[发明专利]用于检测核酸、核酸的甲基化状态和突变体的包含信号对和疏水性核苷酸、无茎信标的寡核苷酸

权利要求书

1.一种寡核苷酸类似物，其包含n个核苷酸和/或核苷酸类似物的连续序列和至少一个疏水性核苷酸，其中所述寡核苷酸类似物共价连接至信号对，

其中所述疏水性核苷酸具有通用结构

X-Y-Q

其中

X是核苷酸或核苷酸类似物或能够掺入核酸或核酸类似物主链的主链单体单元，

Q是不参与沃森-克里克氢键合的疏水性分子；和

Y是连接所述核苷酸或核苷酸类似物或主链单体单元和所述疏水性分子的连接体部分；和

其中n是至少为4的整数；和

其中所述至少一个疏水性核苷酸被置于距一端最多9个核苷酸和/或核苷酸类似物的位置；和

其中所述信号对由两部分系统组成，其中一个部分被置于距5′端最多6个核苷酸和/或核苷酸类似物的位置，而另一个部分被置于距3′端最多6个核苷酸或核苷酸类似物的位置；

其中所述信号对的所述部分与所述疏水性核苷酸不同，

条件是当所述信号对的一个部分作为悬挂端被置于5′端时，则5′端的第一个核苷酸或核苷酸类似物不是疏水性核苷酸；当所述信号对的一个部分作为悬挂端被置于3′端时，则3′端的第一个核苷酸或核苷酸类似物不是疏水性核苷酸。

2.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中在连接至所述连接体Y的位置添加甲基时，至少一个疏水性分子Q具有的logP值大于0，如大于0.5，例如大于0.75，如大于1，例如大于1.25，如大于1.5，例如大于1.75，如大于2，例如大于2.5，如大于3，例如大于4，如大于5。

3.如权利要求2所述的寡核苷酸类似物，其中所述logP值是使用计算机程序ALOGPS 2.1确定的ALogP值。

4.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中至少一个疏水性分子Q包含选自由碳水化合物、类固醇、聚芳烃和杂聚芳烃的链组成的组的化学基团。

5.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中至少一个疏水性分子Q选自由聚芳烃和杂聚芳烃组成的组，所述聚芳烃和杂聚芳烃任选地被选自由羟基、溴、氟、氯、碘、巯基、硫、氰基、烷基硫、杂环、芳基、杂芳基、羧基、烷氧羰基、烷基、烯基、炔基、硝基、氨基、烷氧基和酰氨基组成的组的一个或多个取代。

6.如权利要求5所述的寡核苷酸类似物，其中所述聚芳烃或杂聚芳烃依据本发明可由1，例如2，如3，例如4，如5，例如6，如7，例如8，如多于8个环组成。

7.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中至少一个疏水性分子Q选自由嵌入剂和小沟结合物组成的组。

8.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中至少一个疏水性分子Q选自由嵌入剂组成的组。

9.如权利要求8所述的寡核苷酸类似物，其中所述嵌入剂选自由以下组成的组：苯、并环戊二烯、茚、萘、薁、不对称引达省、对称引达省、亚联苯基、苊、非那烯、庚搭烯、菲烷、荧蒽、菲咯啉、吩嗪、菲啶、蒽醌、芘、蒽、环烷、菲、氟烷、苉、、萘并苯、吖啶酮类、苯并蒽类、均二苯代乙烯类、草酰吡啶咔唑类、叠氮苯类、卟啉类和补骨脂素类和其衍生物。

10.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中至少一个疏水性基团Q选自由以下组成的组：

                     

吡啶并[3′，2′:4，5]噻吩并[3，2-d]嘧啶        吡啶并[3′，2′:4，5]噻吩并-4(1H)-酮，7，9-二甲基-                            [3，2-d]嘧啶-4(1H)-酮

和

11.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中至少一个疏水性基团包含芘或吡啶并[3′，2′:4，5]噻吩并[3，2-d]嘧啶-4(1H)-酮或7，9-二甲基-吡啶并[3′，2′，4，5]噻吩并[3，2-d]嘧啶-4(3H)-酮。

12.如权利要求1所述的寡核苷酸类似物，其中所有疏水性分子Q选自根据权利要求2至10的任何疏水性分子。