[发明专利]诊断食道癌的方法

权利要求书

1. 一种诊断受试者中食道癌或发生食道癌的倾向性的方法，包括确定来自患者的生物样品中食道癌相关基因的表达水平，其中所述样品中所述基因表达水平与正常对照表达水平相比增加或减少则表明所述受试者患有或者有风险发生食道癌。

2. 权利要求1的方法，其中所述食道癌相关基因选自由EC No.728-1543(表2)、1603-1679(表5)和1689-1716(表7)所示基因构成的群组，且其中所述样品中所述基因表达水平与正常对照表达水平相比增加则表明所述受试者患有或者有风险发生食道癌。

3. 权利要求2的方法，其中所述样品表达水平比所述正常对照水平至少高10％。

4. 权利要求1的方法，其中所述食道癌相关基因选自由EC No.1-727(表1)、1544-1602(表4)和1680-1688(表6)所示基因构成的群组，且其中所述样品中所述基因表达水平与正常对照表达水平相比减少则表明所述受试者患有或者有风险发生食道癌。

5. 权利要求4的方法，其中所述样品表达水平比所述正常对照水平至少低10％。

6. 权利要求1的方法，其中所述食道癌是食道鳞状细胞癌。

7. 权利要求1的方法，其中所述生物样品包括上皮细胞。

8. 权利要求1的方法，其中所述生物样品包括食道癌细胞。

9. 权利要求1的方法，其中所述生物样品包括来自食道癌的上皮细胞。

10. 权利要求1的方法，其中所述方法还包括确定多个食道癌相关基因的表达水平。

11. 权利要求1的方法，其中通过选自下组的方法确定基因表达水平：

(a)检测食道癌相关基因的mRNA，

(b)检测食道癌相关基因编码的蛋白质，和

(c)检测食道癌相关基因编码的蛋白质的生物学活性。

12. 权利要求10的方法，其中所述检测是在DNA阵列上进行的。

13. 一种食道癌参照表达模式，包括两种或多种食道癌相关基因的基因表达图式，其中所述食道癌相关基因选自EC No.1-1716的基因。

14. 一种筛选用于治疗或预防食道癌的化合物的方法，所述方法包括下列步骤：

(a)使试验化合物与由选自EC No.1-1716的基因的多核苷酸所编码的多肽相接触；

(b)检测多肽和试验化合物之间的结合活性；和

(c)选择与多肽结合的试验化合物。

15. 一种筛选用于治疗或预防食道癌的化合物的方法，所述方法包括下列步骤：

(a)使候选化合物与表达一种或多种标志物基因的细胞相接触；其中所述一种或多种标志物基因选自EC No.1-1716的基因；和

(b)选择这样的候选化合物：与不存在该候选化合物的条件下检测到的表达水平相比，其降低选自EC No 728-1543(表2)、1603-1679(表5)和1689-1716(表7)所示基因中的一种或多种标志物基因的表达水平，或者其提高选自EC No.1-727(表1)、1544-1602(表4)、和1680-1688(表6)所示基因中的一种或多种标志物基因的表达水平。

16. 权利要求15的方法，其中所述细胞包括食道癌细胞。

17. 一种筛选用于治疗或预防食道癌的化合物的方法，所述方法包括下列步骤：

(a)使试验化合物与由选自EC No.1-1716的基因的多核苷酸所编码的多肽相接触；

(b)检测步骤(a)的多肽的生物学活性；和

(c)选择这样的候选化合物，与不存在该候选化合物的条件下检测到的生物学活性相比，其抑制选自EC No 728-1543(表2)、1603-1679(表5)和1689-1716(表7)所示基因的多核苷酸所编码的多肽的生物学活性，或者其增强选自EC No.1-727(表1)、1544-1602(表4)和1680-1688(表6)所示基因的多核苷酸所编码的多肽的生物学活性。