[发明专利]检测药物活性成分对相关基因表达调控的生物芯片

说明书

技术领域

本发明涉及一种生物芯片，特别是涉及检测药物活性成分对相关基因表达调控的生物芯片。

背景技术

现代药理学研究已明确药物作用都有其靶基因，靶基因是药物作用最本质的指标。因此在进行药物研究时，能鉴定出药物作用前后的表达有差异的基因，对药物的研发及应用等具有至关重要的作用。随着分子生物学相关技术的发展，已有越来越多的技术用于分析和分离差异表达基因。目前大规模筛选差异表达基因的方法主要有差异显示PCR方法(differential display RT-PCR，DDRT-PCR)、消减杂交法(subtractivehybridization，SH)、基因表达的系统分析(serial analysis of gene expression，SAGE)和基因芯片技术(DNA chip technique)。差异显示PCR方法具有快速的优点，但是其也具有假阳性率高，对高拷贝基因有偏向性和很难直接判断基因功能和意义的缺点。消减杂交法的优点是mRNA用量少，特异性高，缺点是酶切连接步骤大多，会损失cDNA，而且需进行多次杂交和PCR，操作繁琐。基因表达的系统分析优点是能较完整地获得基因组表达丰度的数量信息，缺点是要求大量的起始RNA样品，不能用于检测含低丰度RNA样品的小量生物样品。基因芯片又叫DNA芯片和DNA微阵列，其原理是运用已知核酸序列作为探针与互补的靶核苷酸序列进行杂交，然后通过信号检测进行定性和定量分析，能够在同一时间内平行分析大量的基因，进行大量信息的筛选与检测，实现对生物样品快速、并行、高效地进行检测。该技术具有传统的研究差异表达基因的方法无法比拟的优点。(1)高通量同步分析：目前基因芯片制作工艺可以大约1cm2的载体表面固定数十万个探针，可以对样品中数目巨大的相关基因甚至整个基因组进行同步分析；(2)全自动快速分析：芯片上的探针可以在一定条件下和样品中的靶基因片段在同一时间内分别杂交，之后用扫描仪进行杂交信号的测量和分析处理，这从根本上提高的差异基因的检测效率，降低了检测的强度和难度；(3)高灵敏度精确分析：芯片技术可以检测出样品中低至1个拷贝的靶基因，因此所需的样品量很少。同时，芯片上的每一个探针都严格依照碱基互补配对原则与相应基因进行杂交，只有一个差异碱基的基因也会表现出杂交信号的不同。目前国内外许多制药公司或相关研究机构已建立或正在建立基因芯片表达谱数据库，为药物筛选提供各种靶基因及分析手段。但是这些已构建成的基因芯片涉及的基因众多，费用很高，不适合在某一专项(抗肿瘤药等)的研究中应用。

发明内容

本发明的目的是克服现有技术的不足，提供一种检测药物活性成分对相关基因表达调控的生物芯片。

本发明的技术方案概述如下：

一种检测药物活性成分对相关基因表达调控的生物芯片，在玻片或硅片或高分子材料上固定筛选的基因DNA探针，所述探针如下：

PCNA       tgtcgataaa gaggaggaag ctgttaccat agagatgaat gaacc

Cyclin A1  ggaagctgaa ataaggcaca gacccaaagc acactacatg aagaa

Cyclin B1  aaatgaagat tctaagagct ttaaactttg gtctgggtcg gcctc

Cyclin C   gttattgcca ctgctacggt atatttcaag agattctatg ccagg

Cycl in D1 tgtgccacag atgtgaagtt catttccaat ccgccctcca tg

Cyclin E1  cctgctccct gatccccaca cctgacaaag aagatgatga

Cyclin G1  ctgcacacga taatggcctc agaatgactg caagactaag ggact

Cdk4       cacagttcgt gaggtggctt tactgaggcg actggaggct tt

Cdk2       cctgtggtac cgagctcctg aaatcctcct gggctgcaaa ta

Cdc2       gattctatcc ctcctggtca gtacatggat tcttcacttg tt

p16        catagatgcc gcggaaggtc cctcagacat ccccgattg