[发明专利]检测微生物和抗生素抗性标记物的方法及其中所用的核酸寡核苷酸

权利要求书

1. 检测样品中的一或多种微生物和/或一或多种抗生素抗性标记物的方法，包括鉴定是否存在特征性核酸区域。

2. 权利要求1的方法，其中所述微生物的特征性核酸区域是23SRNA基因。

3. 权利要求1或2的方法，其中采用核酸扩增来鉴定所述特征性核酸区域。

4. 权利要求2或3的方法，其中采用多重PCR来检测两种或多种特征性核酸区域。

5. 权利要求1或2的方法，其中采用杂交来鉴定所述特征性核酸区域。

6. 权利要求3或4的方法，其中所述微生物是阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：3和4或SEQ ID NO：5和6所表示的序列的扩增引物对。

7. 权利要求5的方法，其中所述微生物是阴沟肠杆菌，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：3至6中任一所表示的序列的杂交探针。

8. 权利要求1至5中任一项的方法，其中所述特征性核酸区域相应于SEQ ID NO：1或2，而微生物是阴沟肠杆菌。

9. 权利要求3或4的方法，其中所述微生物是粪肠球菌(Enterococcus faecalis)，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：9和11、SEQ ID NO：9和12、SEQ ID NO：13和14、SEQ ID NO：15和12、或SEQ ID NO：15和11所表示的序列的扩增引物对。

10. 权利要求5的方法，其中所述微生物是粪肠球菌，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：9至15中任一所表示的序列的探针。

11. 权利要求1至5中任一项的方法，其中所述特征性核酸区域相应于SEQ ID NO：7或8，而微生物是粪肠球菌。

12. 权利要求3或4的方法，其中所述微生物是屎肠球菌(Enterococcus faecium)，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：18和19、SEQ ID NO：19和20、或SEQ ID NO：20和21所表示的序列的扩增引物对。

13. 权利要求5的方法，其中所述微生物是屎肠球菌，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：19至21中任一所表示的序列的探针。

14. 权利要求1至5中任一项的方法，其中所述特征性核酸区域相应于SEQ ID NO：16或17，而微生物是屎肠球菌。

15. 权利要求3或4的方法，其中所述微生物是大肠杆菌(Escherichia coli)，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：24和25、SEQID NO：24和26、SEQ ID NO：27和29、或SEQ ID NO：28和29所表示的序列的扩增引物对。

16. 权利要求5的方法，其中所述微生物是大肠杆菌，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：24至29中任一所表示的序列的探针。

17. 权利要求1至5中任一项的方法，其中所述特征性核酸区域相应于SEQ ID NO：22或23，而微生物是大肠杆菌。

18. 权利要求3或4的方法，其中所述微生物是肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：32和34、SEQ ID NO：32和33、SEQ ID NO：35和36、或SEQ ID NO：37和33所表示的序列的扩增引物对。

19. 权利要求5的方法，其中所述微生物是肺炎克雷伯菌，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：32至37中任一所表示的序列的探针。

20. 权利要求1至5中任一项的方法，其中所述特征性核酸区域相应于SEQ ID NO：30或31，而微生物是肺炎克雷伯菌。

21. 权利要求3或4的方法，其中所述微生物是铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)，所述方法包括使用相应于SEQ ID NO：40和41或SEQ ID NO：40和42所表示的序列的扩增引物对。