[发明专利]一种筛选基因芯片差异表达基因的方法无效

专利信息
申请号: 200710173586.1 申请日: 2007-12-28
公开(公告)号: CN101215602A 公开(公告)日: 2008-07-09
发明(设计)人: 刘极龙;曾华宗 申请(专利权)人: 上海敏芯信息科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G06F19/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 200433上海市杨*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 筛选 基因芯片 差异 表达 基因 方法
【权利要求书】:

1.一种筛选基因芯片差异表达基因的方法,其特征在于该方法包括有如下步骤:

步骤1,对芯片数据进行归一化处理;

步骤2,建立对数比值xij=μ+μj+ε线性模型;

步骤3,计算出全局均值μ,列效应μj和方差σ的值;

步骤4,利用μ、μj和σ,计算每个基因的2×ln(odd ratio);

步骤5,设定域值χ2cutoff,n,当步骤4中的2×ln(odd ratio)值大于χ2cutoff,n的基因定为差异表达基因。

2.根据权利要求1所述的一种筛选基因芯片差异表达基因的方法,其特征在于:在步骤1中,进行基因芯片数据的归一化处理时的样本数,在1~5例之间。

3.根据权利要求1所述的一种筛选基因芯片差异表达基因的方法,其特征在于:在步骤3或步骤4中,

oddratio=p(xi1,xi2,...xin|μ,μj,σ,H1)p(xi1,xi2,...xin|μ,μj,σ,H0).]]>

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