[发明专利]分离的假路邓葡萄球菌

说明书

相关申请的对照

这份申请相关于并且主张享有的优先权为美国临时专利申请号60/865,160，所述申请于2006年11月9日递交。 

技术领域

本发明涉及分离的细菌，且特别涉及葡萄球菌属的分离的细菌。 

背景技术

葡萄球菌的物种通常是分离于血液培养菌的，且很多物种被认为是重要的病原体。金黄色葡萄球菌，特别是抗甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA)，是一种有毒的病原体，所述病原体分离于在全世界医院的血液培养菌。(Deresinski，S.(2005)Clin.Infect.Dis.40：562-73.8)。表皮葡萄球菌和其他凝固酵素-阴性(CoNS)通常是正常微生物区系的中的一种，且被认为是在血液培养菌中的时常发生的污染物。由CoNS引起的感染的发生率已经在全世界提升了，但是，使得它在迅速临床介入的及时行为中在潜在的病原的葡萄球菌物种和可能的皮肤污染物之间来识别和辨别渐渐地变得更重要了。 

一种更重要的病原的CoNS葡萄球菌物种是路邓葡萄球菌(Freney，J.等人(1988)Int.J.Svst.Bacteriol.38：168-172)。由于这种有机体的感染的临床表现包括溃疡，髓膜炎，有关(或连接)脑室与腹膜的分流术感染，脊柱炎(spondylodiscitis)，人工关节感染，导尿管-相关的细菌，和心内膜炎(Castro，J.G.，和L.Dowdy(1999)Clin.Infect.Dis.28：681-2；Pareja，J.，等人(1998)Ann.Intern.Med.128：603-4；Patel，R.等人(2000)JL Clin.Microbiol.38：4262-3.)。与路邓葡萄球菌的感染有倾向于具有更多急性的的过程，具有一结果其类似于金黄色葡萄球菌感染而不是那些通常与CoNS相联系的(Seenivasan，M.H.，和V.L.Yu(2003)Eur.J.Clin.Microbiol.Infect.Dis.22：489-91.)。 

本发明提供了一种分离的假路邓(pseudolugdunensis)葡萄球菌的生物学上纯的培养菌，培养菌的一个样品已经被以入藏号PTA-7961存放。本发明也提供了一种分离的多聚核苷酸，所述多聚核苷酸包含SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2的至少大约200个的邻近的残留物；也可以提供一分离的多聚核苷酸，所述多聚核苷酸包含SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2的至少大约300个的邻近的残留物，或分离的多聚核苷酸其包含SEQ ID NO：1或SEQ IDNO：2的至少大约400个的邻近的残留物。在某些具体的实施例中，一分离的多聚核苷酸，所述多聚核苷酸包含SEQ ID NO：1的至少大约200个的邻近的残留物，其可以包含一多聚核苷酸，所述多聚核苷酸包含来自于核苷酸位置660至核苷酸位置858的残余物。本发明中的分离的多聚核苷酸也可以包含那些在适当的严格的条件下与SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2杂交而产生的。 

本发明也提供了一种将假路邓葡萄球菌(pseudolugdunensis)与取自于一临床样本的路邓葡萄球菌分离体进行区别的方法，或用来与一临床的作为假 路邓葡萄球菌的分离菌中识别一未知的细菌菌株，所述方法包含将SEQ IDNO：1的至少200个邻近的碱基对的核苷酸序列与一未知细菌菌株的相应区域的tuf基因序列的核苷酸序列进行比较，如果证明至少大约97％的序列相同，且更佳的为至少大约99％序列相同，与其相应的SEQ ID NO：1至少有大约的200个碱基对一致，则在其中所述的未知的细菌菌株可以被确定为假路邓葡萄球菌。在一本发明的方法的具体实施例中，SEQ ID NO：1至少有大约的200个碱基对包含对应于邻近的序列的核苷酸序列，包括SEQ ID NO：1的核苷酸序列位置为660-858。 

附图说明