[发明专利]鉴定、合成、优化和表征蛋白调节剂的化合物和方法无效
申请号: | 200680051498.8 | 申请日: | 2006-11-24 |
公开(公告)号: | CN101370944A | 公开(公告)日: | 2009-02-18 |
发明(设计)人: | 杰勒德·M·豪斯 | 申请(专利权)人: | 杰勒德·M·豪斯 |
主分类号: | C12Q1/50 | 分类号: | C12Q1/50 |
代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 | 代理人: | 顾颂逦 |
地址: | 美国*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 合成 优化 表征 蛋白 调节剂 化合物 方法 | ||
1.鉴定与第一化合物相比具有改进细胞特异性的化合物的方法, 所述第一化合物为蛋白质的抑制剂并调节相应的表型反应,包括:
a)测量用所述第一化合物处理过的测试细胞的表型反应的调节;
b)测量用所述第一化合物处理过的对照细胞的表型反应的调节
c)测量用受试化合物处理过的测试细胞的表型反应的调节;
d)测量用受试化合物处理过的对照细胞的表型反应的调节;
e)确定第一化合物的细胞特异性缺口和受试化合物的细胞特异 性缺口;
和f)如果所述受试化合物的细胞特异性缺口大于所述第一化合 物的细胞特异性缺口,则鉴定所述受试化合物具有改进的细胞特异性。
2.权利要求1的方法,其中细胞特异性缺口由所述对照细胞的 IC50除以所述测试细胞的IC50来确定。
3.鉴定与第一化合物相比具有改进的细胞特异性的化合物的方 法,所述第一化合物为蛋白质的活化剂并调节相应的表型反应,包括:
a)测量用所述第一化合物处理过的测试细胞的表型反应的调节;
b)测量用所述第一化合物处理过的对照细胞的表型反应的调节;
c)测量用受试化合物处理过的测试细胞的表型反应的调节;
d)测量用受试化合物处理过的对照细胞的表型反应的调节;
e)确定第一化合物的细胞特异性缺口和受试化合物的细胞特异 性缺口;
和f)如果所述受试化合物的细胞特异性缺口大于所述第一化合 物的细胞特异性缺口,则鉴定所述受试化合物具有改进的细胞特异性。
4.权利要求3的方法,其中所述细胞特异性缺口由所述测试细胞 的IC50除以所述对照细胞的IC50来确定。
5.改进第一化合物优化的方法,所述第一化合物为蛋白质的抑制 剂并调节相应的表型反应,包括:
a)测量所述第一化合物对测试细胞的表型反应的IC50;
b)测量所述第一化合物对对照细胞的表型反应的IC50;
c)测量具有与所述第一化合物相同骨架的受试化合物对所述测 试细胞的表型反应的IC50;
d)测量所述受试化合物对所述对照细胞的表型反应的IC50;
和e)如果所述测试化合物的细胞特异性缺口大于所述第一化合 物的细胞特异性缺口,则鉴定所述受试化合物为所述第一化合物的改 进。
6.权利要求5的方法,其中蛋白质是P210Bcr-Ab1-T315I或p190Bcr-Ab1, 其在相应的氨基酸位点包含相应苏氨酸到异亮氨酸的突变。
7.改进第一化合物优化的方法,所述第一化合物为蛋白质的活化 剂并调节相应的表型反应,包括:
a)测量所述第一化合物对测试细胞的表型反应的IC50;
b)测量所述第一化合物对对照细胞的表型反应的IC50;
c)测量具有与所述第一化合物相同骨架的受试化合物对所述测 试细胞的表型反应的IC50;
d)测量所述受试化合物对所述对照细胞的表型反应的IC50;
和e)如果所述测试化合物的细胞特异性缺口大于所述第一化合 物的细胞特异性缺口,则鉴定受试化合物为第一化合物的改进。
8.权利要求5-7中任一项的方法,其包括选择步骤(e)的优化化 合物并重复步骤(a)-(d)。
9.权利要求5-7中任一项的方法,其中所述蛋白质为 theramutein。
10.权利要求5-7中任一项的方法,其中所述受试化合物的IC50高于所述第一化合物。
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