[发明专利]一种计算寡核苷酸基因芯片的UniGene表达量的算法无效
申请号: | 200710173615.4 | 申请日: | 2007-12-28 |
公开(公告)号: | CN101261689A | 公开(公告)日: | 2008-09-10 |
发明(设计)人: | 曾华宗;刘极龙 | 申请(专利权)人: | 上海敏芯信息科技有限公司 |
主分类号: | G06N3/12 | 分类号: | G06N3/12 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200433上海市杨*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 计算 寡核苷酸 基因芯片 unigene 表达 算法 | ||
【权利要求书】:
1.一种计算寡核苷酸基因芯片的UniGene表达量的算法,其特征在于该方法包括有如下步骤:
步骤1,获得探针水平的表达值数据;
步骤2,将探针集归入不同的UniGene;
步骤3,以UniGene为单位,合并同一个UniGene下的探针集;
步骤4,分别对每个UniGene下的所有探针进行层次聚类分析;
步骤5,寻找层次聚类结果中的最大探针子集,作为该UniGene的代表探针集;
步骤6,将代表探针集转化为一个表达值,即为UniGene水平的最终表达值。
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