[发明专利]嘌呤类药物敏感基因检测试剂盒有效
申请号: | 200710043225.5 | 申请日: | 2007-06-29 |
公开(公告)号: | CN101333560A | 公开(公告)日: | 2008-12-31 |
发明(设计)人: | 穆海东;汪宁梅;杜喜玲 | 申请(专利权)人: | 上海裕隆生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200233上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 嘌呤 类药物 敏感 基因 检测 试剂盒 | ||
技术领域
本发明属于临床检测的基因芯片技术领域,具体地说涉及一种嘌呤类药物敏感基因检测 试剂盒。
背景技术
目前研究结果表明,治疗急性淋巴细胞白血病的巯嘌呤代谢药物——6-巯基嘌呤和6-巯代 鸟嘌呤均是无内在生物活性的药物,必须通过体内一系列代谢后才能发挥药效。而人体的巯基 嘌呤甲基转移酶(TPMT)的代谢酶在此类药物代谢和抗白血病作用中起关键作用。TPMT上含 有的突变位点与人体对嘌呤类药物的敏感性有关。
目前用于检测5氟尿嘧啶单位点突变的方法主要有:测序法,这是最直接,最准确的方 法,;荧光定量PCR法,和单碱基延伸法。这些方法所需要的设备仪器都价格昂贵,技术复杂, 从经济上考虑不适于用作常规方法加以推广。
发明内容
为了对嘌呤类药物敏感的相关基因进行平行检测,对大量样本进行同时分析,并考虑经 济推广的可行性,本发明选择TPMT的三个突变位点作为检测对象,提供一种嘌呤类药物敏 感基因芯片检测试剂盒,包括抽提液、杂交缓冲液、洗液、扩增液、Taq酶、基因芯片;其 特征在于,所含的扩增液含有扩增巯基嘌呤甲基转移酶(TPMT)基因上3个突变位点序列的引 物,3个突变位点分别是238,460和719。
所述的嘌呤类药物敏感基因检测试剂盒,其特征在于,扩增液可以包含以下一组序列的 引物:
238-1:TGAAACCCTATGAACCTG
238-2:TCCAGGAATTTCGGTGT
460-1:GTTGAAGTACCAGCATG
460-2:CCTGGATTGATGGCAA
719-1:GGTTGATGCTTTTGAAGAA
719-2:CAATCTGCAAGACACATAG
所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,还可以包括扩增液B,扩增 液B中包含如下一组序列的ASPE(Allele-Specific Primer Extension,即等位基因特特性引物 延伸)引物:
238-G:5’-ATTTTATGCAGGTTTG
238-C:5’-ATTTTATGCAGGTTTC
460-G:5’-GGATAGAGGAG
460-A:5’-GGGATAGAGGAA
719-A:5’-TCTTTTTGAAAAGTTATA
719-G:5’-TCTTTTTGAAAAGTTATG
所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,扩增液B中包含的ASPE引 物还可以是含有5’-端检测定位序列的如下序列:
238-G:5’-CAATTCATTTCATTCACAATCAATTTTATGCAGGTTTG
238-C:5’-CAATATACCAATATCATCATTTATTTTATGCAGGTTTC
460-G:5’-TCAATCATCTTTATACTTCACATGGGATAGAGGAG
460-A:5’-CTTTTTCAATCACTTTCAATATTTGGGATAGAGGAA
719-A:5’-CAATTTACTCATATACATCACTTTCTTTTTGAAAAGTTATA
719-G:5’-CTACTAATTCATTAACATTACTATCTTTTTGAAAAGTTATG
所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,扩增液B含有生物素标记的 dCTP。
所述的嘌呤类药物敏感基因芯片检测试剂盒,其特征在于,所含的基因芯片上的探针序 列可以是以下一组序列:
POS-1:ATTGATTGTGAATGAAATGAATTG
POS-2:GTAAATGATGATATTGGTATATTG
POS-3:ATTGTGAAGTATAAAGATGATTGA
POS-4:ATGAATTGAAAGTGATTGAAAAAG
POS-5:AAAGTGATGTATATGAGTAAATTG
POS-6:GTAGTAATGTTAATGAATTAGTAG
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