[发明专利]一种筛选基因芯片差异表达基因的方法无效
申请号: | 200710173586.1 | 申请日: | 2007-12-28 |
公开(公告)号: | CN101215602A | 公开(公告)日: | 2008-07-09 |
发明(设计)人: | 刘极龙;曾华宗 | 申请(专利权)人: | 上海敏芯信息科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G06F19/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200433上海市杨*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 筛选 基因芯片 差异 表达 基因 方法 | ||
1.一种筛选基因芯片差异表达基因的方法,其特征在于该方法包括有如下步骤:
步骤1,对芯片数据进行归一化处理;
步骤2,建立对数比值xij=μ+μj+ε线性模型;
步骤3,计算出全局均值μ,列效应μj和方差σ的值;
步骤4,利用μ、μj和σ,计算每个基因的2×ln(odd ratio);
步骤5,设定域值χ2cutoff,n,当步骤4中的2×ln(odd ratio)值大于χ2cutoff,n的基因定为差异表达基因。
2.根据权利要求1所述的一种筛选基因芯片差异表达基因的方法,其特征在于:在步骤1中,进行基因芯片数据的归一化处理时的样本数,在1~5例之间。
3.根据权利要求1所述的一种筛选基因芯片差异表达基因的方法,其特征在于:在步骤3或步骤4中,
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