普瓦;瑞安·威廉斯;塞德里克·奥尔尼 | 申请(专利权)人: | 三路影像公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;A61B5/00;G06K9/00 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 | 代理人: | 刘晓东;顾晋伟 |
地址: | 美国北卡*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 分离 图像 分析 方法 | ||
1.一种染色样品用于显微成像的方法,由将染色样品的图像配置为展示亚细胞组分之间的最佳对比以用于病理学家的诊断,所述方法包括:
用染料染色样品;
从样品的显微图像中确定所述染料的透光度值;
从确定的染料透光度值形成所述样品的人工图像;
改变染料的透光度值,从而形成一系列的人工图像;
从所述的系列图像中选择一个图像,其展示出关于所述染料的亚细胞组分之间的最佳对比并且确定在该图像中所述染料的对应透光度值;以及
改变该染料对样品的染色,从而提供具有与亚细胞组分之间最佳对比对应的染料透光度值的染色样品。
2.根据权利要求1的方法,其中改变透光度值还包括通过对与之对应的光密度应用绝对加权系数和相对加权系数之一来改变所述染料的透光度值。
3.根据权利要求1的方法,其还包括确定染色所述样品所需的染料量,从而提供具有与亚细胞组分之间最佳对比对应的染料透光度值的染色样品。
4.根据权利要求1的方法,其中确定所述染料的透光度值还包括从所述样品的显微图像确定所述染料在每个红色通道、绿色通道和蓝色通道中的透光度值。
5.一种人工染色样品的方法,所述方法包括:
用第一染料染色样品;
从所述样品的显微图像确定所述第一染料的透光度值和消光系数;
根据确定的所述第一染料的透光度值形成该样品的人工图像;
用第二染料的消光系数替换所述第一染料的消光系数,从而用该第二染料对所述样品进行人工染色。
6.根据权利要求5的方法,其中确定第一染料的透光度值和消光系数还包括从所述样品的显微图像确定所述第一染料在每个红色通道、绿色通道和蓝色通道中的透光度值和消光系数。
7.根据权利要求6的方法,其中用第二染料的消光系数替换所述第一染料的消光系数还包括在每个红色、绿色和蓝色通道中用第二染料的消光系数替换所述第一染料的消光系数。
8.一种从样品的图像获取该样品测量的方法,其包括:
从样品的RGB图像选择该样品中的感兴趣区域;
分割该RGB图像中的感兴趣区域以识别其中感兴趣的任何目标;
执行特征提取以确定所识别的感兴趣目标的测量;以及
确定关于标志物定位和信噪比中至少一种的细胞评分。
9.根据权利要求8的方法,其中从所述样品的RGB图像选择样品中感兴趣区域还包括在与其RGB图像对应的仅标志物图像中选择与其周围形成正对比的区域,所述的正对比区域包括比周围区域相对更大的核和相对更高的细胞密度中至少一种。
10.根据权利要求8的方法,其还包括:
向所述样品的仅标志物图像应用低通滤波器,经由对该样品RGB图像的色原分离获取所述仅标志物图像;
确定该仅标志物图像中像素的仅标志物直方图;以及
根据该仅标志物直方图中的阈值将该仅标志物图像二值化,从而形成用于区分所述样品阴性和阳性区域的掩蔽层。
11.根据权利要求10的方法,其中确定仅标志物直方图还包括确定该仅标志物图像的非背景区域的仅标志物直方图,所述非背景区域是从该样品的亮度图像确定的。
12.根据权利要求10的方法,其还包括在将所述仅标志物图像二值化以后,填充所述掩蔽层中任何不确定的孔,从而形成光滑掩蔽层,其定义对应于所述样品之阳性区域的孔隙。
13.根据权利要求12的方法,其还包括将所述光滑掩蔽层置于该样品的RGB图像上,从而在该RGB图像中,所述样品的阳性区域通过该光滑掩蔽层显现。
14.一种在片上选择感兴趣区域的方法,在对应于该样品RGB图像的仅标志物图像中所述区域与其周围区域形成正对比,该正对比区域包括比其周围区域相对更大的核和相对更高的细胞密度中至少一种,其包括:
对样品的仅标志物图像应用低通滤波器,经由对该样品RGB图像的色原分离获取所述的仅标志物图像;
确定该仅标志物图像中像素的仅标志物直方图;以及
根据该仅标志物直方图的阈值将所述仅标志物图像二值化,从而形成区分所述样品阴性和阳性区域之间的掩蔽层。
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