[发明专利]肿瘤和组织的鉴定

权利要求书

1.一种将含细胞样品分类为含有某类型组织的肿瘤细胞的方法，所述方法包括

测定获自人对象的含细胞样品中细胞的约5-49种转录序列的表达水平，其中所 述样品不是冰冻组织切片，和

根据所述序列的表达水平，将样品分类为含有多种肿瘤类型中某类型组织的肿 瘤细胞，

其中用于所述分类的转录序列与肿瘤类型数量之比约为1∶2-5∶2或更高。

2.一种将含细胞样品分类为含有某类型组织的肿瘤细胞的方法，所述方法包括

测定获自人对象的含细胞样品中细胞的约5-49种转录序列的表达水平，和

根据所述序列的表达水平，将样品分类为含有多种肿瘤类型中某类型组织的肿 瘤细胞，

其中用于所述分类的转录序列与肿瘤类型数量之比约为1∶2-5∶2或更高，

其中a)超过50％的所述转录序列的表达与另一种所述转录序列的表达无关，或

b)所述5-49种转录序列不是根据利用已知肿瘤样品的督导学习、不是根据它们 的表达与所述多种肿瘤类型之间的相关性水平、也不是根据它们的表达与所述多种 肿瘤类型之间相关性中它们的排序来选择。

3.如权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述比值最高约为20∶1。

4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其特征在于，所述比值约为3∶2-5∶2， 所述肿瘤类型数量为2-38。

5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，还包括测定基于所述比值和肿瘤类型 数量以外的过多转录序列的表达水平。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，利用微阵列测定所述表达水平。

7.如权利要求1-6中任一项所述的方法，其特征在于，所述分类的精确度为60％ 以上。

8.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其特征在于，所述5-49种转录序列包 括选自所述74种基因序列组的两种或多种序列。

9.如权利要求8所述的方法，其特征在于，所述5-49种转录序列包括选自所 述74种基因序列组的5种或多种序列。

10.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其特征在于，所述测定包括与一种 或多种参比转录序列作比较进行检测。

11.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其特征在于，所述测定包括检测所 有所述转录序列或其一部分的表达。

12.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其特征在于，所述测定包括扩增所 有所述转录序列或其一部分，或者逆转录和标记对应于所述转录序列的RNA。

13.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述扩增包括线性RNA扩增或 定量PCR。

14.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述扩增是扩增位于所述转录物 聚腺苷酸化位点的600个核苷酸之内的序列。

15.如权利要求12所述的方法，其特征在于，所述扩增是用定量PCR扩增所 述转录物的至少50个核苷酸。

16.一种包含用于检测权利要求12所述扩增产物的寡核苷酸探针的微阵列。

17.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其特征在于，选择的所述转录序列 是非冗余的。

18.如权利要求17所述的方法，还包括测定过多转录序列的表达水平，所述转 录序列对于用于所述分类的转录序列而言是冗余的。

19.如权利要求1-18中任一项所述的方法，其特征在于，所述样品是人患者的 临床样品。

20.如权利要求19所述的方法，其特征在于，所述样品是固定的样品。

21.如权利要求20所述的方法，其特征在于，所述样品是福尔马林固定、石蜡 包埋(FFPE)的样品。