[发明专利]结肠直肠癌的预后预测有效

专利信息
申请号: 200680052902.3 申请日: 2006-12-22
公开(公告)号: CN101389957A 公开(公告)日: 2009-03-18
发明(设计)人: H·纳卡尔达;J·弗里德里希斯;B·霍尔茨曼;R·罗森贝格;A·E·里夫;M·A·布拉克;J·L·麦考尔;Y-H·林;R·C·波洛克 申请(专利权)人: 环太平洋生物技术有限公司
主分类号: G01N33/50 分类号: G01N33/50;G01N33/53;G06F19/00;C12Q1/68;G01N33/68
代理公司: 永新专利商标代理有限公司 代理人: 康 健;林晓红
地址: 新西兰*** 国省代码: 新西兰;NZ
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摘要:
搜索关键词: 结肠 直肠癌 预后 预测
【权利要求书】:

1.预后信号在制备用于判断CRC发展的诊断工具中的用途,所述预后 信号由FAS和ME2基因组成。

2.预后信号在制备用于判断CRC发展的诊断工具中的用途,所述预后 信号由FAS和ME2基因和选自表1和2的一或多种基因组成。

3.如权利要求2所述的用途,其中所述预后信号选自表9中的任一信号。

4.一种判断CRC预后的装置,其包括:其上有一个或多个位点的基片, 每个位点上有预后信号的基因的寡核苷酸,所述预后信号由FAS和ME2基 因组成。

5.根据权利要求4所述装置,其中所述预后信号还由选自表1和2的一 或多种基因组成。

6.根据权利要求5所述装置,其中所述预后信号是选自表9中的任一预 后信号。

7.用于测定由FAS和ME2基因组成的预后信号的表达水平的试剂在制 备用于通过以下方法判断患者CRC预后的试剂盒中的用途,所述方法包括 以下步骤:

(i)测定患者CRC肿瘤样品中由FAS和ME2基因组成的预后信号 的表达水平;

(ii)应用预测模型,所述模型是通过将预测方法应用于复发和不复 发肿瘤样品中预测信号的表达水平而建立的;

(iii)确定预后。

8.根据权利要求7所述用途,其中所述预后信号还由选自表1和2的一 或多种基因组成。

9.根据权利要求8所述用途,其中信号选自表9中的任一预后信号。

10.根据权利要求7所述用途,其中所述预测方法选自线性模型(linear  model),支持矢量机(support vector machine),神经网络(neural networks),分 类和回归树(classification and regression trees),集结学习方法(ensemble  learning methods),差异分析(discriminant analysis),最近邻法(nearest neighbor  method),贝叶斯网络(Bayesian networks),独立成分分析(independent  components analysis)组成的组。

11.根据权利要求7-10任一所述的用途,其中测定预后信号表达水平 的步骤是通过检测每种基因的mRNA表达水平来进行的。

12.根据权利要求7-10任一所述的用途,其中测定预后信号表达水平 的步骤是通过检测每种基因的cDNA表达水平来进行的。

13.根据权利要求12所述的用途,其中测定预后信号表达水平的步骤 是利用与所述cDNA的至少一部分互补的核苷酸来进行的。

14.根据权利要求11所述的用途,其中测定预后信号表达水平的步骤 是通过使用qPCR方法来进行的,其中所述qPCR方法利用正向引物和反向 引物。

15.根据权利要求11所述的用途,其中测定预后信号表达水平的步骤 使用权利要求4-6任一所述的装置来进行的。

16.根据权利要求7-10任一所述用途,其中测定预后信号表达水平的 步骤是通过检测每种基因的蛋白表达水平来进行的。

17.根据权利要求7-10任一所述用途,其中测定预后信号表达水平的 步骤是通过检测每种基因的肽表达水平来进行的。

18.根据权利要求16所述用途,其中所述的检测步骤利用针对每种基 因的蛋白的抗体来进行。

19.根据权利要求17所述用途,其中所述的检测步骤利用针对每种基 因的肽的抗体来进行。

20.根据权利要求16所述用途,其中所述检测步骤利用夹心免疫测定 法(sandwich-type immunoassay method)来进行。

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