[发明专利]用于增加转录的基质附着区(MAR)及其应用无效
申请号: | 200780029732.1 | 申请日: | 2007-08-22 |
公开(公告)号: | CN101541959A | 公开(公告)日: | 2009-09-23 |
发明(设计)人: | 尼古拉斯·梅尔莫;皮埃尔·阿兰·吉罗德;戴维·卡拉布雷塞;亚历山大·雷加梅;萨里内·多尼内利-阿罗佩 | 申请(专利权)人: | 思兰克斯有限公司 |
主分类号: | C12N15/09 | 分类号: | C12N15/09;C12N15/67;C12N15/63;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 章社杲;张 英 |
地址: | 瑞士普兰-*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 增加 转录 基质 附着 mar 及其 应用 | ||
1.用于高水平表达至少一种基因的一种表达系统,包括:
用于可操作地连接编码一种感兴趣基因的一种核苷酸序 列的一种启动子,以及在一种用所述表达系统转化的细胞内用 于增强一种所述基因表达的至少一种非人类哺乳动物MAR 核苷酸序列,其中用所述构建体转化所述细胞时,所述非人类 哺乳动物MAR核苷酸序列使所述基因表达增加约2、约3、 约4、约5、约6、约7、约8、约9、约10倍或更多倍。
2.根据权利要求1所述的表达系统,其中包括所述启动子和编码 一种感兴趣基因的所述核苷酸序列的一种表达盒可操作地连 接于该启动子。
3.根据以上权利要求中任一项所述的表达系统,其中所述至少一 种非人类哺乳动物MAR核苷酸序列是一种啮齿动物MAR核 苷酸序列,例如一种小鼠或仓鼠MAR核苷酸序列。
4.根据以上权利要求中任一项所述的表达系统,其中所述非人类 哺乳动物MAR核苷酸序列包括:
(i)SEQ ID No.3、SEQ ID No.10或它的一个功能片段; 或者
(ii)与(i)中任何一个序列具有约80%,约90%,约 95%或约98%的序列一致性的一种核苷酸序列。
5.根据以上权利要求中任一项所述的表达系统,其中所述基因在 一种非人类哺乳动物细胞例如一种啮齿动物细胞特别是一种 小鼠或仓鼠细胞或者在一种人类细胞如一种HeLa细胞内表 达。
6.根据以上权利要求中任一项所述的表达系统,其中所述至少一 种非人类哺乳动物MAR核苷酸序列在所述基因上以顺式或反 式发挥作用。
7.用于增加在一种细胞内蛋白质产量的一种方法,包括 提供一种人类或非人类哺乳动物细胞,
将以上权利要求中任一项所述的表达系统导入所述细胞 内,使基因表达增加约2、约3、约4、约5、约6、约7、约 8、约9、约10倍或更多。
8.一种分离并纯化的核酸分子,包括:
(a)SEQ ID No.3或SEQ ID No.10或它的一个功能片 段的核苷酸序列,或者
(b)与(a)中的序列具有至少约80%、约90%、约95% 或约98%的序列一致性且具有MAR活性的一种核苷酸序列。
9.用于鉴定非人类哺乳动物MAR序列的一种方法,包括:
提供至少一种非人类哺乳动物核酸分子,优选一种非人 类哺乳动物基因组或其一部分,
令所述核酸分子经受针对MAR序列的一个扫描过程,包 括:
设定待评估的核酸分子的窗口大小,
选择至少1个或至少2个,优选3个,更优选4个或更 多个与MAR相关的特征,
为表现这个/这些特征的序列设定多个阈值,以及
选择超过这些阈值的MAR候选核苷酸序列,
确定通过包含所述非人类哺乳动物MAR核苷酸序列的 一种表达系统转化一种人和/或非人类哺乳动物细胞时,所述 非人类哺乳动物MAR核苷酸序列使基因表达增加约2、约3、 约4、约5、约6、约7、约8、约9、约10倍或更多倍。
10.根据权利要求9所述的一种方法,其中所述至少一个特征可以 是一个DNA弯曲角度、大沟深度、小沟宽度、解链温度或它 们的组合。
11.根据权利要求10所述的方法,其中DNA弯曲角度值包括在 约3和约5度(基团的角度(radical degree))之间,优选在 3.8和约4.4度之间,包括约3.9、约4.0、约4.1、约4.2和约 4.3度。
12.根据权利要求10或11所述的方法,其中大沟深度值在约8.9 至约之间并且小沟宽度值在约5.2至约之间,优选 地,该大沟深度值在约9.0至约之间包括约并且该 小沟宽度值可在约5.4至约之间包括约和约
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