[发明专利]一种土壤微生物基因组DNA提取方法无效
申请号: | 200710012539.9 | 申请日: | 2007-08-22 |
公开(公告)号: | CN101372689A | 公开(公告)日: | 2009-02-25 |
发明(设计)人: | 苏振成;张惠文;李新宇;吴敏娜;张成刚 | 申请(专利权)人: | 中国科学院沈阳应用生态研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/31 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 | 代理人: | 许宗富;周秀梅 |
地址: | 110016辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 土壤 微生物 基因组 dna 提取 方法 | ||
1.一种土壤微生物基因组DNA提取方法,其特征在于按如下步骤 操作:
1)初步裂解微生物细胞:取土壤样品与石英沙相混合放入含有 850-1000μl提取缓冲液的离心管中,其中土壤样品与石英沙重量比 为1∶0.5-2;而后将离心管置于核酸提取仪内振荡40-60秒,或在 涡旋混合器上振荡10-20分钟,得到初步裂解液;所述称取的待测土 样重量为0.3-0.8g;提取缓冲液为:50-120mM Tris-HCl、50-120 mM EDTA和1.0-1.6M NaCl;
2)进一步裂解微生物细胞:将50-100μl浓度为100mg/ml的溶 菌酶加入初步裂解液中混匀,在30-40℃温浴30-60分钟后,再加入 75-125μl 20%(w/v)的SDS,混匀,再在60-70℃温浴30-60分钟, 10000-12000转/分钟离心10-20分钟,收集上清;
3)土壤微生物基因组DNA:将收集的上清液经分离纯化得粗提 DNA溶液,而后将粗提DNA溶液纯化,即得土壤微生物基因组DNA;
所述步骤2)分离后的上清液内加入其0.1-0.3倍体积的5-10M KAc,冰浴20-60分钟后,12000-14000转/分钟离心10-20分钟,收 集上清,而后在上清液中加入其0.3-0.7倍体积的20%-60%(w/v)聚 乙二醇溶液和0.1-0.3倍体积的5M-15M NaCl溶液,混匀,室温放置 30分钟,离心收集DNA沉淀,70%(v/v)乙醇洗涤沉淀,自然干燥后, 加入500-700μl TE溶解,得到粗提DNA溶液,其中聚乙二醇分子量 为6000-10000;
所述粗提DNA溶液纯化,是将所得粗提DNA溶液用与其等体积的 酚、氯仿和异戊醇的混合液抽提,取上层水相;而后再用与上层水相 等体积的氯仿和异戊醇的混合液抽提,取上层水相;而后加入0.1-0.2 倍体积的3M NaAc溶液和0.6-1.0倍体积的异丙醇溶液,混匀后室温 放置30-60分钟,离心收集DNA沉淀,70%(v/v)乙醇洗涤沉淀,自 然干燥后,加入30-50μTE溶解,得到DNA溶液;其中:酚、氯仿和 异戊醇按体积份数比为25∶24∶1,氯仿和异戊醇按体积份数比为24∶ 1。
2.按权利要求1所述的土壤微生物基因组DNA提取方法,其特征 在于:所述提取缓冲液为:100mM Tris-HCl,100mM EDTA和1.5M NaCl。
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