[发明专利]结肠直肠癌的预后预测有效
申请号: | 200680052902.3 | 申请日: | 2006-12-22 |
公开(公告)号: | CN101389957A | 公开(公告)日: | 2009-03-18 |
发明(设计)人: | H·纳卡尔达;J·弗里德里希斯;B·霍尔茨曼;R·罗森贝格;A·E·里夫;M·A·布拉克;J·L·麦考尔;Y-H·林;R·C·波洛克 | 申请(专利权)人: | 环太平洋生物技术有限公司 |
主分类号: | G01N33/50 | 分类号: | G01N33/50;G01N33/53;G06F19/00;C12Q1/68;G01N33/68 |
代理公司: | 永新专利商标代理有限公司 | 代理人: | 康 健;林晓红 |
地址: | 新西兰*** | 国省代码: | 新西兰;NZ |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 结肠 直肠癌 预后 预测 | ||
1.预后信号在制备用于判断CRC发展的诊断工具中的用途,所述预后 信号由FAS和ME2基因组成。
2.预后信号在制备用于判断CRC发展的诊断工具中的用途,所述预后 信号由FAS和ME2基因和选自表1和2的一或多种基因组成。
3.如权利要求2所述的用途,其中所述预后信号选自表9中的任一信号。
4.一种判断CRC预后的装置,其包括:其上有一个或多个位点的基片, 每个位点上有预后信号的基因的寡核苷酸,所述预后信号由FAS和ME2基 因组成。
5.根据权利要求4所述装置,其中所述预后信号还由选自表1和2的一 或多种基因组成。
6.根据权利要求5所述装置,其中所述预后信号是选自表9中的任一预 后信号。
7.用于测定由FAS和ME2基因组成的预后信号的表达水平的试剂在制 备用于通过以下方法判断患者CRC预后的试剂盒中的用途,所述方法包括 以下步骤:
(i)测定患者CRC肿瘤样品中由FAS和ME2基因组成的预后信号 的表达水平;
(ii)应用预测模型,所述模型是通过将预测方法应用于复发和不复 发肿瘤样品中预测信号的表达水平而建立的;
(iii)确定预后。
8.根据权利要求7所述用途,其中所述预后信号还由选自表1和2的一 或多种基因组成。
9.根据权利要求8所述用途,其中信号选自表9中的任一预后信号。
10.根据权利要求7所述用途,其中所述预测方法选自线性模型(linear model),支持矢量机(support vector machine),神经网络(neural networks),分 类和回归树(classification and regression trees),集结学习方法(ensemble learning methods),差异分析(discriminant analysis),最近邻法(nearest neighbor method),贝叶斯网络(Bayesian networks),独立成分分析(independent components analysis)组成的组。
11.根据权利要求7-10任一所述的用途,其中测定预后信号表达水平 的步骤是通过检测每种基因的mRNA表达水平来进行的。
12.根据权利要求7-10任一所述的用途,其中测定预后信号表达水平 的步骤是通过检测每种基因的cDNA表达水平来进行的。
13.根据权利要求12所述的用途,其中测定预后信号表达水平的步骤 是利用与所述cDNA的至少一部分互补的核苷酸来进行的。
14.根据权利要求11所述的用途,其中测定预后信号表达水平的步骤 是通过使用qPCR方法来进行的,其中所述qPCR方法利用正向引物和反向 引物。
15.根据权利要求11所述的用途,其中测定预后信号表达水平的步骤 使用权利要求4-6任一所述的装置来进行的。
16.根据权利要求7-10任一所述用途,其中测定预后信号表达水平的 步骤是通过检测每种基因的蛋白表达水平来进行的。
17.根据权利要求7-10任一所述用途,其中测定预后信号表达水平的 步骤是通过检测每种基因的肽表达水平来进行的。
18.根据权利要求16所述用途,其中所述的检测步骤利用针对每种基 因的蛋白的抗体来进行。
19.根据权利要求17所述用途,其中所述的检测步骤利用针对每种基 因的肽的抗体来进行。
20.根据权利要求16所述用途,其中所述检测步骤利用夹心免疫测定 法(sandwich-type immunoassay method)来进行。
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