[发明专利]HLA-B27基因分型用微阵列芯片的制备及其用法有效
申请号: | 200710029305.5 | 申请日: | 2007-07-24 |
公开(公告)号: | CN101353693A | 公开(公告)日: | 2009-01-28 |
发明(设计)人: | 胡守旺;张帆;王敏;李明;程钢;何蕴韶 | 申请(专利权)人: | 中山大学达安基因股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
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地址: | 510665广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hla b27 基因 分型用微 阵列 芯片 制备 及其 用法 | ||
所属技术领域
本发明涉及一种临床检测用途的基因检测试剂盒,尤其是涉及DNA微阵列芯片,该试剂盒能够高通量、高效率、高特异性对人类白细胞抗原B27基因进行分型。
技术背景
HLA(Human leukocyte antigen,人类白细胞抗原)是人类主要组织相容性系统。组织相容性是指不同个体间进行组织或器官移植时,供者和受者双方接受的程度。供受者组织不相容引起的反应,被证实是一种免疫反应,它是由细胞表面同种异型抗原诱导的,这个代表个体特异性的抗原称移植抗原或组织相容性抗原,其中起主要作用的抗原称主要组织相容性系统(MHS),HLA(人类白细胞抗原)就是人类的主要组织相容性系统。HLA基因复合体位于人类第6号染色体6p21.3区域,具有高度单核苷酸多态性(SNPs)。HLA存在多个基因座位,每个基因座位有可以分为多种型别、亚型和等位基因。
HLA的生物学和医学意义包括免疫学反应、器官移植排除反应和疾病关联性等等。在疾病关联性方面,1972年Russel第一个报告银屑病(牛皮癣)患者携带HLA-B13或HLA-B17。此后陆续发现大量其它疾病与特定的HLA相关,其中,HLA-B27抗原见于大约90%的强直性脊椎炎病人,以至使HLA分型具有了诊断价值,甚至,能较早地证实疾病亚型之间的临床区别。例如,寻常银屑病与HLA相关,而脓疱性银屑病则不然;青少年性胰岛素依赖型糖尿病与HLA-B8、HLA-Bw15和HLA-B18相关,而晚期发作型糖尿病并无这种相关;常染色体隐性遗传的肾上腺皮质增生症是由于21-羟化酶缺乏。应用HLA抗原多态性作群体关联分析和家系连锁分析,发现有两个羟化酶位点(21-OHA和21-OHB)与HLA-B、DR紧密连锁,依此,可用HLA作出产前诊断。在优生学中,可以根据现有资料,对某些疾病推算出孩子患病的相对风险率。另一方面,关于HLA与长寿的关系,亦形成一个研究热点。因此,特定类型的HLA便成为某些疾病的遗传标志。HLA-DR4与风湿性和类风湿性炎症的关联性研究进展很快,目前已经受到医学界广泛关注,并开始将HLA-DR4检测用于临床辅助诊断。
HLA-B27基因型别属于HLA-B基因座位的一个大型,即HLA-B*27型。在HLA-B*27大型中,又可以分为2701-2727众多的亚型和等位基因型。
强直性脊柱炎(Ankylosing spondylitis简称AS)又名类风湿脊柱炎。现代医学认为该病是一种慢性、进行性和炎性疾病,病变部位主要在骶髂关节、脊柱、脊柱旁软组织及四肢关 节。病变常自骶髂关节开始,逐渐向上蔓延到脊柱及脊旁组织,最后引起骨性强直。强直性脊柱炎是一种病废率相当高的一种疾病,晚期强直性脊柱炎病情不能逆转,不但使病人失去就业和工作能力,对家庭和社会来说也是一个沉重的负担。但按照现行的诊断标准,一旦确诊为强直性脊柱炎,其病程均已进入晚期。因此,早期诊断已成为当务之急。
强直性脊柱炎的病因尚未完全明确。但是该病与人类白细胞抗原B27(HLA-B27)的关系非常密切。在强直性脊柱炎患者中发生率可高达90%以上,而在普通人中仅有3%为阳性。HLA-B27阳性携带者患强直性脊柱炎的相对风险为87.4:1。中国人HLA-B27阳性比例约为3%,AS患病率约为0.2%,提示存在HLA-B27以外的遗传因素或外因与AS患病有关。最近研究表明,HLA-B27存在许多基因亚型,目前发现的至少有27种,各种基因亚型在各民族人群中分布比例不同。与AS患病密切相关也仅仅是数个HLA-B27基因亚型,大部分HLA-B27基因亚型与AS患病无关。这项研究发现揭示了,当前HLA-B27阳性率和AS患病率间巨大差距的原因,以及各民族间AS患病率差异性原因。Cipriani等对Zulian人群HLA-B27基因亚型研究发现,AS患病者主要是B2705(68.8%)和B2702(31.2%),正常人群HLA-B27基因亚型主要是B2708。Sampaio-Barros等对比利时AS患者研究发现,HLA-B2705是主要携带分子,占92.5%,B2706、B2707与AS发病无关。台湾本土的强直性脊柱炎患者,HLA-B27阳性比率高达95%,而其中2704亚型占了绝大多数(89%),另外少数为2705型(11%)。
近10年,HLA-B27的四联结构常被误认为是唯一可能的致病结构,并成为许多研究的基础。HLA-B27介导关节炎不仅通过其HLA-I类分子结构,还与其轻链和游离重链的形式多为二聚体结构有关。HLA-B27各亚型间有1~7个氨基酸的区别,各亚型与AS相关的程度的研究结果如下:
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