[发明专利]与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异片段及其获得方法有效
申请号: | 200710178022.7 | 申请日: | 2007-11-23 |
公开(公告)号: | CN101440366A | 公开(公告)日: | 2009-05-27 |
发明(设计)人: | 许勇;苏芳;张海英;郭绍贵;宫国义 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29 |
代理公司: | 北京北新智诚知识产权代理有限公司 | 代理人: | 程凤儒 |
地址: | 100097北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甜瓜 白粉病 抗性 基因 pm 紧密 连锁 特异 片段 及其 获得 方法 | ||
1.一种与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异片段,其特征在于,其如序列表SEQ ID NO.1和SEQ ID No.3所示。
2.一种与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异片段的获得方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异片段的筛选:提取基因组DNA,使用SSR引物对基因组DNA进行PCR反应,对PCR产物进行电泳分析;通过BSA法,寻找与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异SSR片段,测定连锁距离并验证连锁关系;
(2)与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异扩增序列的获得:对SSR产物进行回收、克隆和测序,获得特异片段序列。
所述步骤(1)中SSR引物为SSR引物509;
所述SSR引物509上游引物序列为:5’-CTGGCCCCCTCCTAAACTAA-3’,509下游引物序列为5’-CAAAAAGCATCAAAATGGTTG-3’。
3.根据权利要求2所述的一种与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异片段的获得方法,其特征在于,所述步骤(1)中的提取基因组DNA是指将1.5克叶片在液氮中研磨成粉末,加入9ml 2%CTAB提取液,混匀65℃水浴1小时;从水浴中取出离心管,加1/3体积5M醋酸钾,混匀冰浴20分钟;加入等体积氯仿/异戊醇抽提两次;取上清加入2/3体积异丙醇沉淀DNA;洗涤缓冲液洗涤一次,吹干,加TE缓冲液溶解;加入RNaseA使其终浓度达100μg/ml,混匀37℃水浴1小时;用等体积氯仿/异戊醇抽提;取上清,加入1/2体积7.5M醋酸铵和2倍体积无水乙醇沉淀DNA;70%乙醇洗涤沉淀,吹干,加适量ddH2O溶解DNA。
4.根据权利要求2所述的一种与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异片段的获得方法,其特征在于,所述步骤(1)中的PCR反应条件是:25μl的反应体系中含有2.5μl 10×buffer,2.0μl 25mM MgCl2,2.0μl 2.5mM dNTP,1U Taq DNA聚合酶,30ng SSR引物,50ng模板DNA;反应程序为,94℃预变性5min,然后94℃ 1min,52℃ 1min,72℃2min下循环35次,72℃延伸7min后保存在4℃条件下。
5.根据权利要求2所述的一种与甜瓜白粉病抗性基因Pm-2F紧密连锁的特异片段的获得方法,其特征在于,所述步骤(2)中的SSR产物的回收、克隆和测序是指用Gene-Clean试剂盒纯化回收已证明是连锁的SSR特异片段,然后连接到pGEM@-T Vector Easy载体上,将重组质粒DNA用EcoRI进行酶切处理,用SSR-PCR验证扩增产物,观察扩增出的片段是否与原来的目的片段和酶切片段一致,并测序。
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