[发明专利]金黄色葡萄球菌检测用引物、检测方法、检测试剂盒无效

专利信息
申请号: 200710030439.9 申请日: 2007-09-21
公开(公告)号: CN101153329A 公开(公告)日: 2008-04-02
发明(设计)人: 魏泉德;张彩虹;谭爱军;张丽荣 申请(专利权)人: 珠海市疾病预防控制中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 广州新诺专利商标事务所有限公司 代理人: 杨焕军
地址: 519000广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 金黄色 葡萄球菌 检测 引物 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种金黄色葡萄球菌检测用引物,其特征在于,能扩增靶基因的特异碱基序列,所述靶基因为金黄色葡萄球菌的nuc---GenBank登陆号:V01281,所述引物与所述靶基因的548位---795位的核酸序列的一部分或其互补链互补。

2.一种金黄色葡萄球菌检测用引物组,其特征在于,所述引物组由下列引物组成:

正向外引物F3-nuc    GTCAACCAATGACATTCAGAC

反向外引物B3-nuc    AACTTTAGCCAAGCCTTGA

正向内引物FIP-nuc   ATGCACTTGCTTCAGGACCACACCTGAAACAAAGCATCC

反向内引物BIP-nuc

GAAGTCGAGTTTGACAAAGGTCAAACGTTTACCATTTTTCCATCAGC

可以扩增金黄色葡萄球菌的nuc基因序列的548位---795位的核酸序列的一部分或其互补链。

3.根据权利要求2所述的一种金黄色葡萄球菌检测用引物组,其特征在于,所述引物组可以扩增金黄色葡萄球菌的如下片断或互补链:

所述正向外引物F3:扩增始于548-568bp;

所述正向内引物FIP:扩增始于624-643bp的互补序列和584-602bp;

所述反向外引物B3:扩增始于777-795bp的互补序列;

反向内引物BIP:扩增始于679-703bp,和742-763bp的互补序列。

4.一种金黄色葡萄球菌的检测方法,该方法用于检测标本中是否存在金黄色葡萄球菌,其特征在于,以金黄色葡萄球菌的nuc基因序列的548位---795位的核酸序列的一部分或其互补链为靶,通过LAMP法用上述引物组选择性扩增上述靶区域,确认是否存在有扩增产物。

5.根据权利4所述的金黄色葡萄球菌的检测方法,其特征在于,所述检测方法具体为:

1)样品处理和模板提取,样品范围适用于食品样品、粪便、呕吐物等标本;细菌待检标本用相应肠道增菌液增菌培养8-12小时后,取1.0ml增菌液10000rpm离心2分钟,弃其上清液后,用DNA提取试剂盒提取模板DNA或加20~30ul三蒸水煮沸5分钟,再取2ul上清液做待检模板DNA;

2)金黄色葡萄球菌的环介导等温扩增

取扩增反应液,先加待检模板,再加酶,最后加双蒸水,形成如下总体积为20ul~100ul的反应体系,混匀点离后在约60-65℃条件下恒温保温约60-90分钟,然后置于80℃的环境下2分钟灭活酶;

反应总体积20ul~100ul的反应体系:

  成分  终浓度或量  待检模板  核酸模板  1-10ul   扩  增  反  应  液  正向内引物FIP-nuc  反向内引物BIP-nuc  正向外引物F3-nuc  反向外引物B3-nuc  甜菜碱betaine  dNTP  mgsO4  反应缓冲液Bst DNA Polymerase Buffer 10×  1.0-2.0uM  1.0-2.0uM  0.15-0.3uM  0.15-0.3uM  0.8-1.5M  1.0-1.6mM  2-6mM  1/10反应体积(ul)  酶  Bst DNA Polymerase  0.16-0.64U/ul  双蒸水  ddH2O  加至预定反应体积(ul)

其中10×Bst DNA Polymerase Buffer反应缓冲液含有200mM pH 8.8的三羟基甲硫氨酸甲烷-盐酸、100mM氯化钾、100mM硫酸铵、20mM硫酸镁和1%曲拉通X-100;

所述酶为每微升含8-16个活性单位的Bst DNA酶;

3)LAMP反应产物的检测:

A)肉眼检测:与阴性对照管比较显示,检测管出现明显浑浊为阳性,未见浑浊为阴性;或,

B)加染料后检测:每25ul体系的反应管加1000×SYBR Green I Invitrogen1-2ul,1-5分钟观察结果,反应液变绿为阳性,保持无色或棕色为阴性;或,

C)电泳检测:2-3%琼脂糖凝胶,70V电泳约60-100分钟,电泳图片显示LAMP特征性梯状条带,最小片段在190bp左右,则结果为阳性;如无任何条带则结果为阴性。

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