[发明专利]基于ERCC1和TS表达确定化疗方案的方法

说明书

本申请是申请日为2001年11月9日的中国专利申请01822464.4“基于ERCC1和TS表达确定化疗方案的方法”的分案申请。

技术领域

本发明涉及有效用于医学，特别是癌症化疗中的预测方法。更特别是，本发明涉及评估患者中的肿瘤细胞的基因表达。通过检测人类中参与核苷酸合成和DNA修复的基因表达的mRNA，测定肿瘤细胞对细胞毒性化疗剂，特别是抗代谢药和以铂制剂的方式破坏DNA的试剂的抗性。

背景技术

当正常细胞经历致癌性转化并成为恶性细胞时癌症发生。转化的(恶性)细胞逃离可规定细胞表型并抑制细胞增殖的正常生理控制。个体机体中的转化细胞因此增殖，形成肿瘤。当发现肿瘤时，临床目标是选择性地破坏恶性细胞，同时减轻在个体进行治疗过程中对正常细胞的任何损害。

化疗方案是以对癌细胞具有选择毒性(细胞毒性)的药物的使用为基础的。人们已经研制出了很多类化疗药物，包括干扰核酸合成，蛋白合成，及其它重要代谢过程的药物。这些通常被称作抗代谢药物。其它类的化疗药物是损害细胞的DNA。这些类药物通常被称作是基因毒性的。

然而，个体肿瘤对预期化疗药物或药物联合的敏感性常常只能在治疗的试验期之后才能准确地测定。在不成功试验期投入的时间会在临床处理侵入性恶性肿瘤时造成重大的危险。

对细胞DNA损伤的修复是由细胞的酶促DNA修复机制进行的一种重要生物过程。细胞基因组中的未修复病变可以阻碍DNA复制，损害新合成DNA的复制保真性和/或阻碍细胞存活所需基因的表达。因此，一般认为基因毒性药物对涉及DNA合成的活跃分裂的细胞比对静止、不分裂的细胞毒性更强。然而，许多机体组织的正常细胞更静止，并且不经常重新进入细胞周期和分裂。细胞分裂的各轮之间的时间更长，因此提供给由化疗基因毒性导致的正常细胞中DNA破坏的修复。因此，杀灭癌细胞达到了一定的选择性。许多治疗方案中尝试通过属于两种或更多这些类的化疗药的共同给药而改进选择性。

因为对实体瘤进行有效的化疗通常需要联合给药，而对每种单一药物的敏感性或抗性决定因素的鉴定和测量成为设计个体联合化疗的重要工具。

已经发现损害细胞DNA的广泛使用的基因毒性抗癌是顺铂(DDP)和卡铂。目前顺铂和/或卡铂用于治疗选定的、各种上皮和间质来源的肿瘤，包括呼吸道、胃肠道和生殖道、中枢神经系统的癌和肉瘤，以及头和颈的鳞状细胞癌。顺铂和其它试剂的联合目前优选用于睾丸癌的控制，在许多情况下产生持续的缓解(Loehrer等，1984，100 Ann.Int.Med.704)。顺铂(DDP)通过形成链内加合物而破坏DNA结构。DDP等铂制剂的抗性是由于对铂加合物的耐受、药物积聚减少、或DNA修复增加。

另一种具有1，2-二氨基环己烷环的基于铂的化疗剂奥沙利铂在体外和体内都表现出了抗肿瘤效力。认为这种大的携带基团导致铂-DNA加合物，该加合物比其它铂制剂形成的加合物具有更强的细胞毒性并且更有效阻断DNA复制。最近的数据表明，错配修复系统(MMR)的缺陷和复制复合物跨DNA破坏位点合成DNA(增强的复制旁路)的能力增加导致对顺铂的抗性，对奥沙利铂则并非如此(Raymond等，SeminOncol 25，Suppl 5：4-12，1998)。

大的DNA加合物，如铂制剂形成的加合物的切除修复似乎由参与DNA破坏识别和切除的基因介导。Cleaver等，Carcinogenesis11：875-882(1990)；Hoeijmakers等，Cancer Cells 2：311-320(1990)；Shivji等，Cell 69：367-374(1992)。实际上，在酶促DNA修复机制的一个或多个元件中具有遗传缺陷的细胞对顺铂极为敏感。Fraval等(1978)，51 Mutat.Res.121，Beck和Brubaker(1973)，116 J.Bacteriol 1247。