[发明专利]用于检测大肠癌的新的基因组合及其基因芯片

说明书

技术领域

本发明涉及生物基因领域，尤其是用于大肠癌检测的基因及其基因芯片。 

背景技术

大肠癌是常见恶性肿瘤之一，在我国恶性肿瘤发病率中居第5位，且呈现出“发病率上升，发病年龄提前，误诊率高”三个新特点。近年来大肠癌的发病率逐年升高，已从20世纪70年代的第六位上升到90年代的第三位，而且发病年龄有年轻化的趋势。目前用于诊断大肠癌的方法有多种：CEA(癌胚抗原)作为大肠肿瘤复发的临床监测价值远大于早期诊断的价值，因其在其他肿瘤中也有较高的表达，缺乏特异性；大便潜血试验(RPHA-FOBT)仍为检测早期大肠癌的重要手段，但由于早期大肠癌无出血者占有较大的比例，仍有漏诊率；国外推出的大肠癌检测试剂盒，主要采用免疫组化技术，针对手术后病理标本进行检测，其灵敏度都在30％左右。到目前为止，尚没有一种有关大肠肿瘤的特异性免疫标志物可供临床上用于大肠肿瘤的早期筛检，误诊率高达70％以上。 

基因芯片(Gene Chip)是将大量的寡核苷酸分子固定于固相载体上形成DNA微点阵，借助核苷酸分子杂交配对的特性对DNA样品的序列信息进行高效解读和分析。 

基因芯片起源于20世纪80年代，近年来得到了迅猛的发展，但主要是应用于医药和研究领域，应用于大肠癌的早期检测在我国尚属首次，这将会极大促进大肠癌早期诊断的发展。 

发明内容

本发明的目的为提供一种特异性好、灵敏度高、准确率高的用于检测大肠癌的基因组合。 

本发明的目的之二为提供应用该基因组合的用于检测大肠癌的基因芯片。 

实现上述目的的技术方案为： 

用于检测大肠癌疾病的基因组合，该基因组合包括30个基因片段(如表1所示)，其中第30种基因片段为质控基因。这30个基因片断是针对大肠癌的30个指标而设计的，利用30个基因片段共同来检测大肠癌基因表达谱的改变，进而对大肠癌进行侦检和预后监控。这30种基因片段如下表所示： 

表1  30种基因片段 

  编号   名称   引物(5’-3’)   基因片段长  度(bp)   1   VIP   CTCCTTGTGCTCCTGAC   200   CTGCTCCTCTTTCCATTC      2   C₂  TGCTCCTGGACTGTTCG   395   GCTTCACTCCTGTGGGT      3   Survivin   AGGTGCCTGTTGAATCTG   318   GACGCTTCCTATCACTCTATT      4   IL-2   AAGACCCAGGGACTT   280   GGTTGCTGTCTCATCA      5   Granulysin   CTGCGTGATGAGGAGAAA   400   GGGTCGCAGCATT      6   FAK   TCCACCAAAGAAACCG   500   TCTGTGCCATCTCAATCT      7   IL-1   CGCCTGACAGAAACCA   300   GCGAATGACAGAGGGT      8   IL-8   CAGCCTTCCTGATTTC   300   AACCCTCTGCACCCA      9   Cox-1   ATCCAGAAACAGTGGCTCG   248   CAACCAATGGCGTG      10   C-myc   ACGCCGCTCGGAAGGAAT   300   TCCACCGTGACCACATCG      11   VEGF   CCCACCCACATACATACA   230   CCTCCCAACTCAAGTCC      12   Stufen   GCTGCGAAACACGATGCT   300   CTGGGCCAGTCGGCTAAT      13   C10orf46   TTTGGCTCCGCTTTCTCG   550   CTCCCAGTTGTTGTGGTTCT      14   Ki-67   TTGCCTCCTAATACGC   280   CTTCCGAAGCACCACT      15   Granulysin   CTGCGTGATGAGGAGAAA   320   GGGTCGCAGCATT      16   TOP2B   GACAATGCCCTCACC   500   CCAGGCTCCTTCTTC      17   MTHFR   ACCGCCGTGAACTACTGT   350   GCCTCCCTCCTCCTCTT      18   PCNA   CAAGGACCTCATCAACG   400   ACTTTCTCCTGGTTTGG      19   P15   TGGACCTGGTGGCTACGAAT   200