[发明专利]寡核苷酸有效
申请号: | 200680034566.X | 申请日: | 2006-07-20 |
公开(公告)号: | CN101268200A | 公开(公告)日: | 2008-09-17 |
发明(设计)人: | 戴维·戈登·麦克道尔;戴维·约翰·弗伦奇 | 申请(专利权)人: | LGC有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 隆天国际知识产权代理有限公司 | 代理人: | 吴小瑛 |
地址: | 英国米德*** | 国省代码: | 英国;GB |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 寡核苷酸 | ||
1.一种单链寡核苷酸,基本不具有二级结构并由核苷酸残基形成,其 中2个或更多个内部核苷酸残基的碱基用荧光团标记并没有结合的淬灭 剂,其中至少2个用荧光团标记的核苷酸残基被至少2个未标记的核苷酸 残基分隔,并且其中所述寡核苷酸的3’核苷酸残基不含3’羟基。
2.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中多至大约三分之一的内部残 基用荧光团标记。
3.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中所有用荧光团标记的核苷酸 残基被至少2个未标记的核苷酸残基分隔。
4.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其包含至少1个G残基,其中至 少1个荧光团标记的核苷酸残基与至少1个G残基相邻。
5.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸的3’核苷酸残 基包含3’磷酸或本身是3’脱氧残基。
6.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其包含10至50个核苷酸残基。
7.根据权利要求6所述的寡核苷酸,其包含15至30个核苷酸残基。
8.根据权利要求6所述的寡核苷酸,其包含2至10个荧光团标记的 内部核苷酸残基。
9.根据权利要求7所述的寡核苷酸,其包含2至5个荧光团标记的内 部残基。
10.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中每一个荧光团是相同的荧 光团。
11.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其包含2个或更多个不同的荧 光团。
12.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中荧光团选自如下构成的组: 如6-羧基荧光素(FAM)、四氯荧光素(TET)、六氯荧光素(HEX)的 基于荧光素的染料;如6-羧基-X-罗丹明(ROX)、6-羧基四甲基罗丹明 (TAMRA)的基于罗丹明的染料;如Cy3或Cy5的Cy家族染料;如NED 或JOE的其他荧光团,以及Alexa染料、Atto染料、Dyomic染料、Dymoic megastoke染料和Thilyte染料。
13.根据权利要求11所述的寡核苷酸,其包含2个不同的荧光团,1 个是FAM,另一个是ROX。
14.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中荧光团不插入双链DNA。
15.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其具有与靶多核苷酸序列互补 的序列。
16.根据权利要求15所述的寡核苷酸,其中靶多核苷酸序列选自如下 构成的组:包括其中任何基因或其等位基因的人基因组、包括其中任何基 因或其等位基因的小鼠基因组,包括其中任何基因或其等位基因的任何传 染病原的基因组;以及羊PrP基因(NM_001009481)。
17.根据权利要求16所述的寡核苷酸,其具有与以下人类基因或其等 位基因中任何一种互补的序列:
N-乙酰基转移酶2 X14672
因子V Leiden AY364535
因子II AF493953
MTHFR NM_005957
镰刀细胞贫血症AY356351;
和羊PrP基因(NM_001009481)。
18.根据权利要求16所述的寡核苷酸,其具有与以下传染病原的基因 组或其中任何基因或其等位基因互补的序列:
沙眼衣原体 X07547
腺病毒 AJ293905
流感A AY130766
肺炎链球菌 X52474
MRSA AJ810121。
19.根据权利要求16所述的寡核苷酸,其具有与基因的一个等位基因 完全互补的序列。
20.根据权利要求15所述的寡核苷酸,其具有与靶多核苷酸序列的完 全互补序列至少70%的序列同源性。
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