[发明专利]谷氨酰胺合成酶活性的调节

权利要求书

1.一种产生谷氨酰胺合成酶多肽的谷氨酰胺形成活性位点活性的试 验抑制剂的计算机辅助方法，所述方法使用包括处理器和输入设备的程 序式计算机，所述方法包括：

(a)向所述输入设备输入包括谷氨酰胺形成活性位点结构的数据；

(b)使用所述处理器将试验抑制剂分子对接到所述谷氨酰胺形成活 性位点内；以及

(c)基于所述对接，确定所述试验抑制剂分子是否抑制所述谷氨酰 胺形成活性位点的活性。

2.根据权利要求1所述的方法，进一步包括将γ-谷氨酰磷酸部分对 接到所述活性位点内。

3.根据权利要求1所述的方法，进一步包括生成由步骤(c)确定 的试验抑制剂以抑制所述谷氨酰胺形成活性位点的活性并体外评价所述 试验抑制剂对谷氨酰胺合成酶多肽的抑制活性。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述体外评价包括使用能测量 ATP水解、ADP形成、AMP形成、谷氨酸利用或谷氨酰胺形成的分析法。

5.根据权利要求3所述的方法，进一步包括体外评价相对于去腺苷 酰化的谷氨酰胺合成酶多肽，所述试验抑制剂对腺苷酰化的谷氨酰胺合 成酶多肽有差别的抑制活性。

6.根据权利要求1所述的方法，进一步包括生成所述试验抑制剂并 评价所述试验抑制剂对含有GSI-α或GSI-β谷氨酰胺合成酶基因的细菌 生长的抑制活性。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述GSI-β细菌选自GSI-β细 菌可选自白喉棒状杆菌、淋球菌、大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏杆菌、伤寒 沙门氏杆菌、肺炎克雷伯菌、粘质沙雷氏菌、普通变形杆菌、痢疾志贺 菌、霍乱弧菌、铜绿假单孢菌、粪产碱杆菌、幽门螺杆菌、流感嗜血杆 菌、百日咳杆菌、支气管炎博德特菌、脑膜炎奈瑟菌、羊布鲁氏菌、结 核分枝杆菌、麻风分枝杆菌、梅毒密螺旋体、问号钩端螺旋体、衣氏放 线菌、星形诺卡菌、氧化亚铁硫杆菌、巴西固氮螺菌、鱼腥藻、Fremyella diplosiphon和天蓝色链霉菌，以及其中所述GSI-α细菌可选自蜡状芽孢 杆菌、枯草芽孢杆菌、炭疽芽孢杆菌、肺炎链球菌、化脓链球菌、金黄 色葡萄球菌、肉毒梭菌、破伤风梭菌和产气荚膜梭菌。

8.根据权利要求7所述的方法，其中所述GSI-β细菌是结核分枝杆 菌。

9.根据权利要求6所述的方法，进一步包括评价所述试验抑制剂对 真核细胞生长的抑制活性。

10.根据权利要求9所述的方法，其中所述真核细胞是哺乳动物细 胞。

11.一种产生抑制谷氨酰胺合成酶多肽的谷氨酰胺形成活性位点活 性的化合物的方法，所述方法包括：

(a)提供谷氨酰胺合成酶多肽的谷氨酰胺形成活性位点的三维结 构；以及

(b)基于所述三维结构，设计能抑制所述谷氨酰胺形成活性位点和 γ-谷氨酰磷酸中间体之间相互作用的试验化合物。

12.根据权利要求11所述的方法，其中所述试验化合物能抑制所述 谷氨酰胺形成活性位点的腺苷酰化催化三联体位点和γ-谷氨酰磷酸中间 体之间的相互作用，或者能抑制所述谷氨酰胺形成活性位点的去腺苷酰 化催化三联体位点和γ-谷氨酰磷酸中间体之间的相互作用。

13.根据权利要求11所述的方法，其中所述试验化合物能抑制在所 述谷氨酰胺形成活性位点的腺苷酰化催化三联体位点中酰基-酶中间体 的形成，或者能抑制在所述谷氨酰胺形成活性位点的去腺苷酰化催化三 联体位点中酰基-酶中间体的形成。

14.根据权利要求12或13所述的方法，进一步包括生成步骤(b) 的所述试验化合物并体外评价所述试验化合物对谷氨酰胺合成酶多肽的 抑制活性。

15.根据权利要求12或13所述的方法，进一步包括生成步骤(b) 的所述试验化合物并评价所述试验化合物对含有GSI-α或GSI-β谷氨酰 胺合成酶基因的细菌生长的抑制活性。