[发明专利]用于显微系统的图象处理方法

权利要求书

1.用于对使用显微镜系统的荧光杂交样品的荧光原位杂交图象 进行分析的图象处理方法，所述显微镜系统具有荧光激发光源以及电 子成像装置，所述方法包括下列步骤：

使用荧光激发照明照亮所述样品；

调节所述电子成像装置的曝光参数用于在所照亮区域的焦深处捕 获所述样品的图象；

对所捕获的所述样品的图象内的所关注对象进行计数；

鉴定所述图象中的细胞核；

对所述图象中的细胞核进行节段化；

对所述细胞核中出现的荧光信号进行计数和表征；以及

解释和报告结果。

2.权利要求1的方法，其中在不同的焦深重复步骤(b)和(c)。

3.权利要求1的方法，其中调节曝光参数进一步包括：

确定所述样品的一个或者更多个最亮的斑点；

调节曝光参数，以便所述最亮的斑点基本上在所述电子成像装置 的动态范围的最大值处被曝光；

进行曝光以捕获所述图象；

分析所述被捕获图象的较暗部分，以确定是否所述较暗部分中的 细节曝光不足；以及

如果所述图象的较暗部分曝光不足，则提高所述曝光参数；

遮盖亮区域；以及

重复步骤(c)和(d)，直到所述样品的较暗部分被充分成像。

4.权利要求1的方法，其中对所关注的对象进行计数进一步包 括：

在沿着所述杂交的样品的深度间隔的焦平面捕获多幅图象；

将所述所捕获的图象计算转化成由恒定反差等高线表征的强反差 图象；以及

进行计数运算法则，以对所述杂交样品的整个深度的所关注对象 进行计数。

5.权利要求1的方法，其中鉴定细胞核进一步包括：

a)计算每个所关注样品的对平移、旋转和缩放比例恒定形态描述 符；

b)计算每个所关注对象的尺寸分布；以及

c)结合基于经验的模式数据库，将模式识别运算法则用于鉴定和分 类所述所关注对象。

6.权利要求1的方法，其中对细胞核进行节段化进一步包括：

a)以连续的强度间隔计算恒定亮度的等高线，其从局部最大值开始 并朝着低阈值强度水平进行；

b)计算每个所述等高线的平均梯度；以及

c)将每个所述细胞核的边缘限定为对所述细胞核具有最大所述平 均梯度的等高线。

7.权利要求1的方法，其中解释和报告结果进一步包括：

a)形成数学柱状图结构，以便每个库对应细胞核中所包含的所述斑 点量和颜色的可能组合；

b)对每个荧光斑点进行计数，并表征它们各自的颜色；

c)在所述柱状图的所述适当库中记录所述计数的结果；

d)继续所述计数，直到一个所述库中的所述计数对应预定的数目；

e)停止所述计数，并将所述库中的计数与所有其他库中的第二大计 数进行比较；

f)如果所述第二大数目比所述预定数目低预定的百分比，则报告最 大数目库识别符；或者，

g)如果所述第二大数目与所述预定数目相同，或比预定数目大预定 的百分比，则报告为不确定的结果。

8.权利要求1的方法，其中对细胞的细胞核进行表征。

9.权利要求1的方法，其中对染色体进行计数。