[发明专利]多重PCR检测大肠埃希菌的方法、试剂盒及其应用无效
申请号: | 200710178872.7 | 申请日: | 2007-12-06 |
公开(公告)号: | CN101186947A | 公开(公告)日: | 2008-05-28 |
发明(设计)人: | 赵红庆;苑锡铜;黄留玉 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军疾病预防控制所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 | 代理人: | 鲁兵 |
地址: | 10007*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多重 pcr 检测 大肠 埃希菌 方法 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种PCR试剂盒,用于多种致腹泻大肠埃希菌的分型检测,该试剂盒包括:
1).选自五种引物对中的至少一种引物对,五种引物对分别特异于基因eaeA,aggR,ipaH,lt和stxI;
2).PCR反应缓冲液,聚合酶,dNTP;
3).对应1)中引物对的标准阳性模板;
4).一份进行PCR反应的说明书;以及
5).上述1)到4)被包装在包装材料中。
2.根据权利要求1所述PCR试剂盒,其特征在于,所述引物对为两种至五种引物对的组合,且所述引物对相互分离装配于试剂盒中。
3.根据权利要求1所述PCR试剂盒,其特征在于,所述引物对为两种至五种引物对的组合,且所述引物对为混合物装配于试剂盒中,引物混合物按eaeA,aggR,ipaH,lt和stxI五种引物对的摩尔数10~15∶15~20∶1∶15~25∶20~30比例混合。
4.根据权利要求1所述PCR试剂盒,其特征在于,其中所述引物对为各自单独包装的五种引物对。
5.根据权利要求3所述PCR试剂盒,其特征在于,其中所述引物对为五种引物对形成的混合物,且以eaeA,aggR,ipaH,lt和stxI五种引物对按摩尔比418∶482∶32∶627∶739混合。
6.根据权利要求1所述PCR试剂盒,其特征在于,所述标准阳性模板为对应含有基因eaeA,aggR,ipaH,lt和stxI的不同菌液等比混合得到的多重PCR反应模板;所述聚合酶为rTaq酶。
7.根据权利要求1至6任一所述PCR试剂盒,其特征在于,所述五种引物对分别为:
1)特异于基因eaeA引物对:
其中一个序列是:AACATTATGGAACGGCAGAGGT;
另一个序列是:GTAAAGCGGGAGTCAATGTAACG;
2)特异于基因aggR引物对:
其中一个的序列是:GCTGATGCTGACGATTCTGTATT;
另一个的序列是:TCCTTCTCGATTGTGTTTCTGAC;
3)特异于基因ipaH引物对:
其中一个的序列是:GCGCTCACATGGAACAATCTC;
另一个的序列是:TCACTCCCGACACGCCATAG;
4)特异于基因lt引物对:
其中一个的序列是:GCATAATGAGTACTTCGATAGAGGA;
另一个的序列是:TCACACCAAATTAACACGATACC;
5)特异于基因stxI引物对:
其中一个的序列是:CATTCGTTGACTACTTCTTATCTGG;
另一个的序列是:TAGGTACAATTCTGGCAACTCG。
8.一种用于多种致腹泻大肠埃希菌的分型检测的方法,该方法包括:
1)使用权利要求1至7任一所述的PCR试剂盒;
2).形成一个PCR反应体系,对含有未知病菌的样品进行PCR反应;
3).将扩增产物与标准阳性模板扩增产物进行比对,确定扩增产物的组成,所述扩增产物的组成反映致腹泻大肠埃希菌分型。
9.根据权利要求8所述检测方法,其特征在于,试剂盒中每一种引物对在反应体系中的终浓度范围为从1nmol/L到1000nmol/L,优选终浓度在30nmol/L到800nmol/L之间;五种引物对同时使用时,最优选eaeA、aggR、ipaH、lt、和stx1五对引物对终浓度分别依次为418.2nmol/L、482.5nmol/L、32.2nmol/L、627.3nmol/L、和739.9nmol/L。
10.用于多种致腹泻大肠埃希菌的分型检测PCR试剂盒中的引物对,为以下所述五种引物对中的一种:
1)特异于基因eaeA引物对:
其中一个序列是:AACATTATGGAACGGCAGAGGT;
另一个序列是:GTAAAGCGGGAGTCAATGTAACG;
2)特异于基因aggR引物对:
其中一个的序列是:GCTGATGCTGACGATTCTGTATT;
另一个的序列是:TCCTTCTCGATTGTGTTTCTGAC;
3)特异于基因ipaH引物对:
其中一个的序列是:GCGCTCACATGGAACAATCTC;
另一个的序列是:TCACTCCCGACACGCCATAG;
4)特异于基因lt引物对:
其中一个的序列是:GCATAATGAGTACTTCGATAGAGGA;
另一个的序列是:TCACACCAAAATTAACACGATACC;
5)特异于基因stxI引物对:
其中一个的序列是:CATTCGTTGACTACTTCTTATCTGG;
另一个的序列是:TAGGTACAATTCTGGCAACTCG。
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