[发明专利]在质谱仪中对解离类型的数据依赖的选择

说明书

相关申请的交叉参考

本申请根据35U.S.C§119(e)，要求2006年8月25日申请的美国临时专利申请60/840,198，发明名称为“分裂类型的数据依赖的选择”的优先权，其公开文本并入这里作为参考。

技术领域

本发明通常涉及质谱法，更具体地涉及利用数据依赖的方法自动收集MS/MS和MSⁿ质谱。

背景技术

数据依赖的收集(在各种商业实现方式中，也称为信息依赖收集(IDA)，数据指导分析(DDA)，和AUTO MS/MS)在质谱学领域，尤其在分析复杂的样本中是有意义的且广泛应用的工具。如通常所述，数据依赖的收集包括实时地利用从试验性收集的质谱中获得的数据以指导质谱仪随后的工作；例如，质谱仪可以基于对于潜在感兴趣的离子种类的检测，在MS和MS/MS扫描模式之间切换。在质谱仪中利用数据依赖的收集方法可以提供自动的实时决定的能力，以使收集的数据中的有用的信息内容最大化，由此避免或减少对于执行分析物样本的多个色谱运行或注入的需求。由于特定的需要的目的，这些方法可以被调整，例如通过分析从生物样本中获得的缩氨酸的复杂混合物，增强缩氨酸识别的数量。

数据依赖的收集方法的特征在于具有一个或多个输入标准，以及一个或多个输出作用。传统的数据依赖的方法中使用的输入标准通常基于一些参数，例如强度，强度模式，质量窗口，质量差(中性物丢失)，荷质(m/z)包含和排出列表，以及子离子质量。使用输入标准以选择一个或多个满足该标准的离子种类。然后，该选择的离子种类受控于输出作用(输出作用的示例包括执行MS/MS或MSⁿ分析和/或高分辨率扫描)。在典型的数据依赖的试验的一个示例中，一组离子被进行质量分析，质谱强度超过指定阈值的母离子种类被顺序选择为用于MS/MS分析的母离子，其包括隔离，母离子的解离，和子离子的质量分析的操作。

用于分析缩氨酸，蛋白质，和其它生物分子的质谱仪的不断增长地使用使得研究人员开发新的解离技术，这包括脉冲q解离(PQD)和电子转移解离(ETD)，这些技术相对于传统技术来说提供了附加的和/或不同的信息内容。但是，现有技术中描述的数据依赖的收集方法已经极大限制了和单一的传统的解离模式一起使用。虽然现有技术的某些参考文献(参见，例如LeBlanc等，“Unique Scanning Capabilities of a New Hybrid Linear lon TrapMass Spectrometer(Q Trap)Used for High Sensitivity ProteomicsApplications”，Proteomics，vol.3，pP.859-869(2003)已经描述了利用数据依赖的方法自动调整解离参数，例如碰撞能量，但是尚需一种新型的数据依赖的收集方法，其可以和最近研发的先进的解离技术一起使用以更全面的利用用于收集增强的信息内容的机会)。

发明内容

如上所述，根据本发明实施例实现的一种自动的质谱分析方法包括收集从样本中获得的离子的质谱，分析质谱以识别感兴趣的离子种类，通过施加指定的标准从不同的备选解离类型的列表中选择解离类型，其中该指定的标准至少部分基于感兴趣的离子种类的确定的电荷状态，以及用选择的解离类型解离离子种类以产生子离子。备选解离类型的示例包括碰撞活化解离(CAD)，脉冲q解离(PQD)，光解离，电子捕获解离(ECD)，电子转移解离(ETD)，以及跟有补充的碰撞活化或质子传输反应(PTR)中一个或多个阶段的ETD。那么，可以获取子离子的MS/MS质谱。重复该过程一次或多次，以产生更多代的子离子和获取相应的MSⁿ质谱。

在本发明的另一实施例中，设置一种质谱仪，其包括用于从要分析的样本中产生离子的离子源，用于收集离子质谱的质量分析仪，以及解离设备。质量分析仪和解离设备可以集合成一个共同的结构，例如二维离子阱质量分析仪。该质量分析仪和解离设备与控制器通信，该控制器被编程以从质谱中识别感兴趣的离子种类，并且通过应用指定的标准，从备选解离类型的列表中选择恰当的解离类型，其中该指定的标准至少部分基于感兴趣的离子种类的确定的电荷状态。然后控制器命令解离设备利用选择的解离类型对离子种类进行解离以产生子离子。