[发明专利]在酶反应中在样品中合成cDNA的方法有效

专利信息
申请号: 200780030321.4 申请日: 2007-08-13
公开(公告)号: CN101636505A 公开(公告)日: 2010-01-27
发明(设计)人: H·恩格尔;S·耶拉米利;M·科鲁兹;D·洛弗特;C·科菲哈格 申请(专利权)人: 恰根有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 代理人: 陶家蓉
地址: 德国*** 国省代码: 德国;DE
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摘要:
搜索关键词: 反应 样品 合成 cdna 方法
【权利要求书】:

1.在一个酶反应中在一个样品中合成cDNA的方法,其中该方法包括步骤:

(a)准备一种反应混合物,所述反应混合物同时具有末端转移酶活性的第一种 酶、具有反转录酶活性的第二种酶、缓冲液、至少一种核糖核苷酸、至少一种脱氧 核糖核苷酸、锚定寡核苷酸;

(b)在所述反应混合物中加入含有核糖核酸的样品;和

(c)在一个或多个温度步骤中温育所述反应混合物中步骤(a)和(b)的试剂,选择 这些温度步骤以使第一种酶和第二种酶显示活性。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述末端转移酶活性是聚腺苷酸化 活性。

3.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述样品含有核糖核酸,选自 原核RNA、真核RNA、病毒RNA、太古生物RNA、miRNA、snoRNA、mRNA、 tRNA、未聚腺苷酸化的RNA、rRA,及其混合物。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述锚定寡核苷酸选自聚腺苷酸化 寡核苷酸、聚胞苷酸化寡核苷酸、聚胸苷酸化寡核苷酸、聚鸟苷酸化寡核苷酸、聚 尿苷酸化寡核苷酸,额外含有5′-尾的聚腺苷酸化寡核苷酸,额外含有5′-尾的聚胞 苷酸化寡核苷酸、额外含有5′-尾的聚胸苷酸化寡核苷酸、额外含有5′-尾的聚鸟苷 酸化寡核苷酸、和额外含有5′-尾的聚尿苷酸化寡核苷酸。

5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述锚定寡核苷酸长6-150个核苷 酸,可任选在3′-端具有锚定序列。

6.如权利要求4所述的方法,其中所述锚定寡核苷酸是脱氧核糖核酸(DNA)、 肽核酸(PNA)、锁闭核酸(LNA)、硫代磷酸脱氧核糖核酸、环己烯核酸(CeNA), N3-P5-氨基磷酸酯(NP)、或三环脱氧核糖核酸(tcDNA)。

7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述核糖核苷酸可选自腺嘌呤-5′- 三磷酸、胸腺嘧啶-5′-三磷酸、胞嘧啶-5′-三磷酸、鸟嘌呤-5′-三磷酸、尿嘧啶-5′-三 磷酸、具有碱基类似物的核糖核苷酸,其中所述核糖核苷酸可任选的被修饰或标记。

8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述脱氧核糖核苷酸可选自脱氧腺 嘌呤-5-三磷酸(dATP),脱氧胸腺嘧啶-5-三磷酸(dTTP),脱氧胞嘧啶-5-三磷酸 (dCTP),脱氧鸟嘌呤-5-三磷酸(dGTP),脱氧尿嘧啶-5-三磷酸(dUTP),其中所述 脱氧核糖核苷酸可任选被修饰或标记。

9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,标记脱氧核糖核苷酸可选自放射性 标记,例如32P,33P,35S,3H;荧光染料,例如异硫氰酸荧光素(FITC)、6-羧基荧光素 (FAM)、(夹)氧杂蒽、罗丹明、6-羧基-2,4,7,4,7-六氯荧光素(HEX)、6-羧基-4,5- 二氯-2,7-二甲氧基荧光素(JOE)、N,N,N’,N’-四甲基-6-羧基罗丹明(TAMRA)、6- 羧基-X-罗丹明(ROX)、5-羧基罗丹明-6G(R6G5)、6-羧基罗丹明-6G(RG6)、罗丹 明110;香豆素,例如7-羟基香豆素;苯甲亚胺,例如Hoechst 33258;菲啶,例如 德克萨斯红、溴乙啶、氮蒽染料、咔唑染料、吩嗪染料、紫菜碱染料、聚甲炔染 料;花青染料,例如Cy3,Cy5,Cy7、BODIPY染料、喹啉染料和Alexa染料。

10.如权利要求8所述的方法,其特征在于,修饰选自生物素化、地高辛标记 和半抗原。

11.如权利要求8所述的方法,其特征在于,反应物中脱氧核糖核苷酸的浓度 为至少0.01mmol和至多10mmol。

12.如权利要求11所述的方法,其特征在于,脱氧核糖核苷酸dATP,dCTP, dGTP和dTTP以0.2mmol-2mmol的浓度存在。

13.如权利要求1所述的方法,其特征在于,缓冲液pH是6-10,并含有Mg2+离子。

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