[发明专利]用于检测和/或鉴定微生物的方法

权利要求书

1、用于检测和/或鉴定试样中至少一种微生物或用于同时检测和/或鉴定试样中几种微生物的方法，其包括：

(a)提供疑为包含一种或多种目标微生物的试样；

(b)任选地，从所述试样中释放、分离和/或浓缩来自所述至少一种微生物的聚核酸，如果其存在于该试样中，所述的或每个所述的聚核酸包括至少部分tuf基因可变区；

(c)在足以发生杂交的条件下，使所述试样或来自所述试样的所述聚核酸与一个或多个源自所述tuf基因可变区的探针接触一段时间；和

(d)检测在步骤(c)中发生的任何杂交；

其中存在或不存在杂交表示所述试样中存在或不存在一种或多种所述微生物。

2、根据权利要求1的方法，其中在所述试样中的聚核酸是扩增的。

3、用于检测和/或鉴定试样中至少一种微生物或用于同时检测和/或鉴定试样中几种微生物的方法，其包括：

(a)任选地，从所述至少一种要检测的微生物中释放、分离和/或浓缩聚核酸；

(b)任选地，用至少一个引物对扩增来自所述微生物的至少部分tuf基因可变区；

(c)在足以发生杂交的条件下，使所述试样或来自所述试样的所述聚核酸与一个或多个源自所述tuf基因可变区的探针接触一段时间；和

(d)检测在步骤(c)中发生的任何杂交；

其中存在或不存在杂交表示在所述试样中存在或不存在所述一种或多种微生物。

4、根据权利要求3的方法，其中所述聚核酸源自如在SEQ IDNOs.：1至11中所示的tuf基因可变区。

5、根据权利要求3的方法，其中所述聚核酸基本上由SEQ IDNOs.：1至11的核苷酸108-220、393-591、708-774、792-816和/或885-945组成。

6、根据权利要求3的方法，其中所述聚核酸具有与如在SEQ IDNOs.：1至11中所示的tuf基因可变区反义的序列。

7、根据权利要求1至6中任一项的方法，其中接触所述试样的步骤包括至少部分tuf基因可变区与一组探针的杂交，所述探针包含至少一个选自下述序列的探针：SEQ ID NOs：12至84、208至251、254-315或330至393。

8、用于检测和/或鉴定试样中至少一种微生物或用于同时检测和/或鉴定试样中几种微生物的方法，其包括：

(a)任选地，从所述至少一种要检测的微生物中释放、分离和/或浓缩聚核酸；

(b)任选地，用至少一个引物对扩增来自所述微生物的至少部分tuf基因可变区；

(c)杂交至少部分来自所述微生物的tuf基因可变区与一组包括至少一个选自下述序列的探针：SEQ ID NOs：12至84、208至251、254-315或330至393；

(d)检测在步骤(c)中形成的杂交物；和

(e)鉴定来自步骤(d)的所述检测物中的所述至少一种微生物。

9、根据权利要求8的方法，其中至少一个探针选自SEQ ID NOs：12至84、208至315或330至393。

10、根据权利要求8的方法，其中至少一个探针选自SEQ ID NOs：12至392或393。

11、权利要求1至10中任一项的方法，其中被检测和/或鉴定的微生物选自博德特氏菌种、嗜衣原体菌种、嗜血杆菌种、军团杆菌种、支原体种、分支杆菌种、葡萄球菌种、链球菌种、假单胞菌种、莫拉氏菌种和梭杆菌种、窄食假单胞菌种、伯克霍尔德菌种、肠球菌种、棒状杆菌种或奈瑟氏菌种。