[发明专利]金黄色葡萄球菌检测用引物、检测方法、检测试剂盒无效
申请号: | 200710030439.9 | 申请日: | 2007-09-21 |
公开(公告)号: | CN101153329A | 公开(公告)日: | 2008-04-02 |
发明(设计)人: | 魏泉德;张彩虹;谭爱军;张丽荣 | 申请(专利权)人: | 珠海市疾病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 杨焕军 |
地址: | 519000广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 金黄色 葡萄球菌 检测 引物 方法 试剂盒 | ||
1.一种金黄色葡萄球菌检测用引物,其特征在于,能扩增靶基因的特异碱基序列,所述靶基因为金黄色葡萄球菌的nuc---GenBank登陆号:V01281,所述引物与所述靶基因的548位---795位的核酸序列的一部分或其互补链互补。
2.一种金黄色葡萄球菌检测用引物组,其特征在于,所述引物组由下列引物组成:
正向外引物F3-nuc GTCAACCAATGACATTCAGAC
反向外引物B3-nuc AACTTTAGCCAAGCCTTGA
正向内引物FIP-nuc ATGCACTTGCTTCAGGACCACACCTGAAACAAAGCATCC
反向内引物BIP-nuc
GAAGTCGAGTTTGACAAAGGTCAAACGTTTACCATTTTTCCATCAGC
可以扩增金黄色葡萄球菌的nuc基因序列的548位---795位的核酸序列的一部分或其互补链。
3.根据权利要求2所述的一种金黄色葡萄球菌检测用引物组,其特征在于,所述引物组可以扩增金黄色葡萄球菌的如下片断或互补链:
所述正向外引物F3:扩增始于548-568bp;
所述正向内引物FIP:扩增始于624-643bp的互补序列和584-602bp;
所述反向外引物B3:扩增始于777-795bp的互补序列;
反向内引物BIP:扩增始于679-703bp,和742-763bp的互补序列。
4.一种金黄色葡萄球菌的检测方法,该方法用于检测标本中是否存在金黄色葡萄球菌,其特征在于,以金黄色葡萄球菌的nuc基因序列的548位---795位的核酸序列的一部分或其互补链为靶,通过LAMP法用上述引物组选择性扩增上述靶区域,确认是否存在有扩增产物。
5.根据权利4所述的金黄色葡萄球菌的检测方法,其特征在于,所述检测方法具体为:
1)样品处理和模板提取,样品范围适用于食品样品、粪便、呕吐物等标本;细菌待检标本用相应肠道增菌液增菌培养8-12小时后,取1.0ml增菌液10000rpm离心2分钟,弃其上清液后,用DNA提取试剂盒提取模板DNA或加20~30ul三蒸水煮沸5分钟,再取2ul上清液做待检模板DNA;
2)金黄色葡萄球菌的环介导等温扩增
取扩增反应液,先加待检模板,再加酶,最后加双蒸水,形成如下总体积为20ul~100ul的反应体系,混匀点离后在约60-65℃条件下恒温保温约60-90分钟,然后置于80℃的环境下2分钟灭活酶;
反应总体积20ul~100ul的反应体系:
其中10×Bst DNA Polymerase Buffer反应缓冲液含有200mM pH 8.8的三羟基甲硫氨酸甲烷-盐酸、100mM氯化钾、100mM硫酸铵、20mM硫酸镁和1%曲拉通X-100;
所述酶为每微升含8-16个活性单位的Bst DNA酶;
3)LAMP反应产物的检测:
A)肉眼检测:与阴性对照管比较显示,检测管出现明显浑浊为阳性,未见浑浊为阴性;或,
B)加染料后检测:每25ul体系的反应管加1000×SYBR Green I Invitrogen1-2ul,1-5分钟观察结果,反应液变绿为阳性,保持无色或棕色为阴性;或,
C)电泳检测:2-3%琼脂糖凝胶,70V电泳约60-100分钟,电泳图片显示LAMP特征性梯状条带,最小片段在190bp左右,则结果为阳性;如无任何条带则结果为阴性。
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