[发明专利]突变型DNA聚合酶及相关方法有效
申请号: | 200780038772.2 | 申请日: | 2007-10-18 |
公开(公告)号: | CN101528919A | 公开(公告)日: | 2009-09-09 |
发明(设计)人: | K·A·鲍尔;E·S·史密斯;D·H·盖尔芬德;E·菲斯;S·苏科 | 申请(专利权)人: | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 | 代理人: | 权陆军;付 磊 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 瑞士;CH |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 突变型 dna 聚合 相关 方法 | ||
1.一种DNA聚合酶,其在聚合酶结构域中包含至少下列基 序:
SEQ ID NO:32所示的T-G-R-L-S-S-Xb7-Xb8-P-N-L-Q-N,其中 Xb7是氨基酸S;并且Xb8是氨基酸G,
其中所述DNA聚合酶选自:
(a)CS5DNA聚合酶;
(b)CS6DNA聚合酶;
(c)海栖热袍菌DNA聚合酶;或
SEQ ID NO:32所示的T-G-R-L-S-S-Xb7-Xb8-P-N-L-Q-N,其中 Xb7是氨基酸S;并且Xb8是选自G,T,R,K或L的氨基酸,
其中所述DNA聚合酶是栖热菌种Z05DNA聚合酶;
其中所述CS5DNA聚合酶、所述CS6DNA聚合酶、所述海 栖热袍菌DNA聚合酶和所述栖热菌种Z05DNA聚合酶相对于Xb8是氨基酸D而其他方面相同的DNA聚合酶具有改良的核酸延伸速 率和/或改良的逆转录效率。
2.权利要求1的DNA聚合酶,其中位点Xb8的氨基酸是G。
3.权利要求1的DNA聚合酶,其中所述DNA聚合酶是SEQ ID NO:15的CS5DNA聚合酶或SEQ ID NO:16的CS6DNA聚合 酶,而且第640位氨基酸是G。
4.权利要求1的DNA聚合酶,其中所述DNA聚合酶是SEQ ID NO:6的Z05DNA聚合酶,而且第580位氨基酸选自由G、T、 R、K和L组成的组。
5.权利要求1的DNA聚合酶,其中所述聚合酶包括嵌合的 聚合酶,其中所述嵌合的聚合酶相对于SEQ ID NO:18或SEQ ID NO:19包含一个或更多个选自由下列氨基酸取代组成的组的氨 基酸取代:G46E、L329A、Q601R、D640G、I669F、S671F和 E678G。
6.权利要求1的DNA聚合酶,其进一步包含热可逆共价修 饰。
7.权利要求6的DNA聚合酶,其中所述包含热可逆共价修 饰的聚合酶由热稳定DNA聚合酶和具有选自下列的通式的二羧 酸酐的混合物在碱性pH和低于25℃的温度下进行的反应产生:
(a)式I:
其中R1和R2是氢或有机基团,和
(b)式II:
其中R1和R2是有机基团,且氢是顺式的。
8.权利要求7的DNA聚合酶,其中式I和/或式II中的R1和R2连在一起。
9.编码根据权利要求1的DNA聚合酶的重组核酸。
10.包含权利要求9的重组核酸的表达载体。
11.包含权利要求10的表达载体的宿主细胞。
12.一种生产DNA聚合酶的方法,所述方法包括:在适合编 码DNA聚合酶的核酸表达的条件下培养权利要求11的宿主细胞。
13.一种实施引物延伸的非诊断方法,包括:
在适合引物延伸的条件下使权利要求1的DNA聚合酶与引 物、多核苷酸模板和游离核苷酸相接触,从而产生延伸的引物。
14.权利要求13的方法,其中所述多核苷酸模板是RNA。
15.权利要求14的方法,其中所述适合延伸的条件包含 Mg2+和Mn2+。
16.根据权利要求13的方法,其中所述游离核苷酸包括非常 规核苷酸。
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