[发明专利]一种生物病毒的计算机自动分类方法

权利要求书

1.一种生物病毒的计算机自动分类方法，其特征在于，该方法包括：

A、根据长度为N的基因全序列字符集中K种片段序列出现的频率作为K个特征，再加上全基因组序列长度这一特征，将全基因组序列映射到K+1维的同一特征空间；

B、对所述特征空间的某类病毒类型样本构建种系进化树；

C、根据所述种系进化树反映的同类型病毒样本之间的相互关系，采用超椭球对每类样本子空间进行近似覆盖；

D、形成封闭的同类病毒的样本子空间，所有映射点落在这个封闭子空间里的病毒都属于同一类，而映射点落在封闭子空间以外的病毒都属于其它类。

2.根据权利要求1所述的生物病毒的计算机自动分类方法，其特征在于，所述步骤B包括：

通过计算病毒在特征空间的欧式距离，近似描述同类病毒在进化上的远近关系。

3.根据权利要求1所述的生物病毒的计算机自动分类方法，其特征在于，所述步骤C包括：

按照构建的种系进化树关系，采用超椭球这一几何形体对该类病毒样本子空间进行近似覆盖。