[发明专利]嘌呤类药物敏感基因检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 200710043225.5 申请日: 2007-06-29
公开(公告)号: CN101333560A 公开(公告)日: 2008-12-31
发明(设计)人: 穆海东;汪宁梅;杜喜玲 申请(专利权)人: 上海裕隆生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 200233上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 嘌呤 类药物 敏感 基因 检测 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明属于临床检测的基因芯片技术领域,具体地说涉及一种嘌呤类药物敏感基因检测 试剂盒。

背景技术

目前研究结果表明,治疗急性淋巴细胞白血病的巯嘌呤代谢药物——6-巯基嘌呤和6-巯代 鸟嘌呤均是无内在生物活性的药物,必须通过体内一系列代谢后才能发挥药效。而人体的巯基 嘌呤甲基转移酶(TPMT)的代谢酶在此类药物代谢和抗白血病作用中起关键作用。TPMT上含 有的突变位点与人体对嘌呤类药物的敏感性有关。

目前用于检测5氟尿嘧啶单位点突变的方法主要有:测序法,这是最直接,最准确的方 法,;荧光定量PCR法,和单碱基延伸法。这些方法所需要的设备仪器都价格昂贵,技术复杂, 从经济上考虑不适于用作常规方法加以推广。

发明内容

为了对嘌呤类药物敏感的相关基因进行平行检测,对大量样本进行同时分析,并考虑经 济推广的可行性,本发明选择TPMT的三个突变位点作为检测对象,提供一种嘌呤类药物敏 感基因芯片检测试剂盒,包括抽提液、杂交缓冲液、洗液、扩增液、Taq酶、基因芯片;其 特征在于,所含的扩增液含有扩增巯基嘌呤甲基转移酶(TPMT)基因上3个突变位点序列的引 物,3个突变位点分别是238,460和719。

所述的嘌呤类药物敏感基因检测试剂盒,其特征在于,扩增液可以包含以下一组序列的 引物:

238-1:TGAAACCCTATGAACCTG

238-2:TCCAGGAATTTCGGTGT

460-1:GTTGAAGTACCAGCATG

460-2:CCTGGATTGATGGCAA

719-1:GGTTGATGCTTTTGAAGAA

719-2:CAATCTGCAAGACACATAG

所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,还可以包括扩增液B,扩增 液B中包含如下一组序列的ASPE(Allele-Specific Primer Extension,即等位基因特特性引物 延伸)引物:

238-G:5’-ATTTTATGCAGGTTTG

238-C:5’-ATTTTATGCAGGTTTC

460-G:5’-GGATAGAGGAG

460-A:5’-GGGATAGAGGAA

719-A:5’-TCTTTTTGAAAAGTTATA

719-G:5’-TCTTTTTGAAAAGTTATG

所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,扩增液B中包含的ASPE引 物还可以是含有5’-端检测定位序列的如下序列:

238-G:5’-CAATTCATTTCATTCACAATCAATTTTATGCAGGTTTG

238-C:5’-CAATATACCAATATCATCATTTATTTTATGCAGGTTTC

460-G:5’-TCAATCATCTTTATACTTCACATGGGATAGAGGAG

460-A:5’-CTTTTTCAATCACTTTCAATATTTGGGATAGAGGAA

719-A:5’-CAATTTACTCATATACATCACTTTCTTTTTGAAAAGTTATA

719-G:5’-CTACTAATTCATTAACATTACTATCTTTTTGAAAAGTTATG

所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,扩增液B含有生物素标记的 dCTP。

所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,所含的基因芯片上的探针序 列可以是以下一组序列:

POS-1:ATTGATTGTGAATGAAATGAATTG

POS-2:GTAAATGATGATATTGGTATATTG

POS-3:ATTGTGAAGTATAAAGATGATTGA

POS-4:ATGAATTGAAAGTGATTGAAAAAG

POS-5:AAAGTGATGTATATGAGTAAATTG

POS-6:GTAGTAATGTTAATGAATTAGTAG

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